化學分類：
1、天然培養基
天然培養基是指一類利用動物、植物或微生物體包括其提取物製成的培養基。例如。牛肉膏蛋白腖培養基、麥芽汁培養基和LB培養基等。
常用的天然有機營養物質包括豆芽汁、玉米粉、土壤浸液、麩皮、牛奶、血清、椰子汁等。天然培養基成本較低，除在實驗室經常使用外，也適於用來進行工業上大規模的微生物發酵生產。
2、組合培養基
合成培養基是根據天然培養基的成分，用化學物質模擬合成、人工設計而配製的培養基。例如。高氏1號培養基和查氏培養基等。
合成培養基有一定的配方，配製合成培養基時重複性強，但與天然培養基相比其成本較高，微生物在其中生長速度較慢，一般適於在實驗室用來進行有關微生物營養需求、代謝、分類鑑定、生物量測定、菌種選育及遺傳分析等方面的研究工作。
3、半組合培養基
指一類主要以化學試劑配製，同時還加有某種或某些天然成分的培養基。例如，馬鈴薯蔗糖培養基。
物理分類：
1、液體培養基
80%～90%是水，其中配有可溶性的或不溶性的營養成分的培養基。
2、固體培養基
一類配製成的固體狀態的基質。根據性質又分為固化培養基、非可逆性固化培養基、天然固態培養基、濾膜。
3、半固體培養基
指在液體培養基中加入少量的凝固劑而配製成的半固體狀態的培養基。
4、脫水培養基
又稱預製乾燥培養基，指含有除水分外的一切成分的商品培養基。
微生物分類：
1、選擇性培養基：一類根據某微生物的特殊營養要求或其對某化學、物理因素的抗性而設計的培養基，具有使混合菌樣中的劣勢菌變成優勢菌的功能，廣泛用於菌種篩選等領域。
2、鑑別培養基：一類在成分中加有能與目的菌的無色代謝產物發生顯色反應的指示劑，從而達到只須用肉眼辨別顏色就能方便的從近似菌落中找出目的菌菌落的培養基。例如，伊紅美藍乳糖培養基（EMB）。
擴充套件資料：
培養基的配置原則：
1、選擇適宜的營養物質
總體而言，所有微生物生長繁殖均需要培養基含有碳源、氮源、無機鹽、生長因子、水及能源，但由於微生物營養型別複雜，不同微生物對營養物質的需求是不一樣的，因此首先要根據不同微生物的營養需求配製針對性強的培養基。
2、營養物質濃度及配比合適
培養基中營養物質濃度合適時微生物才能生長良好，營養物質濃度過低時不能滿足微生物正常生長所需，濃度過高時則可能對微生物生長起抑制作用，例如高濃度糖類物質、無機鹽、重金屬離子等不僅不能維持和促進微生物的生長，反而起到抑菌或殺菌作用。
3、控制pH條件
培養基的pH必須控制在一定的範圍內，以滿足不同型別微生物的生長繁殖或產生代謝產物。各類微生物生長繁殖或產生代謝產物的最適pH條件各不相同，一般來講，細菌與放線菌適於在pH7-7.5範圍內生長，酵母菌和黴菌通常在pH4.5-6範圍內生長。
4、控制氧化還原電位(redox potential)
不同型別微生物生長對氧化還原電位(F)的要求不一樣，一般好氧性微生物在F值為+0.1V以上時可正常生長，一般以+0.3一+0.4V為宜，厭氧性微生物只能在F值低於+0.1V條件下生長，兼性厭氧微生物在F值為+0.1V以上時進行好氧呼吸，在+0.1V以下時進行發酵。
在配製培養基時應儘量利用廉價且易於獲得的原料作為培養基成分，特別是在發酵工業中，培養基用量很大，利用低成本的原料更體現出其經濟價值。
6、滅菌處理
要獲得微生物純培養，必須避免雜菌汙染，因此對所用器材及工作場所進行消毒與滅菌。對培養基而言，更是要進行嚴格的滅菌。對培養基一般採取高壓蒸汽滅菌，一般培養基用1.05kg/cm2，121.3℃條件下維持15-30min可達到滅菌目的。
