第一任蜀侯是原先蜀王的兒子，但是被一個叫陳莊的地方實力派殺死，陳莊就是第二任蜀侯，司馬錯討滅陳莊後，秦國公子輝是第三任蜀侯，這是正牌的秦國公子，其發動叛亂被司馬錯擊敗被殺，然後蜀國就以郡縣制併入秦國。

題主的問題：秦滅蜀後，反叛的三任蜀侯是秦公子嗎？我的答案：根據目前的材料來看，很可能是蜀人。

原因：這個問題要回答不是那麼容易，我們可從下幾個方面來談：

第一，根據《華陽國志》的記載，公元前316年，秦滅開明氏蜀國（王都即在金沙遺址），蜀王隨即南徙，其中蜀王當時死於武陽，也就是現在的彭山。同時，根據《水經注》的經載，蜀王后裔在此後遷徙到了交趾（現在的越南北部地區），並在當地建立了蜀王朝，這在越南文獻《大越史記全書》上有明確記載。並且，這一歷史事實也已經被近年的考古所證實。具體的考古資料可以參閱：雷雨的《從青銅至鐵器時代的考古發現看四川與越南的文化交流：越南考察心得》、彭長林的《越南北部牙璋研究》和張弘的《先秦時期古蜀與東南亞、南亞的經濟文化交流》等資料。因此，如果蜀王家族在公元前316年已經開始南遷，則秦人所封的蜀侯就不可能是蜀人。

第二，從文獻記載來看，《華陽國志》提到三任蜀侯即公子通（前316年秦滅蜀後受封）、公子惲（約前310年受封）、公子綰（前300年受封），皆不言其為蜀人。但《華陽國志》的記載與《戰國策》、《史記》存在矛盾。根據《戰國策·秦策一》和《史記·張儀列傳》的記載：秦起兵定蜀之後，“蜀主更號為侯，而使陳莊相蜀”。這樣看來，第一任蜀侯應是蜀人。

如果解釋上面的矛盾？這有兩種可能性：第一種可能性，秦人選擇的蜀侯並非原蜀王家族的成員，而是原臣屬於蜀王集團的地方勢力集團成員，但這種可能性極低。第二種可能性，就是《華陽國志》的記載有誤，也就是說蜀王家族南遷時間並非是公元前316年，而是在三任蜀侯皆反叛而未果的情況下，隨著秦人設定郡縣而被迫南遷的。這種可能性很大。

第三，公子通被封為蜀侯後，僅過了幾年，就被來自蜀相陳莊所殺。隨即，甘茂、司馬錯伐蜀，滅掉了陳莊。陳莊被殺後，公子惲被封為蜀侯。綜合《史記》和《華陽國志》的記載，公子惲封侯當為公元前310年，也就是秦武王元年。秦武王無子，顯然這位公子惲要麼仍是蜀人，要麼是就是秦人嬴氏家族的族弟。從《華陽國志》提到的當時”戎伯方強“來看，秦人使用羈縻政策來籠絡蜀人的可能性很大，因此，第二任蜀侯也應當為蜀人。

第四，前301年，蜀侯公子惲反叛，再次被司馬錯平定，隨後被封為蜀侯的是公子綰。按《秦本紀》、《始皇本紀》來看，秦昭襄王是三年而行冠禮，也就是說，公子綰如果是昭襄王之子的話，無疑只是一個嬰兒或者幼童，在蜀地地方勢力仍然很強大的情況下，顯然秦人不可能把一個嬰幼兒放到蜀地來為侯。也就是說，按照秦人政策的延續性來考慮，第三任蜀侯也仍當是原蜀王之後。

第五，公元前285年，公子綰因有反叛企圖被秦人所殺。此後，秦人再未立蜀侯，而是在蜀地實行了郡縣制。隨著郡縣制在蜀地的建立，李冰治水成功，成都平原成為天府之國，這也為秦人統一中國提供了強大的後勤保障支援。

