樹化玉的保養工具很簡易，一般用棉布和軟毛刷，保養液是清水、矽化油，保養方法是按照玉的加工方式及料的特質來進行的。

1、拋光工藝加工的樹化玉：日常清理用棉布蘸清水清潔表面，不規則拐角處就用軟毛刷清理，背面未剝皮拋光處也用軟毛刷將粉塵顆粒清理乾淨，在把玩觀賞樹化玉時，需手感細膩、潤滑，無浮塵、粉粒。

2、噴砂工藝加工的樹化玉：日常清理也是同拋光類的一樣，清理完後你可以在玉的表面輕塗一層矽化油，作用目的是，在保持噴砂工藝的特質基礎上又增加了玉的光澤，使人看了倍感舒心，這時注意了，用的是矽化油，而不是食用油。

3、乾料樹化石：這種樹化石造型抽象、多樣，用棉面無法徹底清理，可以用軟毛刷加清水輕刷表面，風乾水氣再放進底座中即可，這種料也無需上油，清理乾淨即可突現樹化石的木質纖維及本身的天然造型。

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樹化玉的形成原因

在漫長的地史過程中，大片的原始森林被博大的自然力量埋葬於地下。在高壓、低溫並且無氧環境下浸泡於二氧化矽的飽和溶液中，樹木中的碳元素逐漸被二氧化矽替代，並部分保留了樹木的某些原始特徵，納入圍巖的某些礦物元素，形成繽紛的色彩，這就是矽化木，也叫做木化石。

而後漫長的地質時期，在溫壓的不斷變化中，矽化木木發生了差異的變質作用，重新結晶，主要成分轉換為蛋白石玉髓，這就是樹化玉，也叫木化玉。

具體形成的年限，因為矽化木的研究侷限，並未有完全發現。迄今為止最早的木化石是石炭紀早期的裸蕨植物化石。