新一變柯南TV1-2集
新一暗中觀察的毛病始終改不了，這一次不走運的新一看見了神秘組織和某公司社長進d行秘密交易，看的正起勁的時候不料被後面來的琴酒當頭一悶棍幹趴下，變小後的新一來到了阿笠博士這裡，說明原委後博士相信了他，不料小蘭的突然造訪，情急之下的新一急中生智，以江戶川柯南的身份矇混過關。
服部識破柯南身份TV59-60集
透過細心的觀察和推理，服部還是懷疑柯南的身份，作死的柯南把麻醉槍對準了服部，醒來的服部發現事情並不簡單，威逼利誘下，柯南道出了實情。兩人正式成為好基友。
雪莉出場TV135-141集
琴酒利用明美搶劫玩十億元后便殺死了明美，雪莉對這件事耿耿於懷，組織也沒有給一個明確的說法，雪莉以停止研究為要挾，後被組織關押起來等待發落，期間雪莉偷偷服下了私藏的A藥，逃出去的雪莉也是來到了阿笠博士這裡，被博士發現後收養，化名為灰原哀。中間灰原對柯南說了一句很意味深長的話：工藤，我想你從來沒想過吧，半世紀前你已經在我們組織進行的秘密計劃中，已經有很大關聯了。期待青山最後能填上這一個坑。
再會琴酒TV176-178
琴酒接到組織的任務殺掉吞口議員，期間灰原和柯南發現了琴酒的車子保時捷356A，柯南在車上裝上了竊聽器，上車不久後，琴酒就發現了竊聽器和一根啡色的頭髮，啊！雪莉！匹斯可順利的殺死了吞口議員的同時也發現了灰原哀的真實身份，灰原被帶到一個酒窖裡，後來經過柯南的指點，灰原暫時恢復了身體逃到了屋頂，卻不料琴酒早已等候多時。啊！雪莉！趕來救援的柯南一針射向了琴酒，灰原趁機從煙囪逃回酒窖。
人魚篇TV241-243集
這一系列看似平常，實則不然，我認為這是青山挖下的一個大坑，至今還沒填上。柯南一家和服部兩口子來到了人魚島觀光，期間接二連三的發生命案，柯南調查名冊的時候發現了宮野志保的名字，其中還有黑澤陣和魚冢三郎的名字，有網友猜測，這兩個名字就是琴酒和伏特加的真名。
紐約篇TV308-310集
新一和小蘭救下了假扮成殺人魔的貝爾摩德，這也為以後滿月篇貝姐放過柯南埋下伏筆。
板倉卓的日記TV332-336集
半倉做受到組織的威脅，要求其開發出一種未知軟體，但是板倉卓說為了全人類，自己不能開發這種軟體，期間板倉卓和貝爾摩德有一段意味深長的對話，我們既是上帝也是惡魔，我們要逆轉時間的洪流，讓死人復活。這是青山挖下的又一大坑。軟體是什麼？要復活的死人是誰？軟體和長生不老有什麼關係？等待青山為我們填坑吧。
宮野志保的錄音帶TV363-366集
貝姐發現灰原哀的真實身份，灰原哀在廁所裡找到了宮野艾蓮娜留下的錄音帶。重點是錄音帶的內容，錄音帶的前18卷提到了愛蓮娜正在研究一種藥物，什麼藥呢？大機率就是A藥，剩下的兩卷還為出現，我猜測就是愛蓮娜說的關於自己的事情。宮野夫婦難道真的死亡了？
滿月篇TV371-375集
朱蒂發現了貝爾摩德就是沙朗溫亞德，想借此除掉她，卻不料被貝姐反打一波，命懸一線的時候，赤井秀一出來向貝姐開了一槍，雖說有防彈衣的保護，但還是被打斷了三根肋骨。情急之下的貝姐挾持柯南逃跑，柯南在身上裝了收訊裝置，監聽到貝姐和BOSS聯絡的郵箱聲音。貝姐發現後用催眠瓦斯讓柯南睡著，而自己這用手槍打自己保持清醒，柯南醒來後發現裝置都被破壞，而身上則蓋著貝姐的衣服。啊！貝姐啊，比有希子對柯南還好。
黑色的衝擊TV459-463集
組織成員水無憐奈、基安蒂、科恩出場，暗殺任務被柯南、FBI阻止。
黑色的影子TV502-505集
貝爾摩德去水無憐奈出事目擊者家，得到柯南注意；瑛祐在到毛利偵探事務所做客時有意無意的把話題引向水無憐奈，並希望柯南等人前去調查，引起了柯南的警覺。
紅黑篇TV538-551集
