佛珠的數目在經典當中的差異很大，共有九種之多。其實，佛珠有不同的顆數，是因為具有著不同的含義，下面就根據普遍流傳的說法，將其不同的含義略述如後：

　　(一)一百零八顆：是最為常見的數目，是為了表示求證百八三昧，而斷除一百零八種煩惱，從而使身心能達到一種寂靜的狀態。百八煩惱的內容，有多種不同的說法，總的來說，六根各有苦、樂、舍三受，合為十八種;又六根各有好、惡、平三種，合為十八種，計三十六種，再配以過去、現在、未來三世，合為一百零八種煩惱，如經中所言：

　　諸菩薩問：云何百八?佛言：有所念不自知心生心滅中，有陰有集，不知為痴，轉入意地亦如是，識亦如是，是為意三;見好色中色惡色，不自知著不自知滅，有陰有集，乃至觸亦如是;彼經但列六根各六，雖無三世之語，而結雲百八，故知是約剎那而為三世也。……三世三個三十六故，故有百八。

　　(二)一千零八十顆：表示十界各有一百零八種煩惱，合成一千零八十種煩惱， “十界”表示整個迷與悟的世界，可分為十個種類：(1)地獄界，(2)餓鬼界，(3)畜生界，(4)修羅界，(5)人間界，(6)天上界，(7)聲聞界，(8)緣覺界，(9)菩薩界，(10)佛界。

　　(三)五十四顆：表示菩薩修行過程中的五十四個位次，其中包括十信、十住、十行、十回向、十地五十階位，再加上四善根位。