標題就有問題，關於張居正是否參與了高拱與馮保的鬥爭，史書上存爭議，有不同的說法，史學家朱東潤在其書張居正傳中就否認張居正參與此事。張居正和高拱曾經是志同道合的朋友，在朝堂上也是並肩作戰的戰友，但最後分道揚鑣甚至反目成仇都是因為權力的爭霸，兩人都愛國家，都有管理國家的能力，也都不是壞人，但是首輔（相當於宰相）只有一個，只能是你死我活，無可奈何的事。

張居正和高拱之間的關係比較複雜。高拱和張居正的老師徐階不和，這在隆慶年間已經公開化，徐階和張居正的師生關係也是公開的。在隆慶五年十二月的時候，內閣中只有徐階和張居正。高拱作為內閣首輔時，還兼掌吏部，是一個非常強勢的人物，他覺得內監會影響主張，所以一次次推薦騰祥、孟衝、陳洪，成為司禮監掌印太監，唯獨不推馮保。這樣司禮監秉筆太監馮保與高拱結下不共戴天的大仇。那高拱與張居正有什麼不合呢？

張居正和高拱私交本來不錯，但是現在他們的地位太近了，近的成了一種威脅，而且高拱手下有一群人，他們要立功，就得製造敵人，然後打倒敵人，貫徹主張。有一次，徐階的兒子送三萬兩銀子給張居正，於是張居正承認替他們維持。在大學士的朝房裡，便半真半假的譏諷了一頓。這一刺激太大了，張居正變了臉色，指天發誓否認此事。經過這樣剖白之後，高拱承認誤會，但雙方結下樑子，事情勉強結束。

隆慶六年5月，明穆宗去世，高拱、張居正、高儀（不到兩個月去世。）作為顧命大臣。馮保也利用這個機會，用傳遺詔的形式自己升任司禮監掌印太監。內閣和司禮監的對立更加尖銳，高拱和馮保互相看對方不順眼，必欲除之而後快。高拱利用言官准備一起彈劾馮保專權，馮保則向李太后上報高拱的牢騷“”十歲孩子如何做天子？”不久，發生政變，高拱被罷職，回鄉閒住。而在此過程中，張居正請假了幾天，好像沒事人一樣。

其實，張居正也不是出賣高拱，他是另有打算：坐觀成敗。高拱勝了，自己還可以繼續用事；馮保勝了，張居正自信還有對付的本領。這件事也給了張居正深刻的教訓：以後做內閣首輔時，奉承後宮和聯絡內監，要花不少功夫。