非常非常經典的一個主線篇，水無伶奈執行任務返程後出車禍被FBI救下，期間發現水無伶奈的真實身份是CAI的成員，是在黑衣組織的臥底，也確認了本堂瑛佑和水無伶奈是姐弟關係。琴酒盡力了，沒法打！琴酒設計找到了水無伶奈並且最終成功營救水無伶奈，但是回到組織的水無伶奈似乎被懷疑忠誠度，於是琴酒要求她約出赤井秀一併殺死他，水無伶奈按照要求殺死了赤井秀一。（這也是柯南的設計）
列車篇TV753-756集
組織發現雪莉乘坐了這一趟的列車，並計劃殺死雪莉，派出貝姐和波本來執行這一次任務，但滿身是掛的柯南早就看穿了這一切，聯絡怪盜基德假扮雪莉，期間柯南一行人救下灰原哀。列車到站之後，貝姐發現雪莉還活著，但是貝姐並沒有向上報告，波本也開始懷疑赤井秀一死亡的真實性！
世良真純巧妙的安排TV812-813集
世良有意讓柯南看到自己與一位神秘少女的合影。少女身體虛弱，與世良相像，要求世良稱其為“領域外的妹妹”。
緋色篇TV779-783集
非常關鍵的主線篇，上承列車紅黑篇，下接朗姆篇。波本為了驗證自己的懷疑，聯手貝姐調查赤井秀一假死的事情，波本的疑慮得到了驗證，赤井秀一確實還活著，但並不知道就是以衝矢昴。緋色篇的結尾出現了經典的紅茶遊戲，三個骷髏頭杯墊最後都消失了。這麼大一個主線篇在結尾放這麼一個橋段必有用意，最後赤井秀一展示了水無伶奈發來的RUM的訊息。
領妹出場TV839-840集
擴充套件資料：
劇情簡介
高中生偵探工藤新一和青梅竹馬的同學毛利蘭一同去遊樂園玩的時候，目擊了黑衣男子的可疑交易現場。只顧偷看交易的工藤新一，卻忽略了從背後接近的另一名同夥。他被那名男子灌下了毒藥，當他醒來時，身體居然縮小了！
如果讓那些傢伙知道工藤新一還活著的話，不僅性命難保，還會危及身邊的人。在阿笠博士的建議下他決定隱瞞身份，在被小蘭問及名字時，化名江戶川柯南，為了蒐集那些傢伙的情報，寄住在父親以偵探為業的小蘭家中。
謎團重重的黑衣組織……他所瞭解的，就只有他們是以酒的名稱作為代號的。為了揭露那些傢伙的真面目，小小偵探江戶川柯南的活躍開始了！
新一變柯南TV1-2集
新一暗中觀察的毛病始終改不了，這一次不走運的新一看見了神秘組織和某公司社長進d行秘密交易，看的正起勁的時候不料被後面來的琴酒當頭一悶棍幹趴下，變小後的新一來到了阿笠博士這裡，說明原委後博士相信了他，不料小蘭的突然造訪，情急之下的新一急中生智，以江戶川柯南的身份矇混過關。
服部識破柯南身份TV59-60集
透過細心的觀察和推理，服部還是懷疑柯南的身份，作死的柯南把麻醉槍對準了服部，醒來的服部發現事情並不簡單，威逼利誘下，柯南道出了實情。兩人正式成為好基友。
雪莉出場TV135-141集
琴酒利用明美搶劫玩十億元后便殺死了明美，雪莉對這件事耿耿於懷，組織也沒有給一個明確的說法，雪莉以停止研究為要挾，後被組織關押起來等待發落，期間雪莉偷偷服下了私藏的A藥，逃出去的雪莉也是來到了阿笠博士這裡，被博士發現後收養，化名為灰原哀。中間灰原對柯南說了一句很意味深長的話：工藤，我想你從來沒想過吧，半世紀前你已經在我們組織進行的秘密計劃中，已經有很大關聯了。期待青山最後能填上這一個坑。
再會琴酒TV176-178
琴酒接到組織的任務殺掉吞口議員，期間灰原和柯南發現了琴酒的車子保時捷356A，柯南在車上裝上了竊聽器，上車不久後，琴酒就發現了竊聽器和一根啡色的頭髮，啊！雪莉！匹斯可順利的殺死了吞口議員的同時也發現了灰原哀的真實身份，灰原被帶到一個酒窖裡，後來經過柯南的指點，灰原暫時恢復了身體逃到了屋頂，卻不料琴酒早已等候多時。啊！雪莉！趕來救援的柯南一針射向了琴酒，灰原趁機從煙囪逃回酒窖。
人魚篇TV241-243集
這一系列看似平常，實則不然，我認為這是青山挖下的一個大坑，至今還沒填上。柯南一家和服部兩口子來到了人魚島觀光，期間接二連三的發生命案，柯南調查名冊的時候發現了宮野志保的名字，其中還有黑澤陣和魚冢三郎的名字，有網友猜測，這兩個名字就是琴酒和伏特加的真名。
