首先NTFS不推薦使用FAT32的優點就不介紹了。只需要注意一點：FAT32支援的最大單個檔案大小為4GBNTFS特點：長檔名、壓縮分割槽、事件追蹤、檔案索引、高容錯性、資料保護和恢復、加密訪問 雖然有諸多優點，但這些都是針對傳統機械硬碟而設計的，對於新興的Flash快閃記憶體材料不一定適用。NTFS分割槽是採用“日誌式”的檔案系統，因為要記錄磁碟的詳細讀寫操作，對隨身碟這種快快閃記憶體儲介質會造成較大的負擔，比如同樣存取一個檔案或目錄，在NTFS系統上的讀寫次數就會比FAT32來得多，理論上NTFS格式的隨身碟比較容易損壞。 NTFS這些額外的功能無論對SSD硬碟和隨身碟都會造成不同程度的傷害，因此新一代Windows 7作業系統專門針對SSD進行最佳化，透過各種手段減少讀寫次數和碎片的產生。而對於隨身碟來說，本身USB的頻寬就有限，NTFS檔案系統頻繁讀寫佔據通道會讓磁碟效能降低，為此微軟專門針對移動儲存裝置開發了ExFAT檔案系統。對於快閃記憶體，NTFS檔案系統會有傷害。ExFAT： 顧名思義，ExFAT是對FAT檔案系統的一種延續，全稱Extended File Allocation Table File System，是微軟在Windows Embeded 5.0以上（包括Windows CE 5.0、6.0、Windows Mobile 5、6、6.1等手持作業系統）中引入的一種適合於快閃記憶體的檔案系統。ExFAT消除了FAT16/32的侷限性和缺點，又沒有NTFS那麼多快閃記憶體永遠都不會用到的功能，適合各種移動儲存卡和隨身碟使用。exFAT相較於之前FAT檔案系統的優勢在於：1.可拓展至更大軟盤大小，從FAT32的32GB拓展到256TB。2.簇大小最大可為每扇區225位元組，最大32 MB。3.由於採用了空餘空間定址，空間分配和刪除的效能得以改進。4.在單一資料夾內可達65 536個檔案5.支援訪問控制清單（但在Windows Vista SP1中尚未支援）[4]。6.支援Transaction-Safe FAT檔案系統 (TFAT)（在WinCE中可選的功能）。7.提供給OEM的可定義引數可以使這個檔案系統適應不同特色的裝置。8.時間戳記能夠使用UTC[5]時間而不僅僅是所在時區（從Vista SP2開始）總結：可以使用FAT32或者ExFAT。但是XP及XP之前的系統對ExFAT的支援不好，需要安裝補丁。如果你的儲存卡記憶體儲的單個檔案大小不會超過4GB，且考慮到相容性，用FAT32也未嘗不可。參考：http://zh.wikipedia.org/wiki/FAT32#FAT32大容量隨身碟檔案系統優缺點分析!_DIY綜合論壇_太平洋電腦網產品論壇
首先NTFS不推薦使用FAT32的優點就不介紹了。只需要注意一點：FAT32支援的最大單個檔案大小為4GBNTFS特點：長檔名、壓縮分割槽、事件追蹤、檔案索引、高容錯性、資料保護和恢復、加密訪問 雖然有諸多優點，但這些都是針對傳統機械硬碟而設計的，對於新興的Flash快閃記憶體材料不一定適用。NTFS分割槽是採用“日誌式”的檔案系統，因為要記錄磁碟的詳細讀寫操作，對隨身碟這種快快閃記憶體儲介質會造成較大的負擔，比如同樣存取一個檔案或目錄，在NTFS系統上的讀寫次數就會比FAT32來得多，理論上NTFS格式的隨身碟比較容易損壞。 NTFS這些額外的功能無論對SSD硬碟和隨身碟都會造成不同程度的傷害，因此新一代Windows 7作業系統專門針對SSD進行最佳化，透過各種手段減少讀寫次數和碎片的產生。而對於隨身碟來說，本身USB的頻寬就有限，NTFS檔案系統頻繁讀寫佔據通道會讓磁碟效能降低，為此微軟專門針對移動儲存裝置開發了ExFAT檔案系統。對於快閃記憶體，NTFS檔案系統會有傷害。ExFAT： 顧名思義，ExFAT是對FAT檔案系統的一種延續，全稱Extended File Allocation Table File System，是微軟在Windows Embeded 5.0以上（包括Windows CE 5.0、6.0、Windows Mobile 5、6、6.1等手持作業系統）中引入的一種適合於快閃記憶體的檔案系統。ExFAT消除了FAT16/32的侷限性和缺點，又沒有NTFS那麼多快閃記憶體永遠都不會用到的功能，適合各種移動儲存卡和隨身碟使用。exFAT相較於之前FAT檔案系統的優勢在於：1.可拓展至更大軟盤大小，從FAT32的32GB拓展到256TB。2.簇大小最大可為每扇區225位元組，最大32 MB。3.由於採用了空餘空間定址，空間分配和刪除的效能得以改進。4.在單一資料夾內可達65 536個檔案5.支援訪問控制清單（但在Windows Vista SP1中尚未支援）[4]。6.支援Transaction-Safe FAT檔案系統 (TFAT)（在WinCE中可選的功能）。7.提供給OEM的可定義引數可以使這個檔案系統適應不同特色的裝置。8.時間戳記能夠使用UTC[5]時間而不僅僅是所在時區（從Vista SP2開始）總結：可以使用FAT32或者ExFAT。但是XP及XP之前的系統對ExFAT的支援不好，需要安裝補丁。如果你的儲存卡記憶體儲的單個檔案大小不會超過4GB，且考慮到相容性，用FAT32也未嘗不可。參考：http://zh.wikipedia.org/wiki/FAT32#FAT32大容量隨身碟檔案系統優缺點分析!_DIY綜合論壇_太平洋電腦網產品論壇