二戰後，日本受美國控制。而美國在二戰中受到日本軍國主義的影響太大。其中，受軍國主義影響計程車兵，給美軍很大的傷痛。為此美國高層為了根除日本軍國主義思想，就必須把靖國神社拆除。斷絕日本人的信仰源泉。也將，日本天皇暴露在日本民眾視野中。但是，問題出現了，1.因為，靖國神社裡供奉了很多士兵，士兵的骨灰在裡面，許多日本民眾把對親人的哀思都寄託在這裡。如果強行拆除，勢必會引起民眾的過激反應。2.當時，日本殘存的右翼勢力利用這一點，到處煽動百姓，請求美國不要拆除靖國神社。而美國為了社會的治安穩定，也就沒有拆除。3.這也是美國為了自己的利益沒有拆除靖國神社，這也是其中一個主要因素。

靖國神社曾經差點被麥克阿瑟拆掉，建成“賽狗場”，不過經過一系列的事情最終沒能夠如願。不過說起麥克阿瑟，他並不是成為日本“統治者”之後才與日本有交集，而他拆掉日本靖國神社的初衷，就是源自於他對日本的理解。

1941年12月8日，和日本偷襲珍珠港是同一天，美軍在菲律賓遭到日本的進攻。當時麥克阿瑟率領15萬人的軍隊，日本只有4萬3000人，巨大的人數差距讓麥克阿瑟對日本軍隊掉以輕心，認為自己有能力而且將會十分輕鬆的擊退日本軍隊。但是日本第一天的突襲對美軍造成了巨大的障礙，幾乎摧毀了菲律賓地區的航空作戰能力。對於這個狀況，麥克阿瑟始終不敢相信是日本人的攻擊方式，他甚至向美軍總部彙報是德華人開著日本人的飛機。然而對於日本人瘋狂的進攻，美國軍隊只能退守馬尼拉。麥克阿瑟也只能在被“困”在此地，美國政府認為，再這樣下去，麥克阿瑟可能會被日本俘虜，下令麥克阿瑟撤出菲律賓戰場。懷著不甘與憤懣，麥克阿瑟只能坐著狹小的潛艇撤出陣地。

然而就是這樣的一個人，就任了日本的最高“統領”。他並不是在1941年碰到日軍的時候才思考日本人的做事方式，在他小時候，曾經隨著自己的父親來到過日本，見過當時日本人的英雄東郷平八郎。對於日本人，麥克阿瑟深感其“信仰”的偉大。他這才看出日本人“強大”的原點，那就是精神文化的束縛。

而這個精神文化雖然是強大的根源，也是日本人的弱點，他認為如果能夠從精神上徹底擊垮日本人，那麼日本將會永遠的順從美國。於是在佔領日本以後，開始從教育上改造日本，讓他們放棄所謂的“武士道”“軍國主義”。正式明治時期對於天皇的絕對效忠，才導致日本走向了軍國主義道路，大肆的侵略他國。並且打算將日本人崇拜的“靖國神社”拆除，從思想斷絕其精神文化的根源。

當時駐日本羅馬法王代表布魯諾位元爾神父，得知麥克阿瑟的想法以後，馬上通過當時的副司令官向麥克阿瑟傳遞了下面的資訊：根據自然法則來看，無論哪個國家都會對為這個國家而死的人表達敬意，而這個也是他們的權利和義務。如果把靖國神社燒掉的話，那麼會成為美軍歷史上的一個汙點。明確的來說，燒掉靖國神社和美軍佔領日本的政策是相反的。不僅如此，日本國內對於拆除靖國神社的報道比比皆是，計劃也是屢屢受阻。最終麥克阿瑟考慮到日本民眾的穩定性和對於美軍的影響度，保留了靖國神社。

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改成宗教法人逃過一劫，以及美國縱容日本右傾化

日本靖國神廁雖然名義上是宗教祭祀場所，但是之前一直是由日本軍部管理和運營，屬於日本軍部下屬機構。這也是為什麼，美軍佔領日本後，太上皇麥克阿瑟想要一把火燒掉靖國神社的原因所在。

但是日本投降後，美軍第一項工作是削弱日本天皇的神話色彩，將裕仁從神打回人。內容之一就是政教分離，在這個時期靖國神社跟其他幾個國立神社一起轉成民間性質的宗教法人。這個時候，麥克阿瑟再想起去拆靖國神社已經失去最重要的法理依據。再加上羅馬天主教駐日本代表以及美軍隨軍牧師反對，認為這種行為干涉宗教事務，且給美軍榮譽造成負面影響，於是作罷。二戰時靖國神社入祀要求是隻能在戰場上作戰戰死才行，像珍珠港事件主要當事人，山本五十六(死在乘機路上)和南雲忠一(自殺)都沒資格放入，不過也降低了美國的仇恨關注度。如果按照之前要求，被絞死的甲級戰犯根本沒有資格入祀。

靖國神社一開始都還是夾著尾巴做人，但後面越來越猖狂則離不開美國縱容日本社會的右傾化。戰後日本社會左右翼對立十分尖銳，右翼以舊軍人、舊官僚、舊家族為主，他們否定歷史，幻想重建榮光。而左翼則是以市民和只是分子為主，他們是承受戰爭苦難的主力，是真的不想再打，反對一切戰爭，組建自衛隊都抗議不滿，想要保持絕對中立。日本社會左右翼對立十分嚴重，不是鍵盤決鬥，是真正的大規模械鬥

但是遺憾的是，這個時候冷戰的大幕已經徐徐拉開，失去東亞大陸的美國需要日本作為其在太平洋西岸的橋頭堡和踏板。所以美國縱容甚至包庇日本右傾化，一大幫戰犯重新返回日本政壇，扶持右翼去打壓左翼。

1960年1月，前戰犯岸信介時任日本首相，與美國簽署《日美安全保障協議》，正式綁上了美國的戰車。當時引發日本社會高達650萬人的最大規模遊行抗議活動，岸信介本人都遭到刺殺。示威群眾包圍日本首相官邸美國總統秘書車輛被遊行群眾包圍，最後美軍出動直升機解救出來。國會大廈門口數十萬人抗議集會

一直到70年代後日本經濟高速發展，自信心開始膨脹，右翼思想逐漸佔據主流。再加上政治上自民黨力量鞏固，足以打壓下左翼活動，日本社會向右拐，否定歷史，美化侵略成為主流。1976年靖國神社宮司，多次阻止厚生省右翼官員想把戰犯排位放進去合祀的皇族成員筑波藤磨去世，新任宮司松平永芳和其父親在二戰時均為日本海軍軍官，也是右翼分子，阻止二戰甲級戰犯牌位放入靖國神社最後一道關卡終於失守。