朱祁鈺猝死後，朱祁鎮登基，譚允賢逃離故宮，在鄉間寫下《女醫雜言》，朱祁鎮也放棄了皇位，去找譚允賢，終於找到譚允賢的住處。兩個人最後終於走到了一起。

明朝，國家繁榮昌盛，但禮教十分嚴謹。婦女地位低下，不允許行醫，隱疾難治。譚家是一個醫學世家。他們幾代都是皇家醫生。他們被奸人陷害，遭受滅頂之災。從此，從此留下組訓，不準行醫。但譚允賢從小就和奶奶偷偷學中醫。不僅懸壺濟世、妙手仁心，還得到了人們的讚揚和支援，更漸起救天下女子之心。

因此，允賢不僅在醫學學習上面臨諸多困難和障礙，還面臨著封建禮教和世俗觀念的衝擊。然而，允賢憑著對醫學事業的執著和熱愛，克服了許多困難，不僅在醫學上廣為接受、兼收幷蓄、自成一派，而且突破了嚴格的倫理約束，創造和建立了從救人身體到救人靈魂的女性醫學體系，後來從救人到救國，傳播和弘揚了祖國的醫學文化，最終成為一代享譽世界的民族女醫生

歐醫明妃傳，英宗重新登基，下令廢除殉葬制度，施行女醫制度，允賢放不下祁鈺與她還未出世的孩子見濟的死，無法面對英宗的一片深情，也厭倦了宮中戰戰兢兢的生活，離開皇宮遠走天涯，寄情山水，懸壺濟世。其師兄程村霞亦卸官做了遊方郎中，與允賢在民間相遇，叮囑允賢寫完她那本女醫雜言，一定要給他留一本。若干年後，錢皇后去世，英宗傳位於太子朱見深，獨自出宮尋找允賢。夕陽斜照，英宗走過小橋，一言看見那間掛著譚氏醫館的民房。只見一女子穿著紅衣，挽著袖子在洗手，手上的紅鐲子閃閃發光，一如當初模樣。允賢感覺門口有人抬頭看見英宗，四目相對眉目傳情還似當年的樣子。在允賢和醫女還有英宗的感召下，不僅官方接受了女醫，民間也有了女醫，這樣大大提高了人間醫生的數量，是得病的人有更多的治療體系。性命也大為增長。