1、落葉不同：牡丹屬於落葉小灌木或亞灌木，高度大多在2米以下；而野牡丹則屬於常綠小灌木，有的品種可高達3-5米，甚至7米。

2、植株不同：牡丹的根圓柱形或具紡錘形的塊根，當年生分枝基部或莖基部具數枚鱗片；而野牡丹的莖四稜形或近圓形，通常被毛或鱗片狀糙伏毛。

3、葉片不同：牡丹的葉通常為二回三出複葉，小葉片不裂而全緣或分裂、裂片常全緣；野牡丹葉對生，被毛，全緣，具葉柄。

4、花朵不同：牡丹單花或數朵頂生或莖上部葉腋，花朵碩大，直徑都在4釐米以上，萼片3-5，花瓣有單瓣重瓣等多種；野牡丹花單生或組成圓錐花序頂生或生於分枝頂端，花瓣5，花朵較小。

5、花色不同：牡丹由於栽培歷史久遠，園藝品種繁多，因而花色極為豐富；而野牡丹由於很少園藝栽培，雜交品種少，因而花色大多為淡紅色、紫紅色至紅色。

6、花果期不同：牡丹花期4月~5月，果期6月；野牡丹花期5-7月，果期10-12月（品種不同花果期不同）。

7、分佈不同：牡丹野生主要分佈在甘肅、陝西、山西、河南、安徽、湖北、四川、雲南、西藏等9個省區；而野牡丹屬主要分佈在長江流域以南，其中野牡丹主產雲南、廣西、廣東、福建、臺灣。