赤潮是一種複雜的生態異常現象，發生的原因也比較複雜。關於赤潮發生的機理雖然至今尚無定論，但是赤潮發生的首要條件是赤潮生物增殖要達到一定的密度，否則，儘管其他因子都適宜，也不會發生赤潮，在正常的理化環境條件下，赤潮生物在浮游生物中所佔的比重並不大，有些鞭毛蟲類（或者假藻類）還是一些魚蝦的食物。但是由於特殊的環境條件，使某些赤潮生物過量繁殖，便形成赤潮。大多數學者認為，赤潮發生與下列環境因素密切相關
一、海水富營養化是赤潮發生的物質基礎和首要條件
由於城市工業廢水和生活汙水大量排入海中，使營養物質在水體中副集，造成海域富營養化。此時，水域中氮、磷等營養鹽類；鐵、錳等微量元素以及有機化合物的含量大大增加，促進赤潮生物的大量繁殖。赤潮檢測的結果表明，赤潮發生海域的水體均已遭到嚴重汙染，富營養化。氮磷等營養鹽物質大大超標。據研究表明，工業廢水中含有某些金屬可以刺激赤潮生物的增殖。在海水中加入小於3mg/dm的鐵螯合劑和小於2;mg/dm的錳螯合劑，可使赤潮生物卵甲藻和真甲藻達到最高增殖率，相反，在沒有鐵、錳元素的海水中，即使在最適合的溫度、鹽度、PH和基本的營養條件下也不會增加種群的密度。 其次一些有機物質也會促使赤潮生物急劇增殖。如用無機營養鹽培養簡裸甲藻，生長不明顯，但加入酵母提取液時，則生長顯著，加入土壤浸出液和維生素B12時，光亮裸甲藻生長特別好。
二、水文氣象和海水理化因子的變化是赤潮發生的重要原因
海水的溫度是赤潮發生的重要環境因子，20—30℃ 是赤潮發生的適宜溫度範圍。科學家發現一週內水溫突然升高大於2℃ 是赤潮發生的先兆。海水的化學因子如鹽度變化也是促使生物因子—赤潮生物大量繁殖的原因之一。鹽度在26—37的範圍內均有發生赤潮的可能，但是海水鹽度在15—21.6時，容易形成溫躍層和鹽躍層。溫、鹽躍層的存在為赤潮生物的聚集提供了條件，易誘發赤潮。由於徑流、湧升流、水團或海流的交匯作用，使海底層營養鹽上升到水上層，造成沿海水域高度富營養化。營養鹽類含量急劇上升，引起矽藻的大量繁殖。這些矽藻過盛，特別是骨條矽藻的密集常常引起赤潮。這些矽藻類又為夜光藻提供了豐富的餌料，促使夜光藻急劇增殖，從而又形成粉紅色的夜光藻赤潮。據監測資料表明，在赤潮發生時，水域多為乾旱少雨，天氣悶熱，水溫偏高，風力較弱，或者潮流緩慢等水域環境
三、海水養殖的自身汙染亦是誘發赤潮的因素之一
隨著全國沿海養殖業的大發展，尤其是對蝦養殖業的蓬勃發展。也產生了嚴重的自身汙染問題。在對蝦養殖中，人工投餵大量配合飼料和鮮活餌料。由於養殖技術陳舊和不完善，往往造成投餌量偏大，池內殘存餌料增多，嚴重汙染了養殖水質。另一方面，由於蝦池每天需要排換水，所以每天都有大量汙水排入海中，這些帶有大量殘餌、糞便的水中含有氨氮、尿素、尿酸及其它形式的含氮化合物物，加快了海水的富營養化，這樣為赤潮生物提供了適宜的生物環境，使其增殖加快，特別是在高溫、悶熱、無風的條件下最易發生赤潮。由此可見，海水養殖業的自身汙染也使赤潮發生的頻率增加.赤潮發生的原因很多，條件也很複雜。楊積武博士告訴記者，赤潮發生的原因很多，發生的條件也很複雜。當水溫較高、海流緩慢、無風或少風時，在封閉或半封閉的海灣地帶，甲藻、矽藻等赤潮生物最容易爆發性的生長。海水中的營養鹽（主要是氮和磷）以及一些微量元素的大量存在，直接影響著赤潮生物的生長、繁殖和代謝，是赤潮發生的物質基礎。其實從根本上分析，由於海洋汙染而引起的海洋水體富營養化即過剩的氮和磷是赤潮頻頻發生的最直接因素。再進一步分析，這些氮和磷正是來源於人類生產和生活產生的廢水
