板栗為深根性樹種，土層深厚時其垂直根和水平根都很發達。垂直根系大部分集中在20～60釐米的土層厚度，水平根系一般集中在樹冠投影面積以下，以樹冠邊緣密度最大。通常當地溫達到8.5℃以上時板栗根系開始活動，23～26℃生長最旺，當地溫降到15℃時根系停止活動。但板栗根系活動的時間受氣候影響很大，不同地區及年份，根系活動表現不一。在湖南，板栗根系3月上旬開始活動，一年有三個生長高峰期，第一生長高峰期在一次枝條結束生長、二次枝迅速生長前，成年慄樹根系第一生長高峰一般在6月下旬到7月中旬；根系第二生長高峰期在二次枝結束生長後的8月上中旬；根系第三生長高峰期在果實採收後的10月份。在河北昌黎，根系4月上旬開始活動，7月下旬以後吸收根大量發生，8月下旬達到高峰期，以後逐漸下降，到12月下旬根系進入休眠期。 板栗根部受到損傷後癒合和再生能力較差，傷根後需較長時間方能發出新根，且樹齡越大，傷根越粗，癒合越慢，髮根越晚。據觀察早春移栽樹3～5毫米的細根受傷後，直到初夏才能發出新根，而5～15毫米的粗根大多數未發出新根，或生長甚微。故出圃移栽或深翻時切忌傷根過多，以免影響苗木對水分、養分的吸收。 板栗根系可與20餘種真菌共生形成外生菌根。菌根能使根系表皮細胞顯著增大，增強根系吸收能力，擴大吸收面積。菌根的分泌物可以溶解土壤中的難溶養分，吸收根系無法吸收到的難溶物質，增強板栗的抗旱和耐瘠薄能力。菌根形成期與慄根活動期相適應，在慄根發生新根後開始形成，慄根停止生長前結束，7～8月菌根的發生達到高峰。具有菌根的板栗幼苗根系發達，能形成良好的共生菌根結構，表現在鬚根多，根系發達，抗旱能力增強，乾旱時萎蔫出現晚，這對山地板慄幼樹的定植大有益處，尤其對春季栽植和移栽具有很大的生產意義。