在當時的形勢來說，尼布楚條約對清朝有利，而從長遠國家利益的角度來看，清朝有損。

清朝作為雅克薩戰爭中獲勝的一方，本應在談判桌上擁有更多的主動權。按照康熙皇帝的意圖，中俄兩國的邊界線劃定在勒拿河至貝加爾湖西岸一線，尼布楚，雅克薩凡經此地的一江一河均為中國領土。然而此時葛爾丹成了左右條約簽訂的最大意外因素，葛爾丹妄圖吞併喀爾喀蒙古，一統草原，恢復成吉思汗的霸業，而喀爾喀土謝圖汗被葛爾丹殺得打敗，南下投靠清朝庇護，使康熙的注意力開始向西北方向集中，正在準備簽約的索爾圖使團也因葛爾丹東擴道路受阻不得不返，談判地點改為在尼布楚進行。準格爾汗國在這時已經統一了天山南北，勢頭強勁，沙俄在其擴張的背後意提供了不少的支援，大有東並喀爾喀蒙古，與大清王朝分庭抗禮之勢。鑑於葛爾丹的巨大威脅，康熙不得不重新考慮對沙俄的邊界問題，儘快從沙俄的談判中抽身，集中精力對付野心勃勃的葛爾丹。於是他喻示談判代表在邊界問題上可稍作讓步，在雙方唇槍舌劍往來多次的基礎上，商定西以額爾古納河，北以外興安嶺為界，整個黑龍江，烏蘇里江流域廣大外東北地區包括庫頁島均為中國領土。雖然在談判中清朝因己方不瞭解沙俄底細，不懂外交談判靈活，也因兩個外國翻譯透露了清朝的底線的原因，沒能以最初的劃界方案執行，放棄了尼布楚和貝加爾湖的部分領土，但從當時西北葛爾丹大軍所向披靡，為了避免兩線作戰，先安撫住沙俄，儘快對付葛爾丹這個心腹大患，對清朝初年尚不安穩的周邊形式來說，尼布楚條約的簽訂是具有積極意義的。1690年葛爾丹兵鋒直抵烏蘭布通，此地距北京僅四百公里，京師震動，人心惶惶。可想而知，如果此時與沙俄的談判懸而未決，那麼以沙俄的擴張野心，必然會與葛爾丹沆瀣一氣，狼狽為奸，到時清朝面臨的戰爭壓力會更大。自尼布楚條約簽訂後，沙俄勢力退出外興安嶺，能到遏制，東北地區也保持了此後一百七十餘年的穩定，直到第二次鴉片戰爭。

尼布楚條約在當時來看，具有迫切性，和和平的意義。然而當我們把時空放寬到國家安全和戰略發展的高度來看，這一條約又是實實在在是一筆虧本的買賣。

逐漸惡化的邊疆形勢。條約雖然確定了中國對外東北地區的主權，但也事實↑默認了沙俄對廣大西伯利亞地區的合法佔領，甚至還屬於蒙古的尼布楚，貝加爾湖地區，清朝希望以領土滿足沙俄鯨吞蠶食的胃口，斷絕葛爾丹的支援，懷柔四方，然而沙俄卻並不是清朝眼中的知恩圖報，雖在東北無法施展，卻也在尚屬爭議的地方，繼續支援準格爾汗國，蠶食領土。這種擴張的勢頭一直持續著，直到鴉片戰爭前夕，沙俄吞併哈薩克汗國，與中國北方完全接壤，完成了對中國北部的陸上包圍，何時對中國下手，主動權掌握在俄國手中。果然在二次鴉片戰爭中，在中國焦頭爛額之時，沙俄侵略的魔爪便重新伸到了外東北，外西北，使我痛失一百五十多萬領土。

資源稟賦之地拱手讓人。廣袤的西伯利亞平原氣候嚴寒，分佈著大量的可供後世開發利用的資源，這在以農業文明為基礎的大清王朝眼中，似乎可有可無，但廣闊的領土縱深，本就是一個國家重要的戰略資源，君不見不可一世的拿破崙攻入俄國時，正是因為俄國可以擁有與拿破崙周旋的廣闊領土空間，從而把拿破崙大軍拖死在冰天雪地之中。時至今日，我們看到西伯利亞之地所發掘出的各類資源，更是無不慨嘆，號稱亞洲明珠的貝加爾湖永遠成為了華人心中之殤。

息事寧人，錯失變革。在大清一統天下，兼併蒙古的時候，世界軍事科技也在發生著巨大的變革，熱兵器開始取代冷兵器成為戰場的主宰，與俄華人的交手中，清軍在兩次雅克薩戰爭中雖取勝，但更多的是國力和人力資源的優勢，在火器方面，清朝稍嫌劣勢。尼布楚條約一經簽訂，清朝方面以為從此萬事大吉，邊界和平，卻對火器的落後和軍事革新沒有絲毫的清醒認識，雅克薩戰爭中大顯神威的無敵神威大將軍炮，在戰爭勝利後的一百多年裡沒有任何改進，直到1858年沙俄偵察外東北時發現清軍裝備的依然是雅克薩戰爭時候的老家當，這樣怎能不激起俄國的侵略野心。中俄尼布楚條約，俄國此時還是一個二流的農奴制國家，大清正當康熙王朝意氣風發之時，俄國無法與清朝在遠東向抗，而大清則認為自己戰無不勝，沒有變革圖強的動力，俄國則在彼得一世的帶領下，進行了一系列的改革，使國家擺脫落後的面貌，逐漸躋身歐洲強國之列，康熙以後的大清志得意滿，漸漸志得意滿，不思進取，滑向墮落的深淵。從這看，也可以理解為尼布楚條約反映兩個國家截然不同的發展軌道。

蘇聯成立後曾宣告，廢除之前沙皇與中國簽訂的一切不平等條約。儘管他們未踐行諾言，但我們不應該放棄領土要求，尤其不應該輕易劃定邊界，這是對中國，對中華民族不負責任。