優點：

1、改良品種（雜交水稻也是一種克隆）可以豐富人們的物質生活，使畜牧業的成本降低，效率提高。可以緩解糧食危機；

2、基因治療（對醫療保健工作產生重大影響）；

3、器官移植，可以治療器官壞死等方面的疾病；

4、保護環境和瀕危動植物，儲存和傳播動物物種資源。

缺點：

1、克隆將減少遺傳變異，透過克隆產生的個體具有同樣的遺傳基因，同樣的疾病敏感性，一種疾病就可以毀滅整個由克隆產生的群體；

2、克隆技術的使用將使人們傾向於大量繁殖現有種群中最有利用價值的個體，而不是按自然規律促進整個種群的優勝劣汰。從這個意義上說，克隆技術干擾了自然進化過程；

3、克隆技術是一種昂貴的技術，需要大量的金錢和生物專業人士的參與，失敗率非常高。雖然現在發展出了更先進的技術，成功率也只能達到2-3%；

4、 轉基因動物提高了疾病傳染的風險；

5、克隆技術應用於人體將導致對後代遺傳性狀的人工控制；

6、克隆技術也可用來創造“超人”，或擁有健壯的體格卻智力低下的人。而且，如果克隆技術能夠在人類中有效運用，男性也就失去了遺傳上的意義。

7、克隆技術對家庭關係帶來的影響也將是巨大的。一個由父親的DNA克隆生成的孩子可以看作父親的雙胞胎兄弟，只不過延遲了幾十年出生而已。

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克隆技術大致應用在以下四個方面：

1. 培育優良畜種和生產實驗動物；

2. 生產轉基因動物；

3. 生產人胚胎幹細胞用於細胞和組織替代療法；

4. 複製瀕危的動物物種,儲存和傳播動物物種資源。

克隆技術對保護物種特別是珍稀、瀕危物種來講是一個福音,具有很大的應用前景。從生物學的角度看,這也是克隆技術最有價值的地方之一。