在溼法煙氣脫硫中，裝置常常發生結垢和堵塞。裝置結垢和堵塞，已成為一些吸收裝置能否正常長期執行的關鍵問題。為此，首先要弄清楚結構的機理，影響結構和造成堵塞的因素，然後有針對性地從工藝設計、裝置結構、操作控制等方面著手解決。
一些常見的防止結垢和堵塞的方法有：在工藝操作上，控制吸收液中水份蒸發速度和蒸發量；控制溶液的PH值；控制溶液中易於結晶的物質不要過飽和；保持溶液有一定的晶種；嚴格除塵，控制煙氣進入吸收系統所帶入的煙塵量，裝置結構要作特殊設計，或選用不易結垢和堵塞的吸收裝置，例如流動床洗滌塔比固定填充洗滌塔不易結垢和堵塞；選擇表面光滑、不易腐蝕的材料製作吸收裝置。
脫硫系統的結構和堵塞，可造成吸收塔、氧化槽、管道、噴嘴、除霧器設定熱交換器結垢和堵塞。其原因是煙氣中的氧氣將CaSO3氧化成為CaSO4（石膏），並使石膏過飽和。這種現象主要發生在自然氧化的溼法系統中，控制措施為強制氧化和抑制氧化。 強制氧化系統透過向氧化槽內鼓入壓縮空氣，幾乎將全部CaSO3氧化成CaSO4，並保持足夠的漿液含固量（大於12%），以提高石膏結晶所需要的晶種。此時，石膏晶體的生長佔優勢，可有效控制結垢。
抑制氧化系統採用氧化抑制劑，如單質硫，乙二胺四乙酸（EDTA）及其混合物。新增單質硫可產生硫代硫酸根離子，與亞硫酸根自由基反應，從而干擾氧化反應。EDTA則透過與過渡金屬生成螯合物和亞硫酸根反應而抑制氧化反應。（5）腐蝕及磨損
煤炭燃燒時除生成SO2以外，還生成少量的SO3，煙氣中SO3的濃度為10~40ppm。由於煙氣中含有水（4%~12%），生成的SO3瞬間內形成硫酸霧。當溫度較低時，硫酸霧凝結成硫酸附著在裝置的內壁上，或溶解於洗滌液中。這就是溼法吸收塔及有關裝置腐蝕相當嚴重的主要原因。解決方法主要有：採用耐腐蝕材料製作吸收塔，如採用不鏽鋼、環氧玻璃鋼、硬聚氯乙烯、陶瓷等製作吸收塔及有關裝置；裝置內壁塗敷防腐材料，如塗敷水玻璃等；裝置內襯橡膠等。
含有煙塵的煙氣高速穿過裝置及管道，在吸收塔內同吸收液湍流攪動接觸，裝置磨損相當嚴重。解決的主要方法有：採用合理的工藝過程設計，如煙氣進入吸收塔前要進行高效除塵，以減少高速流動煙塵對裝置的磨損；採用耐磨材料製作吸收塔及其有關裝置，以及裝置內 壁內襯或塗敷耐磨損材料。近年來，中國燃煤工業鍋爐及窯爐煙氣脫硫技術中，吸收塔的防腐及耐磨損已取得顯著進展，致使煙氣脫硫裝置的運轉率大大提高。
吸收塔、煙道的材質、內襯或塗層均影響裝置的使用壽命和成本。吸收塔體可用高（或低）合金鋼、碳鋼、碳鋼內襯橡膠、碳鋼內襯有機樹脂或玻璃鋼。美國因勞動力昂貴，一般採用合金鋼。德國普遍採用碳鋼內襯橡膠（溴橡膠或氯丁橡膠），使用壽命可達10年。腐蝕特別嚴重的如漿池底和噴霧區，採用雙層襯膠，可延長壽命25%。ABB早期用C-276合金鋼製作吸收塔，單位成本為63[wiki]美元[/wiki]/KW，現採用內襯橡膠，成本為22美元/KW。煙道應用碳鋼製作時，採用何種防腐措施取決於煙氣溫度（是否在酸性[wiki]露點[/wiki]或水蒸汽飽和溫度以上）及其成分（尤其是SO2和H2O含量）。
