慈禧太后鑑於變法造成朝局混亂局面，已經準備出面干預了。所以當時京津已經是傳言四起，雖然甚囂塵上的天津閱兵廢帝一說純屬謠言。但是之前穩居頤和園對來哭訴的保守派王公大臣們閉門不納的太后肯定要出手已是沒有任何可懷疑的了。起碼在直隸總督榮祿星夜入京密報維新派提前動手，殺榮祿奪直隸京畿兵權，包圍頤和園，軟禁太后的計劃之前，慈禧已經下定決心出手了。政變只是起到了徹底激怒她，把干預變為訓政的催化劑作用。

最後戊戌六君子被殺主要是指控他們謀反（兵圍頤和園，謀害太后）。

慈禧太后鑑於變法造成朝局混亂局面，已經準備出面干預了。所以當時京津已經是傳言四起，雖然甚囂塵上的天津閱兵廢帝一說純屬謠言。但是之前穩居頤和園對來哭訴的保守派王公大臣們閉門不納的太后肯定要出手已是沒有任何可懷疑的了。起碼在直隸總督榮祿星夜入京密報維新派提前動手，殺榮祿奪直隸京畿兵權，包圍頤和園，軟禁太后的計劃之前，慈禧已經下定決心出手了。政變只是起到了徹底激怒她，把干預變為訓政的催化劑作用。

最後戊戌六君子被殺主要是指控他們謀反（兵圍頤和園，謀害太后）。

但是其中也有冤死鬼：

康廣仁不是核心成員，什麼都不知道。只是因為他是康有為的弟弟，對康有為離間母子，矯詔，策動謀反等舉動銜恨不已的慈禧完全是出於洩憤報復才殺了康廣仁。

楊銳本不屬於康梁譚一派，完全是作為自己的老師-張之洞的代理人參加進來的。對他們一味挑戰慈禧的舉動本不以為然。袁世凱收到的光緒帝的求救密詔已經康有為偽造的矯詔了。光緒帝原來的密詔是交給楊銳，再由他轉交康有為的。楊銳稀裡糊塗地成了謀反同謀。楊銳是軍機四章京裡鳴冤叫屈最起勁的一個，雖然張之洞緊急啟動營救，也沒有來得及。

楊深秀則屬於真是有種的，既不是維新四章京，也不是計劃中取代軍機處的懋勤殿成員之一，對兵圍頤和園計劃更是沒有與聞。在慈禧已經動手後，公開跳出來挑戰，反對訓政，要求太后歸政。結果被惱羞成怒到已經有點瘋狂的慈禧定位同黨給一鍋燴了。

六君子不經審判，就被慈禧下令殺於菜市口，原因如下：

1，慈禧和光緒的矛盾眾所周知，維新派參與皇室內鬥，犯了慈禧大忌！

2，從快處理，遏制外國勢力干涉內政！

1898年9月 28日，北京菜市口，戊戌六君子血灑刑場。這是慈禧晚年最恐怖的一場血腥殺戮。事件原尾，還得從戊戌變法說起。19世紀末，清王朝積貧積弱，江河日下，敗象已現，王都死期不遠。但晚年的慈禧依舊朝綱獨攬，盡情享樂，又是大修頤和園，又是忙於慶生，她還沉迷於京劇，隔三差五請名角戲班入宮唱戲。大臣們個個樂得逍遙自在，真正為國謀劃，為民擔憂，為社會奉獻的官員，難得一見，就幾個漢官李鴻章，張之洞還算賣力。皇親宗室，奕劻，榮祿，載灃等幾個頭面人物，要麼爭風吃醋，爭權奪利，要麼碌碌無為，不理正事，偷著樂閒著玩，。至於八旗權貴及那幫紈絝子弟，只管坐享高官厚祿，只圖鬥雞溜鳥，抽鴉片逛窯子，過著聲色犬馬，醉生夢死的腐化惰落的寄生生活，什麼國家存亡，民族興衰，跟他們沒半毛關係，今朝有酒有朝醉。大清帝國氣數幾盡。