化學分類：
1、天然培養基
天然培養基是指一類利用動物、植物或微生物體包括其提取物製成的培養基。例如。牛肉膏蛋白腖培養基、麥芽汁培養基和LB培養基等。
常用的天然有機營養物質包括豆芽汁、玉米粉、土壤浸液、麩皮、牛奶、血清、椰子汁等。天然培養基成本較低，除在實驗室經常使用外，也適於用來進行工業上大規模的微生物發酵生產。
2、組合培養基
合成培養基是根據天然培養基的成分，用化學物質模擬合成、人工設計而配製的培養基。例如。高氏1號培養基和查氏培養基等。
合成培養基有一定的配方，配製合成培養基時重複性強，但與天然培養基相比其成本較高，微生物在其中生長速度較慢，一般適於在實驗室用來進行有關微生物營養需求、代謝、分類鑑定、生物量測定、菌種選育及遺傳分析等方面的研究工作。
3、半組合培養基
指一類主要以化學試劑配製，同時還加有某種或某些天然成分的培養基。例如，馬鈴薯蔗糖培養基。
物理分類：
1、液體培養基
80%～90%是水，其中配有可溶性的或不溶性的營養成分的培養基。
2、固體培養基
一類配製成的固體狀態的基質。根據性質又分為固化培養基、非可逆性固化培養基、天然固態培養基、濾膜。
3、半固體培養基
指在液體培養基中加入少量的凝固劑而配製成的半固體狀態的培養基。
4、脫水培養基
又稱預製乾燥培養基，指含有除水分外的一切成分的商品培養基。
微生物分類：
1、選擇性培養基：一類根據某微生物的特殊營養要求或其對某化學、物理因素的抗性而設計的培養基，具有使混合菌樣中的劣勢菌變成優勢菌的功能，廣泛用於菌種篩選等領域。
2、鑑別培養基：一類在成分中加有能與目的菌的無色代謝產物發生顯色反應的指示劑，從而達到只須用肉眼辨別顏色就能方便的從近似菌落中找出目的菌菌落的培養基。例如，伊紅美藍乳糖培養基（EMB）。
擴充套件資料：
培養基的配置原則：
1、選擇適宜的營養物質
總體而言，所有微生物生長繁殖均需要培養基含有碳源、氮源、無機鹽、生長因子、水及能源，但由於微生物營養型別複雜，不同微生物對營養物質的需求是不一樣的，因此首先要根據不同微生物的營養需求配製針對性強的培養基。
2、營養物質濃度及配比合適
培養基中營養物質濃度合適時微生物才能生長良好，營養物質濃度過低時不能滿足微生物正常生長所需，濃度過高時則可能對微生物生長起抑制作用，例如高濃度糖類物質、無機鹽、重金屬離子等不僅不能維持和促進微生物的生長，反而起到抑菌或殺菌作用。
3、控制pH條件
培養基的pH必須控制在一定的範圍內，以滿足不同型別微生物的生長繁殖或產生代謝產物。各類微生物生長繁殖或產生代謝產物的最適pH條件各不相同，一般來講，細菌與放線菌適於在pH7-7.5範圍內生長，酵母菌和黴菌通常在pH4.5-6範圍內生長。
4、控制氧化還原電位(redox potential)
不同型別微生物生長對氧化還原電位(F)的要求不一樣，一般好氧性微生物在F值為+0.1V以上時可正常生長，一般以+0.3一+0.4V為宜，厭氧性微生物只能在F值低於+0.1V條件下生長，兼性厭氧微生物在F值為+0.1V以上時進行好氧呼吸，在+0.1V以下時進行發酵。
在配製培養基時應儘量利用廉價且易於獲得的原料作為培養基成分，特別是在發酵工業中，培養基用量很大，利用低成本的原料更體現出其經濟價值。
6、滅菌處理
要獲得微生物純培養，必須避免雜菌汙染，因此對所用器材及工作場所進行消毒與滅菌。對培養基而言，更是要進行嚴格的滅菌。對培養基一般採取高壓蒸汽滅菌，一般培養基用1.05kg/cm2，121.3℃條件下維持15-30min可達到滅菌目的。