在溼法煙氣脫硫中，裝置常常發生結垢和堵塞。裝置結垢和堵塞，已成為一些吸收裝置能否正常長期執行的關鍵問題。為此，首先要弄清楚結構的機理，影響結構和造成堵塞的因素，然後有針對性地從工藝設計、裝置結構、操作控制等方面著手解決。
一些常見的防止結垢和堵塞的方法有：在工藝操作上，控制吸收液中水份蒸發速度和蒸發量；控制溶液的PH值；控制溶液中易於結晶的物質不要過飽和；保持溶液有一定的晶種；嚴格除塵，控制煙氣進入吸收系統所帶入的煙塵量，裝置結構要作特殊設計，或選用不易結垢和堵塞的吸收裝置，例如流動床洗滌塔比固定填充洗滌塔不易結垢和堵塞；選擇表面光滑、不易腐蝕的材料製作吸收裝置。
脫硫系統的結構和堵塞，可造成吸收塔、氧化槽、管道、噴嘴、除霧器設定熱交換器結垢和堵塞。其原因是煙氣中的氧氣將CaSO3氧化成為CaSO4（石膏），並使石膏過飽和。這種現象主要發生在自然氧化的溼法系統中，控制措施為強制氧化和抑制氧化。 強制氧化系統透過向氧化槽內鼓入壓縮空氣，幾乎將全部CaSO3氧化成CaSO4，並保持足夠的漿液含固量（大於12%），以提高石膏結晶所需要的晶種。此時，石膏晶體的生長佔優勢，可有效控制結垢。
抑制氧化系統採用氧化抑制劑，如單質硫，乙二胺四乙酸（EDTA）及其混合物。新增單質硫可產生硫代硫酸根離子，與亞硫酸根自由基反應，從而干擾氧化反應。EDTA則透過與過渡金屬生成螯合物和亞硫酸根反應而抑制氧化反應。（5）腐蝕及磨損
煤炭燃燒時除生成SO2以外，還生成少量的SO3，煙氣中SO3的濃度為10~40ppm。由於煙氣中含有水（4%~12%），生成的SO3瞬間內形成硫酸霧。當溫度較低時，硫酸霧凝結成硫酸附著在裝置的內壁上，或溶解於洗滌液中。這就是溼法吸收塔及有關裝置腐蝕相當嚴重的主要原因。解決方法主要有：採用耐腐蝕材料製作吸收塔，如採用不鏽鋼、環氧玻璃鋼、硬聚氯乙烯、陶瓷等製作吸收塔及有關裝置；裝置內壁塗敷防腐材料，如塗敷水玻璃等；裝置內襯橡膠等。
含有煙塵的煙氣高速穿過裝置及管道，在吸收塔內同吸收液湍流攪動接觸，裝置磨損相當嚴重。解決的主要方法有：採用合理的工藝過程設計，如煙氣進入吸收塔前要進行高效除塵，以減少高速流動煙塵對裝置的磨損；採用耐磨材料製作吸收塔及其有關裝置，以及裝置內 壁內襯或塗敷耐磨損材料。近年來，中國燃煤工業鍋爐及窯爐煙氣脫硫技術中，吸收塔的防腐及耐磨損已取得顯著進展，致使煙氣脫硫裝置的運轉率大大提高。
吸收塔、煙道的材質、內襯或塗層均影響裝置的使用壽命和成本。吸收塔體可用高（或低）合金鋼、碳鋼、碳鋼內襯橡膠、碳鋼內襯有機樹脂或玻璃鋼。美國因勞動力昂貴，一般採用合金鋼。德國普遍採用碳鋼內襯橡膠（溴橡膠或氯丁橡膠），使用壽命可達10年。腐蝕特別嚴重的如漿池底和噴霧區，採用雙層襯膠，可延長壽命25%。ABB早期用C-276合金鋼製作吸收塔，單位成本為63[wiki]美元[/wiki]/KW，現採用內襯橡膠，成本為22美元/KW。煙道應用碳鋼製作時，採用何種防腐措施取決於煙氣溫度（是否在酸性[wiki]露點[/wiki]或水蒸汽飽和溫度以上）及其成分（尤其是SO2和H2O含量）。