太廟的主體建築為後前殿、中殿、後殿,前殿是三大殿中的主殿,這裡是皇帝舉行大祀之處。　　前殿,始建於明代,明末清初被毀得只剩有中間三間和殿柱。順治年間重修太廟大殿,完工後的大殿十一楹,深四楹,重簷列脊,殿額有滿漢文對照的"太廟"。殿外的三重臺基用漢白玉石欄環繞,月臺御道正面依次刻有龍文石、獅紋石和海獸石。殿內的大梁為沉香木,其餘用金絲榆木；地鋪"金磚"；天花板及四柱,均貼有赤金葉。殿內供奉木製金漆的神座,帝座雕龍,後座雕風。座前陳放有供品、香案和銅爐等。兩側的配殿設皇族和功臣的牌位。　　中殿,寬九楹,深四楹,透過石露臺連線前殿,殿外的石階下左右各有二個石燈。殿內正中室供太祖,其餘各祖分供於各夾室。神龕之外陳列著與神牌數目相同的帝后神椅,對於皇后的祭祀,明代僅供原配,清代兼祀繼配。又名中殿,供奉皇帝祖先牌位的地方。始建於明永樂十八年(1420年),黃琉璃瓦單簷廡殿頂。面闊九間(),進深四間(),殿內祖宗牌位同堂異室。各夾室內陳設神椅、香案、床榻、褥枕等物,牌位立於褥上,象徵祖宗起居安寢。清未供奉努爾哈赤、皇太極、福臨、玄燁、胤縝、弘曆等十一代帝后的牌位。每逢祭典前一天,將牌位移至享殿安放,祭畢奉回。　　後殿,四周圍以紅牆,有門五楹,殿九楹。殿外石階中刻龍紋石,殿內供清朝立國前被追封的帝后神牌。