1. 發光器官。透過生物冷熒光器官達到傳輸訊號的作用，不同的閃爍方式和光的頻率都會代表不同資訊，這很有可能有誘導配偶的效果，儘管通常是用來引誘食物的。 代表：鮟鱇

2. 高接收率的眼部。很多深海生物發育出巨大的瞳孔來增強對微弱光線的感知，瞳孔後面粗大的視覺神經能蒐集非常微弱的光線並傳給大腦，但科學家們估計這在極深的海洋裡也只能作為輔助感官。 代表：海蛾魚，巨烏賊

3. 側線。許多魚類都有這種器官，位於身體的兩側，好像一對昏暗的條紋。側線可以感知水中的電訊號變化，這些電訊號可能來源於其它生物的心跳或各種神經衝動，在導電率較好的深海水中更為優異。越是捕食性的生物，側線往往就越發達。 代表：姥鯊，盲鰻

4. 聲波。具有完整發生器官的魚類很少，但少數高階物種能利用複雜的聲音訊號交流，聲波也可以作為探測手段來鎖定獵物，就像蝙蝠在黑夜中閉眼也能自由飛行一樣。 代表：抹香鯨

5. 熱源。少數科學家推測有的生物可能有探測深海熱源的能力，它們的眼部可能類似響尾蛇，可以直接把微弱的熱訊號轉化為視覺影象，就像一部紅外線接收器。所有的生物都有新陳代謝，因而不可避免產生熱效應，但寒冷深海中熱量實在散失得太快了，水流的變化也可能導致熱量方位錯亂，所以這個假說還沒被廣泛接受。 代表：巨噬鰻