紐約篇TV308-310集
新一和小蘭救下了假扮成殺人魔的貝爾摩德，這也為以後滿月篇貝姐放過柯南埋下伏筆。
板倉卓的日記TV332-336集
半倉做受到組織的威脅，要求其開發出一種未知軟體，但是板倉卓說為了全人類，自己不能開發這種軟體，期間板倉卓和貝爾摩德有一段意味深長的對話，我們既是上帝也是惡魔，我們要逆轉時間的洪流，讓死人復活。這是青山挖下的又一大坑。軟體是什麼？要復活的死人是誰？軟體和長生不老有什麼關係？等待青山為我們填坑吧。
宮野志保的錄音帶TV363-366集
貝姐發現灰原哀的真實身份，灰原哀在廁所裡找到了宮野艾蓮娜留下的錄音帶。重點是錄音帶的內容，錄音帶的前18卷提到了愛蓮娜正在研究一種藥物，什麼藥呢？大機率就是A藥，剩下的兩卷還為出現，我猜測就是愛蓮娜說的關於自己的事情。宮野夫婦難道真的死亡了？
滿月篇TV371-375集
朱蒂發現了貝爾摩德就是沙朗溫亞德，想借此除掉她，卻不料被貝姐反打一波，命懸一線的時候，赤井秀一出來向貝姐開了一槍，雖說有防彈衣的保護，但還是被打斷了三根肋骨。情急之下的貝姐挾持柯南逃跑，柯南在身上裝了收訊裝置，監聽到貝姐和BOSS聯絡的郵箱聲音。貝姐發現後用催眠瓦斯讓柯南睡著，而自己這用手槍打自己保持清醒，柯南醒來後發現裝置都被破壞，而身上則蓋著貝姐的衣服。啊！貝姐啊，比有希子對柯南還好。
黑色的衝擊TV459-463集
組織成員水無憐奈、基安蒂、科恩出場，暗殺任務被柯南、FBI阻止。
黑色的影子TV502-505集
貝爾摩德去水無憐奈出事目擊者家，得到柯南注意；瑛祐在到毛利偵探事務所做客時有意無意的把話題引向水無憐奈，並希望柯南等人前去調查，引起了柯南的警覺。
紅黑篇TV538-551集
非常非常經典的一個主線篇，水無伶奈執行任務返程後出車禍被FBI救下，期間發現水無伶奈的真實身份是CAI的成員，是在黑衣組織的臥底，也確認了本堂瑛佑和水無伶奈是姐弟關係。琴酒盡力了，沒法打！琴酒設計找到了水無伶奈並且最終成功營救水無伶奈，但是回到組織的水無伶奈似乎被懷疑忠誠度，於是琴酒要求她約出赤井秀一併殺死他，水無伶奈按照要求殺死了赤井秀一。（這也是柯南的設計）
列車篇TV753-756集
組織發現雪莉乘坐了這一趟的列車，並計劃殺死雪莉，派出貝姐和波本來執行這一次任務，但滿身是掛的柯南早就看穿了這一切，聯絡怪盜基德假扮雪莉，期間柯南一行人救下灰原哀。列車到站之後，貝姐發現雪莉還活著，但是貝姐並沒有向上報告，波本也開始懷疑赤井秀一死亡的真實性！
世良真純巧妙的安排TV812-813集
世良有意讓柯南看到自己與一位神秘少女的合影。少女身體虛弱，與世良相像，要求世良稱其為“領域外的妹妹”。
緋色篇TV779-783集
非常關鍵的主線篇，上承列車紅黑篇，下接朗姆篇。波本為了驗證自己的懷疑，聯手貝姐調查赤井秀一假死的事情，波本的疑慮得到了驗證，赤井秀一確實還活著，但並不知道就是以衝矢昴。緋色篇的結尾出現了經典的紅茶遊戲，三個骷髏頭杯墊最後都消失了。這麼大一個主線篇在結尾放這麼一個橋段必有用意，最後赤井秀一展示了水無伶奈發來的RUM的訊息。
領妹出場TV839-840集
擴充套件資料：
劇情簡介
高中生偵探工藤新一和青梅竹馬的同學毛利蘭一同去遊樂園玩的時候，目擊了黑衣男子的可疑交易現場。只顧偷看交易的工藤新一，卻忽略了從背後接近的另一名同夥。他被那名男子灌下了毒藥，當他醒來時，身體居然縮小了！
如果讓那些傢伙知道工藤新一還活著的話，不僅性命難保，還會危及身邊的人。在阿笠博士的建議下他決定隱瞞身份，在被小蘭問及名字時，化名江戶川柯南，為了蒐集那些傢伙的情報，寄住在父親以偵探為業的小蘭家中。
謎團重重的黑衣組織……他所瞭解的，就只有他們是以酒的名稱作為代號的。為了揭露那些傢伙的真面目，小小偵探江戶川柯南的活躍開始了！