1、不耐髒

矽藻泥大多是淡雅的色調，在有小孩的家庭裡很容易留下小孩玩耍的手印腳印什麼的各種汙跡，雖然網上有說用橡皮擦可以擦掉，但也有很多網友反映這方法並不見效。

2、不能擦洗

瓷磚或者很多牆面漆都是防水的，家裡牆壁髒了，可以用溼抹布直接擦拭，但是矽藻泥本身的結構是奈米的蜂窩狀結構，他的吸附性要比活性炭高300倍，一旦用水擦拭可能就會直接吸附到分子結構中去，起不到清潔的作用。另外矽藻泥是“泥”，由於天性也是不能用水擦洗的，一旦牆面弄髒不能選擇用水擦洗。

3、不防水

矽藻泥由於其自身結構吸水性很強，但不防水，不能用於過於潮溼的地方，比如廚房衛生間這些地方容易潮溼不能使用矽藻泥裝修，這時矽藻泥裝修的侷限性。

4、要經常清理

矽藻泥本身能夠吸附和分解空氣中的灰塵等有害物質，如果長時間不進行清理，會把牆壁的顏色改變，令家居環境變得骯髒不堪，所以矽藻泥牆壁要經常清理。

5、手感不佳

矽藻泥摸起來是比較粗糙，凹凸不平的，並沒有油漆的光滑細膩，對於喜歡牆面摸起來光滑手感的人來說，矽藻泥就略顯劣勢。

6、花色不夠豐富

與桌布豐富的花色、活躍的色彩、多變的造型相比，矽藻泥肌理圖案較為單調，不夠豐富。

7、硬度不好

矽藻泥畢竟是“泥”，其硬度與瓷磚等根本無法相比較，據網友反映用質量不好的矽藻泥被碰撞後還會碎成一塊一塊的掉下來。