複合水溶肥生產成本一般要高於等養分的常規復合肥，要求各種原料都是全水溶性的，因此材料比較貴些。液體水溶肥的生產環節雖然少於常規復合肥，但其儲存、運輸和施用都需要專門化的裝置，成本也較高。例如，為了防止低溫季節溶液冷卻時可能產生結晶與沉澱，液體肥貯存和運輸需要先進的、費用高的裝置。所以水溶肥價格普遍要高於等養分大化肥產品。在農田應用上，這類肥料的施用途徑與大化肥不盡相同，一般都是與灌水相結合，透過不同灌溉方式將肥料和灌溉水一體化施到根圍土壤或作物葉面。根據灌水方式的不同，施肥又可分為衝施肥、噴施肥、滴灌肥等。固態水溶肥的施用，先溶解並配成混合溶液，再進行灌施或噴施。液體水溶肥需裝備有管道、貯罐、施肥機等配套裝置，肥料很易溶入灌溉水中，既可噴灌和滴灌，也可兌水稀釋後直接作葉面肥噴施。水溶肥的優點：其一，採用水、肥同施，以水帶肥，實現了水肥一體化，施肥效率高，並可以減少施肥總量，發揮肥水協同效應，使肥和水的利用效率都明顯提高。其二，肥效快，可解決高產作物快速生長期的營養需求。水溶肥的缺點：其一，水溶肥料價格普遍較高，不利於普及。其二，速效性強，難以在土壤中長期儲存。用肥量要嚴格控制，如果單次使用稍多，就會造成肥料流失，既降低施肥的經濟效益，達不到高產優質高效的目的，還會造成水環境的汙染，不利於可持續發展。總之，從中國產業發展程度看，相關產品的研究和開發都還很不夠。例如，尚未大批次開發和生產隨灌溉水施用的液體肥料。在應用方面，水溶肥的施用關鍵要掌握適時適量水肥結合的原則，而目前業內對不同栽培制度下的灌溉施肥技術和主要作物生長過程中的營養需求規律，合適的施肥時期、施肥數量等研究都較少。從市場營銷現狀看，有的企業為了促銷，將水溶肥產品效能和適用範圍盲目擴大或作片面宣傳，這對於消費者會起誤導作用。例如，在 完全水溶硫酸鉀 的使用說明中，將追肥衝施每畝用量提高到15公斤，這顯然是過量而不合適的。又如，在 進口硝酸鉀 的使用說明中，錯誤地標註上 適用所有作物 ，這會誤導農民因擴大目標作物而蒙受損失。這些現象都不利於水溶肥的推廣應用和健康發展。

1、少量多次施用這是水溶肥料最重要的施肥原則，符合植物根系不間斷吸收養分的特點，減少一次性大量施肥造成的淋溶損失。少量多次施用是水溶肥料利用率高的最重要原因。一般每次每畝用量在3~6公斤。

2、注意養分平衡水溶肥料通常澆施、淋施或透過灌溉裝置施用。 特別在滴灌施肥條件下，根系生長密集、量大，這時對土壤的養分供應依賴性減小，更多依賴於透過滴灌提供的養分。對養分的合理比例和濃度有更高要求。如果配方不平衡，會影響作物生長。

3、安全施用防止肥料燒傷葉片和根系，特別是噴灌和微噴灌施肥，容易出現燒葉現象。 通常控制肥料溶液的EC值在1~3ms/cm，或每方水溶解1~3公斤，相當於稀釋350~1000倍。或噴施肥料後噴一次清水。淋施澆施時同樣要防止濃度過大燒根燒苗。有些種植戶一方水加入70公斤水溶肥料淋菠蘿，造成根系死亡，發黑。生產中最保險的辦法就是用少量肥做試驗，發現對葉片有傷害時降低濃度應用。