科技資源配置是指科技資源在全部科技活動中的不同活動主體、學科領域、時空的分配與組合。科技資源配置包括微觀、中觀和宏觀層次。微觀層次是指具體的某一科技創新主體如何在其內部匹配(組合)各種科技資源，以便高效率地產出科技成果。中觀層次即部門層次和地區層次。最高層次是宏觀層次，是指國家調控管理職能部門對金社會的科技資源在不同科技活動主體、不同科技活動過程、不同學科領域、不同地區、不同部門、不同行業之間的分配。

市場在科技資源配置過程中形成對科技資源配置的自組織機制。同時，由於科技活動的外部性特徵導致市場配置失靈，從而市場的這種自組織機制只有在有效的制度和文化的引導、規範下才能不斷髮展和完善。制度是在人們從事科技活動的過程中不斷髮展完善的，制度既源於文化，又是文化的載體，因而制度體現了文化的特徵。制度的有效供給與執行離不開從事科技活動的人對制度的理解與認同，他們之間的文化契合度決定著制度的執行成本及其績效。同時，由於市場對科技資源配置起基礎性作用，制度作為一種調節市場失靈的手段，要以現存的市場狀態為依據，才能實現有效的供給。文化作為一種自發的社會秩序，是科技人員在長期從事科技活動過程中不斷形成併發揮作用，其形成經歷了從個人的“原子事態”到社會的行為模式的轉變，對科技人力資源要素的行為起著引導與規範的作用。在這種引導與規範的過程中實現對科技資源的市場配置和制度配置的有效補充；同時制度的供給和市場的發展對文化配置不斷地進行規範和完善。市場配置、制度配置和文化配置三者的協同作用，有助於實現科技資源的最佳化配置、促進科技資源配置效率的提高，從而有利於整個科技活動向著社會福祉增大的方向發展。