早期產生的抗體一般親和力不是非常的高，結合病毒的能力相對比較差，而且一開始HIV病毒增值迅速，免疫系統響應還需要一定的時間（一般認為需要一週時間啟動適應性免疫系統），這段時間足夠病毒感染非常多的細胞。

而且HIV會感染並且破壞對於適應性免疫系統至關重要的CD4+T細胞，導致輔助抗體產生的能力被極大的削減，並且在免疫系統足夠強盛的時候雖然可以清除很多遊離的病毒，但是很多病毒潛伏在T細胞中，等待此消彼長免疫不夠強的時候捲土重來。

還有一個至關重要的原因是HIV病毒極端容易變異，容易到可能每個病毒都有一點點不一樣的地方，同一個患者早上產生的病毒跟晚上的已經有了差異，這就給免疫系統清除病毒帶來巨大的挑戰，很可能根據早上的病毒生產的抗體對晚上的病毒就沒有足夠的效力了。

至於廣泛中和抗體，這的確是一個非常有希望的治療方法，某些人感染這種病毒後一直不會有疾病進展，他們可以產生能夠中和大部分變異病毒的中和抗體。究其原因，最根本的只有一點:體質特殊。人類的特異性免疫系統產生的時候伴隨著一系列體基因重排和體細胞高頻突變，這些基因本身又有著極大的多型性，不同的人攜帶不同的基因片段，進行重排與變異，有些人擁有一個特殊的基因片段使得他們可以產生一些結構稍微與其他人不一樣的抗體，其可變區CDR3區域比別人長一點，突破了病毒表面糖基化的阻礙而結合到目標蛋白。另外也有證據表明一些無進展患者產生新鮮的CD4+T細胞的能力比較強，能夠維持正常的免疫力，從而避免疾病進展。HLA分子的獨特基因型可能也幫助這些人更好的識別病毒抗原，促進適應性免疫應答。