與以往的註冊管理制度相比，《辦法》依據新食品安全法，對保健食品實行註冊與備案相結合的分類管理制度。
對使用保健食品原料目錄以外原料的保健食品和首次進口的保健食品實行註冊管理。
對使用的原料已經列入保健食品原料目錄的和首次進口的屬於補充維生素、礦物質等營養物質的保健食品實行備案管理。首次進口屬於補充維生素、礦物質等營養物質的保健食品，其營養物質應當是列入保健食品原料目錄的物質。
產品聲稱的保健功能應當已經列入保健食品功能目錄。保健食品原料目錄和允許保健食品聲稱的保健功能目錄由總局會同國務院衛生行政部門、國家中醫藥管理部門制定、調整和公佈，相關配套管理辦法另行制定。
十、《辦法》對保健食品的註冊程式有哪些重要調整？
《辦法》規定，保健食品註冊申請由總局受理機構承擔。以受理為註冊審批起點，將生產現場核查和複核檢驗調整至技術審評環節，並對審評內容、審評程式、總體時限和判定依據等提出具體嚴格的限定和要求。
技術審評按申請材料核查、現場核查、動態抽樣、複核檢驗等程式開展，任一環節不符合要求，審評機構均可終止審評，提出不予註冊建議。
十一、《辦法》對保健食品技術審評補充資料的要求有什麼調整？
審評機構認為需要註冊申請人補正材料的，應當一次告知需要補正的全部內容。註冊申請人應當在3個月內按照補正通知的要求一次提供補充材料。註冊申請人逾期未提交補充材料或者未完成補正的，不足以證明產品安全性、保健功能和質量可控性的，審評機構應當終止審評，提出不予註冊的建議。
十二、《辦法》對保健食品技術轉讓程式有什麼調整？
保健食品註冊人轉讓技術的，受讓方應當在轉讓方的指導下重新提出產品註冊申請。產品技術要求等應當與原申請材料一致。審評機構按照相關規定簡化審評程式。
十三、《辦法》規定的保健食品備案管理重點內容有哪些？
食品藥品監督管理部門收到備案材料後，備案材料符合要求的，當場備案；不符合要求的，應當一次告知備案人補正相關材料。
食品藥品監督管理部門應當完成備案資訊的存檔備查工作，併發放備案號。
對備案的保健食品，食品藥品監督管理部門應當按照相關要求的格式製作備案憑證，並將備案資訊表中登載的資訊在其網站上予以公佈。
獲得註冊的保健食品原料已經列入保健食品原料目錄，並符合相關技術要求的，保健食品註冊人申請變更註冊，或者期滿申請延續註冊的，應當按照備案程式辦理。
十四、《辦法》規定的註冊申請人的資質要求主要有哪些？
中國產保健食品註冊申請人應當是在中國境內登記的法人或者其他組織；進口保健食品註冊申請人應當是上市保健食品的境外生產廠商。申請進口保健食品註冊的，應當由其常駐中國代表機構或者由其委託中國境內的代理機構辦理。
保健食品註冊證書及其附件所載明內容變更的，應當由保健食品註冊人申請變更。註冊人名稱變更的，應當由變更後的註冊申請人申請變更。
保健食品註冊證書有效期屆滿申請延續的，應當是已經生產銷售的保健食品，並提供人群食用情況分析報告以及生產質量管理體系執行情況自查報告等。
十五、《辦法》對備案人的資質要求主要有哪些？
中國產保健食品的備案人應當是保健食品生產企業，原註冊人可以作為備案人；進口保健食品的備案人，應當是上市保健食品境外生產廠商。
十六、《辦法》實施的重點配套工作是什麼？
依據新修訂的《食品安全法》，保健食品原料目錄和允許保健食品聲稱的保健功能目錄是實行保健食品註冊和備案管理的必要條件和前提基礎。當前，總局正在會同國務院衛生行政部門、國家中醫藥管理部門制定相關管理辦法及配套目錄，力爭早日出臺。
十七、《辦法》實施後對現有保健食品註冊申請和批准註冊產品將採取哪些措施？
《辦法》實施後，我局將按照新的規定開展審評工作。對現有已批准註冊的保健食品，採取分期分批、依法合規、穩步推進的原則開展清理換證工作。透過清理換證，使新老產品審評標準保持一致。清理換證方案另行規定。
十八、《辦法》中關於保健食品命名的規定怎麼執行？
《辦法》對保健食品命名作出了明確規定，這些規定是在廣泛徵求企業、行業組織、基層監管部門以及專家意見的基礎上形成的，並且已於2015年8月在國務院法制辦網站公開徵求意見。2015年8月25日總局釋出了《關於進一步規範保健食品命名有關事項的公告》，明確總局不再批准以含有表述產品功能相關文字命名的保健食品，並要求已批准註冊的相關產品按照有關規定變更產品名稱。考慮到已上市保健食品名稱市場認知度問題，總局近期釋出了《關於保健食品命名有關事項的公告》，給生產企業一定的過渡期，允許標註新產品名稱的同時標註原產品名稱。目前，總局正在進一步研究保健食品命名問題，透過制定保健食品命名指南以及審評細則，規範保健食品命名以及技術審評等監管工作。
