這個可以肯定的回答就是肯定會起到作用，原因就是以下兩點。

首先第一點也是非常重要的一點，那就是止水的別天神被稱為什麼，那就是最強幻術，無論是誰中了這個幻術都會起作用，這個設定是絕對不會被打破的。

第二點就是我們在後來鼬被穢土轉生之後我們知道，鼬的這個別天神就是為了佐助提前設定的，目的就是為了讓佐助回頭，但是人算不如天算，自己被穢土轉生讓這個忍術提前觸發，最後導致佐助沒能看到鳴人這個忍術就失效了。按照鼬的性格肯定是能夠起到作用的，鼬從來不打無準備之戰，所以無論佐助的瞳力多麼強大都會中招。

另外想一下如果是斑或者輝夜這樣的大神不知道這個別天神到底有沒有用，我估計是沒有什麼作用的，輝夜的白眼對寫輪眼具有壓制力，而輪迴眼也是寫輪眼的進化版，我相信也是對寫輪眼免疫的。

不請自來！雖說寫輪眼不怕幻術的，擁有寫輪眼的卡卡西還不是被宇智波鼬一個幻術月讀秒殺了，本來卡卡西也以為寫輪眼不怕鼬的幻術，可惜了鼬的是萬花筒寫輪眼，不是寫輪眼可以匹敵的。

在兩兄弟對決時，宇智波鼬和佐助就用幻術較量了，佐助的三勾玉對鼬的萬花筒寫輪眼，表面看起來，佐助破了萬花筒寫輪眼，真的是這樣嗎？明眼人看來，佐助根本就不能破了鼬的幻術月讀，只是鼬放水而已，不然一個月讀就秒了佐助。愚蠢的歐豆豆呀！憎恨我吧！

宇智波止水的幻術別天神對佐助有作用嗎？肯定有，不管誰中了止水的別天神，就會被控制。別天神被稱為最強幻術，本來鼬是想打算使用別天神，讓佐助回木葉村。但是別天神被自己用了，破了仙人兜的穢土轉生之術，就算宇智波佐助瞳力比鼬強，也無法抵擋最強的幻術。

別天神可以改變一個人的意志和思想，直接控制了思想。如果鼬的計劃成功，別天神肯定會起到作用，佐助也會返回木葉村。就是不知道別天神對輪迴眼起不起作用，你們覺得呢？

不是寫輪眼不怕幻術，看過火影的小夥伴都知道，每個寫輪眼覺醒的能力也都是不一樣也的，如果說寫輪眼都不怕幻術的話，讓鼬和止水怎麼混？人家萬花筒覺醒的本就是幻術，因為施術方式不一樣月讀和別天神都是非常強大的幻術。

主要還是看有沒有能力對敵人發動幻術，寫輪眼能與寫輪眼對抗是卡卡西說的，但這也不能證明有他們就不會中幻術，這都是要看他們自己的能力，團藏不是正宗的寫輪眼面對止水時他沒有中止水的別天神，不知道他是怎麼躲過別天神的，而是假裝中術才偷走了止水的一隻眼睛。

寫輪眼的幻術雖然強大，並不是說有寫輪眼就不怕幻術，而是寫輪眼洞察能力更強所以不太容易中術，如果施術者能夠抓住時機也是能夠發動幻術的，佐助與鼬戰鬥是也中了鼬的月讀用自殘的方式才得以解除，並不是瞳力強就不會中術，再說佐助的瞳力也沒有鼬的瞳力強，是他換上了鼬的眼睛才擁有了強大的瞳力。

至於別天神鼬怎麼對佐助用呀？鼬本身就有自己的眼睛，就是能施展別天神也沒有止水效果好，能力也會下降很多，畢竟那不是鼬自己的眼睛，雖然都是木葉村裡的天才止水先開啟了萬花筒，但個人感覺還是鼬的實力比止水強，如果是鼬開啟萬花筒團藏是沒有機會搶走眼睛的。

1.寫輪眼是怕幻術的。佐助和鼬生死大戰的時候，兩人就有過幻術大戰，在彼此的意識裡鬥法，當然鼬放水，當時兩人是平分秋色。

2.別天神，是最強幻術，可以在無聲無息中讓別人中招，永遠改變別人的意識。施展這個術唯一的缺陷在於查克拉，和對手瞳術的高低是沒有關係的。再者說了，從官方已給的說明來看，別天神，是最強大的瞳術。只要查克拉頂得住，就可以釋放。

3.鼬有萬花筒寫輪眼，但是，鼬穢土轉生出來以後，看到了鳴人，立刻中了別天神。這說明，別天神已經超過空萬花筒寫輪眼。寫輪眼的級別不是別天神的障礙。佐助當時寫輪眼是萬花筒，鼬已經猜到，鳴人和佐助一定會見面，並且拔刀相向，這個時候止水的別天神，會改變佐助，讓他去保護木葉。

總之，別天神不懼怕寫輪眼。

其實並不是寫輪眼不怕幻術，而是寫輪眼擁有者可以擁有具有超乎常人的洞察力，能觀察查克拉流動，能夠輕易識破幻術。所以普通人不管使用何種忍術，在寫輪眼看來都是渾身破綻，如果再加上寫輪眼擁有本身就實力強大的話，那麼想要戰勝寫輪眼就幾乎是不可能的事了。

所以即使強如大蛇丸，遇到了擁有強大瞳力的鼬都只有任人宰割的份。

但如同兩個人同時同時擁有寫輪眼，那就要看心智水平的高低，以及寫輪眼開眼的程度了。

而佐助和鼬相比，無論是心智和瞳力都差得太遠了，所以佐助根本就識不破鼬的幻術，鼬只有故意放水，佐助才能在最後戰勝他。（也有封印咒印中的大蛇丸的考慮）

那麼如果如題目所說，讓佐助的瞳力遠超鼬呢？鼬的瞳力和其實是止水不相上下的，所以佐助的瞳力超過了鼬，其實就是瞳力超過了止水。那麼佐助應該能夠識破止水的別天神了吧？

其實也不然，因為幻術的比拼不只是靠瞳力，更有心智的比拼，就看誰能騙過誰了。只要實力差距不是非常大，誰先露出破綻誰就輸了。而止水被稱成為最強幻術的“別天神”必然不是浪得虛名的。首先，別天神是止水的寫輪眼的專屬技能，而且發動一次之後要十年CD冷卻，這麼長的CD時間就足以說明這個技能的非同小可了，月讀可不需要這麼長時間的CD，所以別天神比月讀還要強很多倍。再者別天神這種幻術發動的時候無聲無息，能夠在不知不覺中改變中術的意志，實在是防不勝防的術。

在寫輪眼範疇內的瞳力應該是無法識破它的，應該只有寫輪眼以上瞳力，而且精通幻術的人才可能識破止水的別天神。所以只有大後期的佐助才有這種能力，連萬花筒寫輪眼都未必能有完全的把握，因為鼬早就考慮到了佐助會移植自己的眼睛並在擁有萬花筒寫輪眼之後與鳴人作戰的情況。所以止水的別天神應該是寫輪眼之內無敵手的。

從鳴人的情況來看仙人模式對別天神也沒法產生影響，另外別天神也讓鼬擺脫了已經進入仙人模式的藥師兜的控制，所以仙人模式也無法勝過別天神。

只有輪迴眼及以上的眼睛才對別天神有絕對的壓制效果。

完全沒有可比性，鼬比二柱子強太多，而且鼬能猜到二柱子所有的招又能剋制二柱子所有的招，而且最厲害的伊邪那美，二柱子根本不會，根本屬於碾壓式的強