理念不同。彌勒的死完全改變了長門和小南。和自來也的理念衝突比較嚴重，而且自來也對長門和小南的瞭解也容易變成破綻。

在火影迷心中，一直有一個無法釋懷的人，就是自來也，自來也與綱手都以經熬了那麼久，之後自來也為了調查情報，主動去雨隱村，調查曉組織。

自來也在打算離開時，找綱手喝酒，並且準備向綱手訴說心結，也就是表白最後忍住了沒有說，綱手明白了自來也的意思，與自來也打賭，逢賭必輸的綱手，為了自來也能平安歸來，打賭說自來也不會回來，然而自來也真的沒有回來。

之後綱手在佩恩襲擊木葉的戰鬥中，查克拉消耗過度，最後昏迷，這其中必然有自來也離去的悲痛，作為火影的綱手無法訴說，但是你內心一定悲痛至極。

自來也到了雨隱村，簡單波折後，直接遇到了六道佩恩，長門對小南說，不能讓自來也知道，否則他可能也打不過，最終自來也刺探到了佩恩的秘密，但是也搭上了性命。

我覺得這與長門個人經歷有關，佩恩經歷過戰爭，在他接受某人的思想後，他更加意識到結束戰爭才是帶來和平的目的。方式是一種理想加體驗的選擇，曉所選擇的和平方式，在外人看來是荒唐和危險的，不可接受。

長門想利用自己的勢力解決忍界的戰亂，簡而言之就是以暴制暴，自來也顯然是不會答應的，所以這次長門發動了進攻形態的佩恩和自來也戰鬥。

自來也為了調查曉組織頭目的真相，利用蛤蟆來到了雨忍村，一番調查後，發現雨忍村的首領山椒魚半藏已經死了，佩恩成為了新的首領，懷著好奇心，自來也用一個人引出了小南，隨後一個佩恩出現在了自來也的面前，因為是長頭髮還有輪迴眼，自來也將他誤以為是長門。自來也問長門為什麼發動戰爭，長門說想利用自己的強大能力毀掉世界，這樣的話人們就為了維持生計不再發動戰爭，會變得互幫互助，這一點直接遭到了自來也的反對。

兩人一番戰鬥後，自來也決定發動仙人模式和徒弟作戰，長門也是召喚了另外兩個佩恩，這次他們三個人有各自的系統能力，自來也的所有忍術被佩恩吸收，在忍術無效的情況下一對三非常棘手，在撤退的過程中，自來也在蛤蟆仙人的建議下使用幻術，本以為這樣就結束了，沒想到後面又出現了一個佩恩將自來也的手臂打斷，直接飛出了十幾米，自來也隨後明白了佩恩的真面目，但是喉嚨被毀無法發聲，他在蛤蟆背上留下了暗號，最後屍沉入大海。

佩恩殺死自己的師傅，不意味著他失去人性；一切的評判都會在結局面前被揭示。好與壞不是目的，是一份藉口。如果有一方是壞人，自己可以充當好人，那麼就去阻止壞人做壞事，而壞人為了達到目的會不擇手段，究竟誰才能維護真理與和平，就看誰更厲害。弱者是沒資格評斷是非的，當他想參與角逐時，他已經是個強者了。火影是在為信念而戰，為繼承意志所做的努力。

第一次相遇。

自來也在第二次世界大戰中在雨隱村遇到戰爭的孤兒彌彥、長門、小南三人，出於善良同情的自來也便留下來教三人忍術，並幫助他們樹立正確的三觀，一教便是三年，三年來師徒四人建立了深後的情誼，三人在自來也的教導下，忍術得到了很好的提升，也樹立了良好的三觀，能在雨隱村獨立生存了。然後自來也便放心的回到村裡。

三人遭遇。

經過自來也三年的苦心教導下，三人的綜合能力有了質的提升。在以彌彥為首的三人還建立起了“曉”組織，組織的目的在於促進和平，然後組織漸漸強大，大到引起了山椒魚半藏的注意，甚至危及半藏的利益。於是半藏藉口與“曉”談和平，半路埋伏將“曉”組織一網打盡，“曉”組織首領彌彥受威脅走向長門手中的劍自殺身亡，然半藏並未有放走小南和長門的意思，抱著趴在自己身上的彌彥的屍體，悲憤難平的長門，輪迴眼覺醒，召喚出外道魔像，將半藏的小兵全殺死，半藏見狀逃走。長門也能成功救下小南，帶走彌彥的屍體。

經過此次遭遇，曾經至親至愛的患難三人組死了一個彌彥，彌彥還是長門的領導者、引路人（偶像），這對長門的打擊過大，使長門意識到靠嘴靠談是實現不了和平的，只能武力解決。長門重鼓旗幟，招兵買馬，並將彌彥的屍體做成了天道佩恩，殺了半藏，一舉拿下雨隱村。彌彥死後，長門的三觀可能也受到帶土的影響，所以“曉”漸漸發展成僱傭兵的恐怖組織。

再次相遇。

自來也獨自前往雨隱村調查“曉組織”，並在雨隱村遇到了小南和彌彥（天道佩恩），儘管在戰鬥過程中，自然也嘗試想說服小南和長門，但兩人的遭遇使他們覺得當初自來也教育他們的是錯的，可能心裡甚至將彌彥的死或多或少的怪在自來也頭上。長時間的不聯絡、彌彥的死、帶土的洗腦，使得小南和長門的三觀已經發生了翻天覆地的變化，與自來也所教導的完全背道而馳，所謂“道不同，不相為謀”，並且自來也所行的道則是阻礙二人的道，要想實現自己的道，就必須得清除自己道上的一切障礙物——自來也等阻礙物，因此即便是師生情誼再深，為了死去的彌彥，為了完成三人的夢想，為了踐行自己的道，只能殺了自來也。

火影忍者中，自來也作為長門等人情深義重的師父，為什麼長門與小南能忍心殺死他？

立場不同

在經歷彌彥的死亡之後，長門對以前的觀念產生了分歧，他意識到自己之前所一直追求的答案根本一文不值，因此只要這個的規則還是如此，那麼世人根本還是不會珍惜和平，而世界也還是不會真正的和平。

之後的劇情中，長門便開始收集尾獸，準備製造尾獸武器，強大的武器可以瞬間滅掉一國，這樣人們才會在痛苦之中，從而真正的更加珍惜和平，只有理解痛苦，才會讓世人意識到和平的重要！

回到主題，對於自來也的死，這是必然的

曉組織中後期在各大忍村抓捕尾獸，這個事情已經是傳來了，在者其它忍村的人柱力也已經被抓：我愛羅，芙等人柱力的被抓，以及八尾在雲隱受到了攻擊，那麼下一個目標很可能就是鳴人了！

因此，自來也這才會前往雨隱村調查佩恩的情報，之後這才有了一系列的事情！

對於長門來說，自來也這個曾經教導他們生存，讓他們在亂世之中有了保命的技能，長門等人長大之後也是一直遵循著自來也的教導，然而在彌彥死後，這時的長門對於世界的看法已經改變，因此才走上這條路！

那麼對於自來也，前來雨隱村調查佩恩，在被小南發現之後，這時的自來也已經是和長門形成了對立的關係，哪怕是曾經情深義重的老師，在長門的宏願面前也是不值一提的，在長門看來，改變世界註定會有人犧牲！

當然長門的心中還是有著一絲的不忍，不然入侵木葉之後，鳴人還是依靠著自己的“嘴遁”將其說服~