首先，這個構造會影響飛機降落。起飛或許可以從“大門”彈射，但降落時是不可能精確的鑽入“大門”的。飛機降落時的著艦點是一個有一定容錯率的前後變化的區域，勾住三道阻攔索的任意一道就可以安全降落。所以這個區域必須是敞開的。只有科幻電影裡才有那種從機庫門飛進飛出的操作精度，現實裡是不可能的。其次，這個封閉構造要增加非常大的結構重量，總重增加而且重心升高穩定下降。再有，會給損管造成很大阻礙。通常情況下，艦載機儘量避免在機庫內加掛彈藥，這是因為一旦發生火災事故，甲板上的掛滿彈藥加滿油料的起火的飛機可以直接推到船舷拋入大海，在機庫或題主設想的封閉空間裡就不行了。這不是杞人憂天，現實中美軍航母不止一次發生彈藥誤射等原因導致的甲板大規模火災。所以美軍規定不允許在機庫裡裝載彈藥，如果不得已確需在機庫裡掛載的，特事特辦，需要艦長親自批准才行，具體操作也需要加十二分小心。最後，即便把甲板封閉，其隱身效果也是非常有限的。目前的大部分所謂隱身戰艦，只是上層建築採用了部分隱身設計，降低了被發現的機率，但降低的程度遠不如隱身戰機。比較徹底的大型隱身戰艦隻有朱姆沃爾特級驅逐艦。航母即便封閉了甲板，其巨大的垂直船舷和外飄甲板也不可能隱身。而且目前的垂直船舷加外飄甲板是唯一可行的方案，如果航母像朱姆沃爾特一樣全內傾，空間不足；全外傾則穩性不足。 綜上所述，題主的設想是不現實的。

在現代航空母艦的發展歷史上，日本絕對算得上是先列，因為在二戰爆發前，日本已經制造和服役了許多質量一流，規模浩大的航空母艦部隊，這支部隊在發揮對往外擴張中起到了不可替代的作用，可以說為日本帝國主義擴張而東征西討，建立殖民地起到了汗馬功勞。

海軍假日期間，各國海軍放緩了對大型主力艦的發展，海軍強國都已經把目光放到了新式武器航空母艦上，這種利用艦載戰鬥機為主要作戰手段的新式作戰平臺自誕生之初就顯示出其對舊有武器系統的巨大威脅性，有識之士都看到了航母作為一種未來武器的作戰能力。

倫敦海軍條約使得原本八八艦隊打算髮展出新式戰列巡洋艦天城級和長門改進型都不得不停工，於是改裝為大型航空母艦。原計劃天城級戰巡二號艦赤城於1925年在吳海軍工廠下水，該航母奇特的外形與早期航母暴怒號類似，具有三層機庫，三層飛行甲板結構。這種奇特的三段式飛行甲板是日本人獨創

作為三段式航空母艦，赤城號與其姊妹艦加賀號的外形類似。日本人為什麼會突發奇想進行這種復古設計不得而知，但這與當時海戰形式和艦載機發展情況是密不可分的。當時包括主力艦，巡洋艦為主的打擊力量仍然沒有完全被艦隊航母取代，三段式航母在保留一定武備的情況下具備獨立起降戰機的功能。

但是三段式航母的實際效果是很不理想的，第一，複雜的結構讓艦體重心過高，造成試航性不好。30年代後艦載戰機效能的進步已經難以在三段式航母上起飛，並且複雜的飛行甲板讓維護工作非常難，後來的實踐表明，三段式甲板不僅作用有限，並且已經不適應未來戰場，所以對於赤城號和加賀號的現代化改裝也於30年代動工。

航母外形趨於現代化的發展過程就是其正統地位確立的過程，當艦隊航母成為海軍核心主力的時候，其外形已經趨於常規化，大型直通斜角甲板正式成為現代航母的標準配置。

“把飛機放到船腹中就是隱身航母了？”在軍事術語中的“隱身”並不是肉眼完全看不見，而是雷達波探測不到，雷達沒有發現目標，那麼就相當於物體隱身了。但是人眼還是看得見的，今天所說的隱身設計都是針對雷達波來說的。而航母幾萬噸的船隱身沒有必要，因為航母的作戰核心是艦載機，而不是航母本身。英國暴怒級雙段甲板航母

在早期航母建設的探索中，英國和日本都曾經探索過雙層甲板以及三層甲板的建造，英國暴怒號改裝的航母就擁有兩層甲板，日本則這一個設計發揚光大，改成三層甲板，分為上中下三層甲板，對應的有上層中層，下層三層機庫，最上層的甲板最長主要負責接收所有戰機的起降，同時也可以提供負重較重的艦攻擊起飛，而下層甲板則是負責起飛比較大的飛機。這樣的上面負責降落下面負責起飛設計看起來很美好，但是帶來的問題卻很多。1924年設計的赤城號航母擁有三段甲板，後來中層甲板被艦炮佔據

先不說重心問題，三層飛行甲板，大大的擠壓的機庫的空間。且中層甲板被兩座雙聯裝主炮佔據，這就導致了艦載機起飛與降落場所各自分離的初始設計告吹。這樣就導致了赤城號的最初設計載機量只有60架，最高能帶75架。同時期的美國列剋星敦級設計的艦載機數量為72架，而在實際的裝載中卻能超過100架。而在後期尺寸更大、質量和速度更大的單翼全金屬艦載機必然取代舊式多翼機，而新型的艦載機起飛不可能依靠滑行起飛平臺起飛。所以赤城和加賀在後期改裝中就回到了艏艉直通式指甲板，一點美國比日本擁有先見之明。而且多層飛行甲板機庫，人為複雜化的內部結構導致其指揮排程非常困難。在後期改裝中又回到了艏艉直通式甲板