綜合上面的分析，我們可以推定：秦人在蜀地推行郡縣制前的三任蜀侯，很可能都是蜀王之後。從時間上來說，把蜀王家族開始南遷的時間放在公元前285年左右，這與《水經注》、《大越史記全書》等文獻的記載都不會構成矛盾，也不會對解讀已經發現的考古材料造成困難。

三任蜀侯，都是不是秦公子，都是原來的蜀國王室後裔。

秦惠文王滅巴蜀後，封的第一任蜀侯是蜀國公子通國，並安排陳壯、張若兩個秦國大臣進行輔佐，實為監視。

秦武王即位，封了一個蜀侯煇，蜀侯煇叛亂被秦昭襄王平定。

事後，秦昭襄王任命蜀侯煇的兒子綰為蜀侯。

戰國時期，秦國經過商鞅變法，一躍成為戰國七雄中最強的國家，國力變強了的秦國也開始逐漸對外擴張，走上了一統天下的道路。

公元前311年。秦楚丹陽之戰結束之後，秦惠文王趨勢，太子嬴蕩即位，稱為秦武王。秦武王繼位後，在與東方諸國的戰爭中取得了一系列勝利。但是此時後方卻出現了問題，巴蜀再次反叛了。

巴蜀是秦國西南的兩個小國，公元前316年，秦惠文王起兵伐蜀，張儀、司馬錯等名將悉數參戰，在葭萌關一戰，秦軍大勝，斬了蜀王，之後秦軍又趁勝追擊，滅了巴國，自此，巴蜀就歸秦國所有。

為了更好地控制巴蜀，秦惠文王封元蜀國公子通國為蜀侯，任命秦人陳莊為相國治理巴蜀，張若為太守掌控軍隊，將軍政牢牢地掌握在自己人手裡。但是人算不如天算，陳莊最後居然被公子通國策反了。

當時楚國正準備進攻秦國，於是派人跟蜀侯國通暗中聯手。有了楚國這個強力的外援，加上又策反了陳莊，蜀侯通國再無顧忌，在巴蜀發動反叛。

可是誰知道咸陽方面早就秦楚大戰前就防備著蜀中可能發生的叛亂，留下了名將司馬錯和數萬軍隊，之後司馬錯率領五萬大軍入蜀平叛。張若也憑藉成都城的堅固固守待援，使蜀侯國通不敢全力進軍。

司馬錯是當世名將，蜀侯國通和陳莊怎麼會是他的對手，加上為了防備蜀中叛亂，司馬錯連丹陽之戰都沒參加，現在入蜀平叛就猶如猛虎下山，不僅擊潰了叛軍，還在金沙江流域打敗了丹、犁等部落，徹底解決了蜀郡的叛亂。

秦武王即位後，再次分封蜀侯煇，這個人也是蜀國的宗室血脈，秦武王對蜀國王室還算比較“仁慈”了。可是蜀侯煇並沒有領情，他上任之後就開始謀劃要再度反叛。

秦武王意外去世後，秦昭襄王即位，齊魏韓準備出兵伐秦，蜀侯煇一見機會來了，果斷髮動了蜀郡第二次叛亂。秦昭襄王命老將司馬錯率兵入蜀平亂，司馬錯第二次平叛也極為順利，很快就平定了叛亂，斬了蜀侯煇及其爪牙。

蜀郡經歷了兩次叛亂，秦昭襄王卻不吸取教訓，繼續任命蜀侯煇的兒子綰為蜀侯。哪怕秦昭襄王如此大度，蜀侯綰也照樣不領情，再度掀起第三次叛亂。秦昭襄王徹底怒了，直接暴力鎮壓此次叛亂，並派張若為蜀守，不再立蜀侯。

由此可見，蜀郡的三次叛亂都是原來蜀國的王族後代挑起的，跟秦國公子一點關係也沒有。而且秦國雖然有分封諸子的習慣，但是將巴蜀這麼大一片領土封給秦公子尚沒有先例。