腦栓塞和腦梗塞的臨床表現都是根據其腦損害的部位、腦缺血的嚴重程度、有無合併其他疾病等有關。主要表現為偏癱、偏身痛覺減退、偏身麻木、眩暈、走路不穩、視物模糊、複視，部分患者出現語言功能障礙、失語、吞嚥發嗆等症狀。

兩者的臨床表現大致一樣，單從臨床表現來區別較困難，兩者的不同可以從以下幾方面區別：

發病機制：它是各種的栓子隨血流進入顱內動脈系統，栓子隨血流進入腦動脈而阻塞血管，從而引起腦組織缺血、缺氧性壞死，血管腔急性閉塞。

患者常見基礎疾病：患者一般發病前可能有心臟病或者是風溼性心臟病，或者是冠心病、心內膜炎或者嚴重的心律失常，還有可能近期做過心臟手術或骨折長期臥床，以及進行血管內的治療等，都可以造成栓子的脫落，造成腦栓塞。

發病特點：發病前一般都是沒有什麼前驅症狀，發病特別的急，在數分鐘內發展就達到高峰。

發病機制：主要是腦動脈硬化或者是動脈炎造成的管腔狹窄導致的血流緩慢，血栓形成。

患者常見基礎疾病：對於腦梗塞患者，發病前一般都有高血壓病、糖尿病等，造成動脈硬化，這一類疾病的比較常見。

發病特點：發病前可能有短暫的腦缺血發作，可以頭暈、眩暈、一過性的肢體無力，它起病是比較緩慢的。