遊戲開始後，進入破斧酒吧(Leaky Cauldron)，首先遇到魔法部長Cornelius Fudge，哈利向他詢問天狼星Black的事情，但他似乎對此並不感興趣，只是要帶哈利去他的房間。談話結束後可以自由活動，可趁機熟悉一下操作，在右方的寶箱中還可以得到1張卡片。進入右下角的樓道內，在盡頭再一次遇到Fudge部長，他又送給哈利3張卡片。進入自己的房間後，發現床上擺著Hagrid送來的生日禮物，哈利開啟後發現是一本怪獸之書，並且這本書變成怪獸向哈利發動襲擊。這是第一場戰鬥，還是以熟悉操作為主。戰鬥勝利後，獲得一件衣服，在主選單的第一個選項中可以裝備。之後返回主大廳，遇到Weasley夫婦及他們的兒子Ron，在交談中，哈利得知Ron的老鼠寵物Scabbers氣色不太好，需要鼠克補(Rat Tonic)來補充營養，於是自告奮勇去向旅館主人Tom要鼠克補。但Tom說它在地窖之中，哈利只得透過左方的樓梯進入地窖探險　　剛進入地窖就發現有一道壕溝擋住去路，按照系統提示，靠近壕溝使用Lumos魔法，即可看到隱藏的通道。繼續前進，會發現兩個木桶擋路，施放Flipendo魔法可以將它們打碎。在路上有很多鬼火樣的敵人，如果已經在之前的戰鬥中探查過敵人，則他們會顯現出本來面目。透過是否為鬼火樣，就可以判斷該敵人是否被探查過，對於圖鑑的收集很是方便。來到樓梯處，發現無路可走，這時只要對著下方那塊突起的石柱使用Flipendo魔法，就可以將路連線起來。繼續前進，又來到一片漆黑的通道，按照系統提示用Lumos魔法照亮吧。在盡頭處，終於發現了裝鼠克補的瓶子，可是已經被一隻老鼠吃了很多，並且那隻老鼠還因此而巨大化。戰勝它後，推動前方的石柱，哈利就可以帶著剩餘的鼠克補返回大廳。在大廳前恰好聽到Weasley夫婦在談論Black的事情，似乎他要殺掉哈利，Weasley告誡哈利不要去尋找Black，但哈利似乎另有打算。將鼠克補交給Ron後，Hermione來訪，並帶來一隻寵物貓Crookshanks。結果可想而知了，Ron的寵物鼠Scabbers拔腿就跑，Crookshanks也緊追不放，雙雙跑入地窖(- -)。Ron和Hermione都急於尋找自己的寵物，哈利面臨著選擇誰加入隊伍的問題。兩個人由於擁有不同的魔法技能，因此進入的區域並不相同。如果是選擇Hermione的話，可以用Reparo魔法修復毀壞的樓梯；如果是選擇Ron的話，則可以用Alohomora魔法開鎖。總之不管用誰，最後當然都是殊路同歸，Hermione和Ron也正式加入隊伍。之後一行人離開破斧酒吧，搭乘上霍格華茲快車(Hogwarts Express)。　　眾人為了找座位而到處閒逛，但發現只有最左面的一個包廂裡有空位子，裡面有一名正在打磕睡的男子，從Hermione的口中得知，原來他是教導黑魔法防禦術的新教授R.J.Lupin。這時列車突然停了下來，哈利剛想找人問個究竟，Neville來到包廂門口，拜託哈利他們找到他的寵物蟾蜍Trevor，並說有人看見它在行李車(baggage car)中出現過。眾人來到行李車，果然發現了蟾蜍，正要把它抓住還給Neville時，窗外突然有一個神秘的黑影閃過，同時窗戶破裂，哈利也莫名其妙的倒在地上。當黑衣人破門而入時，Lupin教授及時趕到，黑衣人也隨即離去。從Lupin教授口中得知，原來那個黑衣人是阿茲卡班的獄卒(Dementor)，並且不知什麼原因導致哈利崩潰。他希望Ron能夠找到一些巧克力(Chocolate)來醫治哈利，並希望Hermione能找到列車長使火車再次啟動(直到現在，我才從稱呼中發現，原來她是女的- -)。這時又一次進入人物選擇頁。無論選擇誰，都要走一個來回，哈利獲救後，列車也到達目的地活米村(Hogsmeade)。