《放學後》《秘密》《白夜行》《暗戀》《信》《嫌疑人X的獻身》《畢業——雪月花殺人遊戲》《白馬山莊殺人事件》《學生街裡的殺人事件》　　《11 文字的殺人》　　《浪花少年偵探團》　　《以眨眼乾杯》　　《魔球》　　《殺人現場在雲端》　　《沉睡的森林》　　《布魯特斯的心臟——完全犯罪殺人接力》　　《十字豪宅的小丑》　　《鳥人計劃》（入圍第11屆吉川英治文學新人獎 ）　　《宿命》*（2004年拍攝日劇SP，柏原崇、藤木直人主演）　　《沒有犯人的殺人夜晚》　　《偵探俱樂部》　　《面具山莊殺人事件》　　《變身》（2005年拍攝電影，玉木宏、蒼井優主演）　　《迴廊亭殺人事件》　　《天使之耳　　《雪地殺機》　　《美麗的兇器》　　《同班的同學》　　《分身》　　《和阿忍老師說再見——浪花少年偵探團·獨立篇　　《過去我死去的家》　　《操縱彩虹的少年》　　《怪人們》　　《天空之蜂》》（入圍第17屆吉川英治文學新人獎 ）　　《平行世界的愛的故事》　　《怪笑小說》　　《那個時候我們是傻瓜》（散文集）　　《誰殺了她》　　《名偵探的守則》（2009春季日劇，松田翔太主演）　　《名偵探的詛縛》　　《毒笑小說》　　《惡意》*（1996年拍攝日劇，佐佐木藏之介主演）　　《秘密》* （第52 屆日本推理作家協會獎、第120 屆直木獎入圍）（1998年拍攝電影，廣末涼子主演）　　《偵探伽利略》*（2007年拍攝日劇，福山雅治、柴崎幸主演）　　《我殺了他》　　《白夜行》* （第122 屆直木獎入圍）（2006年拍攝日劇，山田孝之、綾瀨遙主演）　　《預知夢》*（2007年拍攝日劇，福山雅治、柴崎幸主演）　　《再一個謊言》　　《超·殺人事件》*（「2003年世界奇妙物語春季篇」拍攝其中一個單元故事，西村雅彥、大冢寧寧主演）　　《單戀》* （第125 屆直木獎入圍）　　《湖邊兇殺案》*（2002年拍攝電影，藥師丸博子、豐川悅司、役所廣司主演）　　《時生》 （2004年拍攝日劇，櫻井翔主演，劇名為「給父親的口信」）　　《綁架遊戲》*（2003年拍攝電影、藤木直人、仲間由　　《我是非常勤》 （注：本書書名和「 非常勤」（中文意為兼任）同音，是創作者特別設定的雙關語趣味）　　《殺人之門》*　　《信件》* （第129 屆直木獎入圍）（2005年拍攝電影，山田孝之、澤尻繪里香主演）　　《幻夜》* （第131 屆直木獎入圍）　　《挑戰》（散文集）　　《彷徨的刀刃》　　《黑笑小說》　　《嫌疑犯X 的獻身》* （第134 屆直木獎、第6 屆本格推理小說大獎）（2008年拍攝電影，福山雅治、柴崎幸、堤真一、松雪泰子主演）　　《科學》（散文集）　　《夢迴杜林》（散文集）　　《紅色手指》　　《使命與靈魂極限》　　《拂曉之街》　　《瀕死之眼》　　《也許是最後的寒暄》（散文集）　　《流星之絆》（2008年拍攝日劇，錦戶亮、戶田惠梨香、二宮和也主演）　　《伽利略的苦惱》　　《聖女的救濟》　　《悖論13》