MLPA(Multiples ligation-dependent probe amplification),多重連線依賴探針擴增,是一種在同一反應管內檢測多達50個核苷酸序列的複製數變化的方法。MLPA可以快速同時鑑定幾十個基因的缺失和插入,可用於血液,腫瘤樣本的DNA,mRNA的表達譜分析。而且,MLPA方法可用於甲基化分析。MLPA已經證實是可信而可靠的方法,目前已廣泛應用於全世界900多個實驗室,使用該技術發表的論文已近千篇。
MLPA目前的應用領域:
1.檢測小的重排:BRCA1,BRCA2,MSH2,MLH1,DMD,APC,SMA,NF1,NF2,VHL,TSC1/2,MECP2,NSD1,LDLR,FBN1,CFTR,DPYD,COOL5A1,CACNA1A,PKHD1,BRIP1,SLC26A4,LNM1B,PRSS1,FRMD7,TPMT,FLCN,DNAI1,EP300,DNAH5,UBE3A,PCCA,PCDH15等。
2.檢測大範圍的染色體重排:williams syndrome,prader-willi/angelman syndrome,digeorge syndrome,cri du chat,pelizaeus-merzbacher,CMT1,HNPP等。
3.檢測亞端粒區的複製數改變。
4.檢測染色體非整倍體改變,(包括羊水樣本)。
5.腫瘤診斷:ALL,CLL,Oligodendrogliomas,melanomas,neuroblastomas等病的複製數改變。
6.甲基化定量檢測:Parader-willi、angelman syndrome,beckwith wiedemann,MGMT,MLH1,Fragile X,抑癌基因的失活。
7.mRNA分析細胞凋亡和炎症反應。
MLPA的特點:
1.基於PCR的反應,一個反應同時檢測多達50個基因組DNA序列的複製數。
2.樣本量要求:只需20 ng 人DNA,羊水0.5 ml 約3000個細胞。
3.能區分一個鹼基的差異的核酸序列。
4.反應條件最佳化,所有試劑盒基本適用同一反應條件,試劑盒包含了所有必需試劑。
5.高通量:24小時內得到結果。
6.儀器要求:只需普通PCR儀和測序儀。
7.檢測範圍:從點突變到大染色體缺失/插入均能檢測。
MLPA反應條件(one-tube MLPA protocol):
1.DNA變性:98度加熱5分鐘。
2.雜交:加入SALSA探針混合物和buffer於95度孵育1分鐘,然後於60度雜交16個小時。
3.連線:加連線酶和buffer於54度孵育15分鐘。再於98度加熱5分鐘使連線酶失活。
4.加引物:dNTP,聚合酶,然後開始PCR擴增。
5.毛細管電泳:輸出片段長度和峰面積,軟體分析結果。
MLPA的優點:
1.MLPA技術能用於檢測許多不同的疾病,差別只是探針不同而已。
2.MLPA是多重反應,一個反應提供了將近50個靶位點。
3.MLPA反應費用較低。
4.MLPA重複性好,簡單易操作,可以同時檢測多個樣本。
5.MLPA敏感性高,僅需20 ng 人DNA,結果不受樣品DNA量的影響。
6.MLPA能區分單個鹼基的差異,能檢測少量的複製數改變,如2個,3個複製數改變。
7.MLPA可以檢測單一外顯子的缺失和插入突變。
8.所需儀器易得到
MLPA(Multiples ligation-dependent probe amplification),多重連線依賴探針擴增,是一種在同一反應管內檢測多達50個核苷酸序列的複製數變化的方法。MLPA可以快速同時鑑定幾十個基因的缺失和插入,可用於血液,腫瘤樣本的DNA,mRNA的表達譜分析。而且,MLPA方法可用於甲基化分析。MLPA已經證實是可信而可靠的方法,目前已廣泛應用於全世界900多個實驗室,使用該技術發表的論文已近千篇。
MLPA目前的應用領域:
1.檢測小的重排:BRCA1,BRCA2,MSH2,MLH1,DMD,APC,SMA,NF1,NF2,VHL,TSC1/2,MECP2,NSD1,LDLR,FBN1,CFTR,DPYD,COOL5A1,CACNA1A,PKHD1,BRIP1,SLC26A4,LNM1B,PRSS1,FRMD7,TPMT,FLCN,DNAI1,EP300,DNAH5,UBE3A,PCCA,PCDH15等。
2.檢測大範圍的染色體重排:williams syndrome,prader-willi/angelman syndrome,digeorge syndrome,cri du chat,pelizaeus-merzbacher,CMT1,HNPP等。
3.檢測亞端粒區的複製數改變。
4.檢測染色體非整倍體改變,(包括羊水樣本)。
5.腫瘤診斷:ALL,CLL,Oligodendrogliomas,melanomas,neuroblastomas等病的複製數改變。
6.甲基化定量檢測:Parader-willi、angelman syndrome,beckwith wiedemann,MGMT,MLH1,Fragile X,抑癌基因的失活。
7.mRNA分析細胞凋亡和炎症反應。
MLPA的特點:
1.基於PCR的反應,一個反應同時檢測多達50個基因組DNA序列的複製數。
2.樣本量要求:只需20 ng 人DNA,羊水0.5 ml 約3000個細胞。
3.能區分一個鹼基的差異的核酸序列。
4.反應條件最佳化,所有試劑盒基本適用同一反應條件,試劑盒包含了所有必需試劑。
5.高通量:24小時內得到結果。
6.儀器要求:只需普通PCR儀和測序儀。
7.檢測範圍:從點突變到大染色體缺失/插入均能檢測。
MLPA反應條件(one-tube MLPA protocol):
1.DNA變性:98度加熱5分鐘。
2.雜交:加入SALSA探針混合物和buffer於95度孵育1分鐘,然後於60度雜交16個小時。
3.連線:加連線酶和buffer於54度孵育15分鐘。再於98度加熱5分鐘使連線酶失活。
4.加引物:dNTP,聚合酶,然後開始PCR擴增。
5.毛細管電泳:輸出片段長度和峰面積,軟體分析結果。
MLPA的優點:
1.MLPA技術能用於檢測許多不同的疾病,差別只是探針不同而已。
2.MLPA是多重反應,一個反應提供了將近50個靶位點。
3.MLPA反應費用較低。
4.MLPA重複性好,簡單易操作,可以同時檢測多個樣本。
5.MLPA敏感性高,僅需20 ng 人DNA,結果不受樣品DNA量的影響。
6.MLPA能區分單個鹼基的差異,能檢測少量的複製數改變,如2個,3個複製數改變。
7.MLPA可以檢測單一外顯子的缺失和插入突變。
8.所需儀器易得到