一共有33篇，其中23個一小時特別篇，8個二小時特別篇，2個兩個半小時特別篇。具體的特別篇名稱及所在集數如下：1、一小時特別篇：鋼琴奏鳴曲《月光》殺人事件，第11集。2、一小時特別篇：霧天狗傳說殺人事件，第52集。3、一小時特別篇：柯南VS怪盜基德，第76集。4、二小時特別篇：走投無路的名偵探！連續兩大殺人事件，第96集。5、一小時特別篇：浪花連續殺人事件，第118集。6、二小時特別篇：黑暗組織來的女子 大學教授殺人事件，第129集。7、一小時特別篇：飛天密室 工藤新一最初的事件，第162集。8、二小時特別篇：二十年的殺意 新佛尼號連續殺人事件，第174集。9、一小時特別篇：詛咒假面的冷笑，第184集。10、一小時特別篇：通往迷宮的入口 巨大神像的憤怒，第208集。11、二小時特別篇：被召集的名偵探！工藤新一VS怪盜基德，第219集。12、二小時特別篇：大阪雙重謎團 浪花劍士和太閣城，第263集。13、二小時特別篇：震動的警視廳 1200萬名人質，第304集。14、一小時特別篇：威斯登堡的新娘，第342集。15、兩個半小時特別篇：與黑衣組織直面對決 滿月之夜的雙重謎案，第345集。16、一小時特別篇：怪盜基德令人驚異的空中漫步，第356集。17、二小時特別篇：甲子園的奇蹟！絕不能輸給看不見的惡魔，第383集。18、兩個半小時特別篇：黑色衝擊！組織魔爪伸來的瞬間，第425集。19、一小時特別篇：本廳刑事戀愛物語 虛假的婚禮，第449集。20、二小時特別篇：和服部平次共度的3天，第479集。21、一小時特別篇：金昆羅劇場Wraith，第452集。22、一小時特別篇：本廳警官戀愛故事7 左手的無名指，第487集。23、一小時特別篇：電視臺的惡魔，第488集。24、一小時特別篇：法庭的對決Ⅲ 目擊者是檢察官，第489集。25、一小時特別篇：服部平次VS工藤新一 滑雪場的推理對決，第490集。26、一小時特別篇：怪盜基德的瞬間移動魔術，第515集。27、一小時特別篇：風林火山 迷宮的鎧甲武士，第516集。28、一小時特別篇：殺人犯 工藤新一，第521集。29、一小時特別篇：新一的真實身份與小蘭的眼淚，第522集。30、一小時特別篇：柯南VS平次 東西偵探推理對決，第651集。32、一小時特別篇：柯南與海老藏 歌舞伎十八番之謎上集，第804集 。33、一小時特別篇：柯南與海老藏 歌舞伎十八番之謎下集，第805集 。特別篇之《柯南與海老藏 歌舞伎十八番之謎》講述柯南和小五郎結識了喜歡奇妙事件的歌舞伎演員市川海老藏。在那之後，海老藏在舞臺上使用的文物級道具二表之面被盜了。同時，相關者的遺體被發現，柯南和海老藏一起協力找出犯人。海老藏展現了演員特有的洞察力和不輸給柯南的名推理，而且在柯南陷入危機的時刻不顧危險大力相助的故事。