嚴格科學角度，遺傳物質改變才是可遺傳的變異。後天條件造成的結果，不改變遺傳物質的不會遺傳的。

（當然隨著“表觀遺傳學”的發展，也不是那麼簡單，不過就目前瞭解，你的問題還是適用於經典遺傳學，此處提一下免得抬槓。）

那也就是說，如果明確營養問題造成父親不高，那麼是不會影響兒子身高的了？如果你問的是一道設計的生物題，就為考你知不知道種質和體質的區別，或許就可以這樣答:不影響。

但到實際情況又沒那麼簡單。只能說這個父親大機率不影響兒子，究竟有多大也不好說。

首先身高是複雜的多基因遺傳，不可能只看一個人表型就知道基因型。一個人高，但也不知道他或她攜帶了多少隱性的和身高有關的基因。再加上突變的可能，所以奶奶爺爺都高，也未必生的所有孩子基因就都高。所以儘管父親營養不良，營養不良會影響身高，也不能斷定他變矮僅僅因為後天營養問題。（即使在困難年代，人的平均身高的確受影響，人人都乾瘦乾瘦的，但畢竟還是有高有矮。後天和基因仍然同時有作用）

假如僅僅是人們認為他是營養問題沒長高，但萬一實際上基因也起了作用，那是會影響後代的。

再者每一代的配偶無論高矮，又都增加了複雜性（如上面所說多個相關基因對方攜帶了多少隱性多少顯性多少純合多少雜合）。所以如果實際觀察一些家族幾代人，常常能看到各種波動。