一場洋務運動，讓大清有點起死回生，迴光返照。但一場甲午戰爭，讓一向默不作聲低調奮進，又不被大清帝國放在眼裡的東洋小國，居然把大清王朝打得一敗塗地，又割地又賠款，清朝又被打入十八層地獄。大清上下一夜之間，被打蒙，也被打醒。但災難才剛開始，西方列強接踵而來，掀起瓜分中國的狂潮，大清江山被弄得四分五裂。國將不國了！

大清怎麼辦？中國何處去？有志之士不斷進言獻策，光緒帝也心急火燎。康有為梁啟超衝在救亡的最前面。他們鼓動光緒帝變法圖強，這樣1898年，一場就貌似熱鬧的戊戌變法運動，緊鑼密鼓地搞起來了。

要變法就會觸犯既得集團的利益，比如改革科舉，裁汰冗員，取消八旗貴族部分特權，讓旗人自謀生路等。這讓世世代代養尊處優的權貴，守舊勢力，特權階層自然火冒三丈，大造輿論聲勢，對康梁百般造謠汙衊中傷，天天都在慈禧面前又哭又鬧，還要上吊。讓慈禧對變法者十分討厭和震怒。

最關鍵的是，光緒藉助這場變法，提高了自己的聲望，樹立了勵精圖治的正面形象，特別是在他自己周圍，凝聚了一支奮發有為的官僚集團，迷盲中計程車大夫們把光緒當作中興之主，正直的官員，把他當作挽救中國的最後一根稻草。連西方列強都對他刮目相看。

這樣的光緒帝，大有蓋過暮氣沉沉的老佛爺的能耐，並有取而代之的勢頭，這對一生死要權力，又心狠手辣的慈禧來說，恰恰犯了她的大忌。這是慈禧最不願意看到，最無法容忍的，是可忍孰不可忍！於是，慈禧迅速作出反擊。一場帝后爭霸戰由此拉開了，一是慈禧藉故端了光緒的老師翁同龢的飯碗，讓他回家吃老米，目的是剪除光緒帝的支柱。光緒隨後就削了一批慈禧的官粉，又提拔一批自已的粉絲，以示反擊。二是慈禧串通她的鐵粉榮祿，決定借天津閱兵發動政變，扣壓光諸帝。沒有兵權兵將的光緒帝，心裡就有點慌亂了。決定孤注一擲，派出他的心腹譚嗣同，去密會在天津小站練兵的袁世凱，要袁某動手殺了榮祿，進而控制慈禧，來個反政變。但光緒這最後一搏，卻落空了，他看錯了人。沒想到老奸巨猾的袁某當面信誓旦旦遵旨照辦，背後立馬就去榮祿那裡告密領賞了。

事情的結果，大家都清楚了。慈禧得到榮祿的密報，馬上調兵遣將，立馬囚了光緒帝，通輯逮捕變法人士，撤了所有支援變法的官員，廢除所有的變法舉措，宣告重新聽政。

這次，慈禧把她狠毒的特性盡情發揮了一把，她把對光緒的憤怒，對康梁的仇恨，對西方列強的不滿，對權力的貪戀與渴望，全部發洩在被捕的變法者身上，她不經正常司法程式，立即下令，斬殺戊戌六君子於北京菜市口。還下旨要用純刀殺人，用意非常險惡，就是要讓被殺者死得更慢，死得更難受更痛苦，以解她心頭之恨。也藉此震攝與慈禧政見不合者，更要嚇死菜市口吃瓜的群眾。據說，當時譚嗣同被連砍28刀，才把他砍死，場面極其殘忍。我們彷彿看見一個面目猙獰、恐怖的老佛爺，如魔鬼一般，站在眾人面前，歷歷在目，讓人不寒而慄。