赤潮是一種複雜的生態異常現象，發生的原因也比較複雜。關於赤潮發生的機理雖然至今尚無定論，但是赤潮發生的首要條件是赤潮生物增殖要達到一定的密度，否則，儘管其他因子都適宜，也不會發生赤潮，在正常的理化環境條件下，赤潮生物在浮游生物中所佔的比重並不大，有些鞭毛蟲類（或者假藻類）還是一些魚蝦的食物。但是由於特殊的環境條件，使某些赤潮生物過量繁殖，便形成赤潮。大多數學者認為，赤潮發生與下列環境因素密切相關
一、海水富營養化是赤潮發生的物質基礎和首要條件
由於城市工業廢水和生活汙水大量排入海中，使營養物質在水體中副集，造成海域富營養化。此時，水域中氮、磷等營養鹽類；鐵、錳等微量元素以及有機化合物的含量大大增加，促進赤潮生物的大量繁殖。赤潮檢測的結果表明，赤潮發生海域的水體均已遭到嚴重汙染，富營養化。氮磷等營養鹽物質大大超標。據研究表明，工業廢水中含有某些金屬可以刺激赤潮生物的增殖。在海水中加入小於3mg/dm的鐵螯合劑和小於2;mg/dm的錳螯合劑，可使赤潮生物卵甲藻和真甲藻達到最高增殖率，相反，在沒有鐵、錳元素的海水中，即使在最適合的溫度、鹽度、PH和基本的營養條件下也不會增加種群的密度。 其次一些有機物質也會促使赤潮生物急劇增殖。如用無機營養鹽培養簡裸甲藻，生長不明顯，但加入酵母提取液時，則生長顯著，加入土壤浸出液和維生素B12時，光亮裸甲藻生長特別好。
二、水文氣象和海水理化因子的變化是赤潮發生的重要原因
海水的溫度是赤潮發生的重要環境因子，20—30℃ 是赤潮發生的適宜溫度範圍。科學家發現一週內水溫突然升高大於2℃ 是赤潮發生的先兆。海水的化學因子如鹽度變化也是促使生物因子—赤潮生物大量繁殖的原因之一。鹽度在26—37的範圍內均有發生赤潮的可能，但是海水鹽度在15—21.6時，容易形成溫躍層和鹽躍層。溫、鹽躍層的存在為赤潮生物的聚集提供了條件，易誘發赤潮。由於徑流、湧升流、水團或海流的交匯作用，使海底層營養鹽上升到水上層，造成沿海水域高度富營養化。營養鹽類含量急劇上升，引起矽藻的大量繁殖。這些矽藻過盛，特別是骨條矽藻的密集常常引起赤潮。這些矽藻類又為夜光藻提供了豐富的餌料，促使夜光藻急劇增殖，從而又形成粉紅色的夜光藻赤潮。據監測資料表明，在赤潮發生時，水域多為乾旱少雨，天氣悶熱，水溫偏高，風力較弱，或者潮流緩慢等水域環境
三、海水養殖的自身汙染亦是誘發赤潮的因素之一
隨著全國沿海養殖業的大發展，尤其是對蝦養殖業的蓬勃發展。也產生了嚴重的自身汙染問題。在對蝦養殖中，人工投餵大量配合飼料和鮮活餌料。由於養殖技術陳舊和不完善，往往造成投餌量偏大，池內殘存餌料增多，嚴重汙染了養殖水質。另一方面，由於蝦池每天需要排換水，所以每天都有大量汙水排入海中，這些帶有大量殘餌、糞便的水中含有氨氮、尿素、尿酸及其它形式的含氮化合物物，加快了海水的富營養化，這樣為赤潮生物提供了適宜的生物環境，使其增殖加快，特別是在高溫、悶熱、無風的條件下最易發生赤潮。由此可見，海水養殖業的自身汙染也使赤潮發生的頻率增加.赤潮發生的原因很多，條件也很複雜。楊積武博士告訴記者，赤潮發生的原因很多，發生的條件也很複雜。當水溫較高、海流緩慢、無風或少風時，在封閉或半封閉的海灣地帶，甲藻、矽藻等赤潮生物最容易爆發性的生長。海水中的營養鹽（主要是氮和磷）以及一些微量元素的大量存在，直接影響著赤潮生物的生長、繁殖和代謝，是赤潮發生的物質基礎。其實從根本上分析，由於海洋汙染而引起的海洋水體富營養化即過剩的氮和磷是赤潮頻頻發生的最直接因素。再進一步分析，這些氮和磷正是來源於人類生產和生活產生的廢水