與以往的註冊管理制度相比，《辦法》依據新食品安全法，對保健食品實行註冊與備案相結合的分類管理制度。
對使用保健食品原料目錄以外原料的保健食品和首次進口的保健食品實行註冊管理。
對使用的原料已經列入保健食品原料目錄的和首次進口的屬於補充維生素、礦物質等營養物質的保健食品實行備案管理。首次進口屬於補充維生素、礦物質等營養物質的保健食品，其營養物質應當是列入保健食品原料目錄的物質。
產品聲稱的保健功能應當已經列入保健食品功能目錄。保健食品原料目錄和允許保健食品聲稱的保健功能目錄由總局會同國務院衛生行政部門、國家中醫藥管理部門制定、調整和公佈，相關配套管理辦法另行制定。
十、《辦法》對保健食品的註冊程式有哪些重要調整？
《辦法》規定，保健食品註冊申請由總局受理機構承擔。以受理為註冊審批起點，將生產現場核查和複核檢驗調整至技術審評環節，並對審評內容、審評程式、總體時限和判定依據等提出具體嚴格的限定和要求。
技術審評按申請材料核查、現場核查、動態抽樣、複核檢驗等程式開展，任一環節不符合要求，審評機構均可終止審評，提出不予註冊建議。
十一、《辦法》對保健食品技術審評補充資料的要求有什麼調整？
審評機構認為需要註冊申請人補正材料的，應當一次告知需要補正的全部內容。註冊申請人應當在3個月內按照補正通知的要求一次提供補充材料。註冊申請人逾期未提交補充材料或者未完成補正的，不足以證明產品安全性、保健功能和質量可控性的，審評機構應當終止審評，提出不予註冊的建議。
十二、《辦法》對保健食品技術轉讓程式有什麼調整？
保健食品註冊人轉讓技術的，受讓方應當在轉讓方的指導下重新提出產品註冊申請。產品技術要求等應當與原申請材料一致。審評機構按照相關規定簡化審評程式。
十三、《辦法》規定的保健食品備案管理重點內容有哪些？
食品藥品監督管理部門收到備案材料後，備案材料符合要求的，當場備案；不符合要求的，應當一次告知備案人補正相關材料。
食品藥品監督管理部門應當完成備案資訊的存檔備查工作，併發放備案號。
對備案的保健食品，食品藥品監督管理部門應當按照相關要求的格式製作備案憑證，並將備案資訊表中登載的資訊在其網站上予以公佈。
獲得註冊的保健食品原料已經列入保健食品原料目錄，並符合相關技術要求的，保健食品註冊人申請變更註冊，或者期滿申請延續註冊的，應當按照備案程式辦理。
十四、《辦法》規定的註冊申請人的資質要求主要有哪些？
中國產保健食品註冊申請人應當是在中國境內登記的法人或者其他組織；進口保健食品註冊申請人應當是上市保健食品的境外生產廠商。申請進口保健食品註冊的，應當由其常駐中國代表機構或者由其委託中國境內的代理機構辦理。
保健食品註冊證書及其附件所載明內容變更的，應當由保健食品註冊人申請變更。註冊人名稱變更的，應當由變更後的註冊申請人申請變更。
保健食品註冊證書有效期屆滿申請延續的，應當是已經生產銷售的保健食品，並提供人群食用情況分析報告以及生產質量管理體系執行情況自查報告等。
十五、《辦法》對備案人的資質要求主要有哪些？
中國產保健食品的備案人應當是保健食品生產企業，原註冊人可以作為備案人；進口保健食品的備案人，應當是上市保健食品境外生產廠商。
十六、《辦法》實施的重點配套工作是什麼？
依據新修訂的《食品安全法》，保健食品原料目錄和允許保健食品聲稱的保健功能目錄是實行保健食品註冊和備案管理的必要條件和前提基礎。當前，總局正在會同國務院衛生行政部門、國家中醫藥管理部門制定相關管理辦法及配套目錄，力爭早日出臺。
十七、《辦法》實施後對現有保健食品註冊申請和批准註冊產品將採取哪些措施？
《辦法》實施後，我局將按照新的規定開展審評工作。對現有已批准註冊的保健食品，採取分期分批、依法合規、穩步推進的原則開展清理換證工作。透過清理換證，使新老產品審評標準保持一致。清理換證方案另行規定。
十八、《辦法》中關於保健食品命名的規定怎麼執行？
《辦法》對保健食品命名作出了明確規定，這些規定是在廣泛徵求企業、行業組織、基層監管部門以及專家意見的基礎上形成的，並且已於2015年8月在國務院法制辦網站公開徵求意見。2015年8月25日總局釋出了《關於進一步規範保健食品命名有關事項的公告》，明確總局不再批准以含有表述產品功能相關文字命名的保健食品，並要求已批准註冊的相關產品按照有關規定變更產品名稱。考慮到已上市保健食品名稱市場認知度問題，總局近期釋出了《關於保健食品命名有關事項的公告》，給生產企業一定的過渡期，允許標註新產品名稱的同時標註原產品名稱。目前，總局正在進一步研究保健食品命名問題，透過制定保健食品命名指南以及審評細則，規範保健食品命名以及技術審評等監管工作。