根據《中央編辦關於國家衛生健康委所屬事業單位機構編制的批覆》（中央編辦復字〔2018〕90號），設立國家食品安全風險評估中心，為國家衛生健康委直屬事業單位。主要職責為：

（一）開展食品安全風險監測、風險評估、標準管理等相關工作，為政府制定相關的法律、法規、部門規章和技術規範等提供技術諮詢及政策建議。

（二）擬訂國家食品安全風險監測計劃；開展食品安全風險監測工作，按規定報送監測資料和分析結果。

（三）擬訂食品安全風險評估技術規範；承擔食品安全風險評估相關工作，對食品、食品新增劑、食品相關產品中生物性、化學性和物理性危害因素進行風險評估，向國家衛生健康委報告食品安全風險評估結果等資訊。

（四）開展食品安全相關科學研究、成果轉化、檢測服務、資訊化建設、技術培訓和科普宣教工作。

（五）承擔食品安全風險監測、評估、標準、營養等資訊的風險交流工作。

（六）承擔食品安全標準的技術管理工作；承擔國民營養計劃實施的技術支援工作。

（七）開展食品安全風險評估領域的國際合作與交流。

（八）承擔國家食品安全風險評估專家委員會、食品安全國家標準審評委員會等機構秘書處工作。

（九）承辦國家衛生健康委交辦的其他事項。