形成原因有以下說法： 　　1.飲食習慣 　　有認為舍利子的形成是由於僧人長期素食，攝入了大量纖維素和礦物質，經過人體的新陳代謝，極易形成大量的磷酸鹽、碳酸鹽等，最終以結晶體的形式沉積於體內而形成。反對的說法是，世界上有不計其數的素食者，但是並無舍利子出現。 　　2.人體骨骼殘餘 　　人體骨骼在燒灼時可能會出現各種形狀的重結晶現象。人體有很多細小骨骼（如指骨、趾骨或耳道內的微小骨骼），少量骨骼經燃燒後因重結晶而產生結晶外觀的“舍利”。這種可能性是存在的。（據臺灣某佛教網站資訊：1998年他們與臺灣中科院合作分析了一位高僧的舍利子，發現主要為人骨的成分。而別的科學研究也側面證明了骨骼說。）此外，牙齒也是死者攜帶的隨葬品。牙齒的成分也包括很多無機鹽，其中牙骨質部分與骨骼成分相似，因此也有人推測牙齒是舍利子的來源。 　　3.人體結石 　　有人將舍利子解釋為結石。人體的結石中，膽結石的主要成分是大分子有機物（膽固醇、膽紅素）和少量碳酸鈣；腎結石和膀胱結石的主要成分是鈣鹽（草酸鈣、磷酸鈣）和別的礦物鹽、尿酸等。其中，後者與骨骼的無機成分（含鈣和磷酸根的無機鹽）有相似之處。但是，作為結石主要成分的鈣質和少量金屬鹽沉澱，在高溫下會變成粉末狀氧化物；其次，反對的觀點認為人體內結石數量極少，並且會導致難以忍受的劇烈絞痛，患者不可能長期忍受痛苦而不延醫求治；再者，不少結石症患者死後火化無一例有結晶體存在，況且出舍利子的高僧生前幾乎都是身體健康、安詳自在的長壽老人。 　　4.隨身物 　　舍利子的形狀千變萬化，顏色也各不相同；舍利子有的像珍珠，有的像瑪瑙和水晶；有的透明，而有的像鑽石一樣光彩照人，這樣的形態並非自然生成物。而高僧在火化的時候，有的會佩戴有生前的隨身物品，此外還有一些信徒的供奉物，這些伴隨高僧火化的物品中有許多珍貴的寶石，寶石主要組成成分就是二氧化矽。 這些東西都會隨著高僧的遺體一起進入火化爐。 在火化爐的高溫條件下，這些二氧化矽會被溶解，並與人體骨骼中的碳酸鈣發生化學反應，生成類似於骨瓷、琉璃、陶瓷之類的物品，舍利子有可能是以這樣的方式形成的。 　　5.溫度控制 　　有說法認為，相對低溫的火化才會形成舍利子，比如古代用木柴做燃料，東南亞國家使用的傳統火化爐則可以產生大量舍利花。專業人士分析過坑面式火化機與爐條式火化機焚化效果的區別，也指出還有存在礦爐渣。而近年來，許多留下舍利子的高僧大德，其實是用現代化的殯儀館用程控火化爐焚化的。所以舍利子的形成被認為和火化的溫度控制存在關係。