實際不是問題所述這樣的。基因突變多數是無效的或中性的對編碼蛋白的功能無任何影響，因‘突變發生在非編碼區非表達調控區，這種基因突變不是進化，另一類突變發生在編碼區或調控區可能使編碼蛋白功能下降或喪失正常功能，這種突變不能使機體更好適應環境，則應稱為退化，有可能在傳代中被環境逐漸淘汰。只有當突變結果使蛋白質的有益功能變好變強才是進化，這類突變可使個體在環境選擇中更有生命力更有優勢，這種突變經過積累才能達到進化效果。

僅僅基因突變不算進化，這只是進化之所以會發生的自然基礎。提問，蜘蛛俠是進化嗎？答案見文末。

為什麼地球上的萬千物種是從少量甚至一種生物進化而來，而不是由某不知名存在直接創造出萬千物種？原因就在於生物體在遺傳時，不可避免地會出現各種各樣的基因突變，在初期這些突變了的基因，和原版相比，必然有些突變比原版更好，有些突變比原版更差。

圖示：遺傳的秘密還未完全解開。尤其是基因和基因之間錯綜複雜的關係。因此，在這裡我們談論基因突變和進化時，都採用最簡單的模型。即一個基因的變化，就會引發巨大後果的那種基因突變。

是對擁有這些基因的個體而言，是提高了生存和繁衍的可能性，還是降低了可能性。

圖示：鷹眼的視力極其驚人，它眼睛中視杆和視錐細胞的密度可能是人類的五倍，能看到遠在約一英里外（1.6公里）兔子的輕微活動。

由於視力對老鷹極其重要（對人來說就沒那麼重要），因此我們可以推理，如果一個基因突變增強了視力，比如增加了視杆和視錐細胞的密度或者改善了這些細胞間的連線，又或者提高了大腦中的視覺中樞運作效率，其外在表現都是改善了視力。

圖示：感光的視杆和視錐細胞越多，感受到的影象就越精細，這意味著遠方的微小影象也能被分辨，這就像手機拍照時畫素越多拍出的照片就精細，螢幕畫素越多，高畫質圖片顯示在螢幕上就越順眼。

那麼我們就可以合乎邏輯的推斷，擁有這個基因突變的老鷹個體，那麼它的生存和繁衍的機率都會因該基因突變得到提高。反之如果一個基因突變削弱了視力，那擁有這種糟糕基因的老鷹，恐怕前途堪憂，就算餓不死，在未來爭奪配偶的時候也會因為不夠強壯而失敗。即便是隻母鷹，它可能也找不回足夠的食物來餵養孩子，當然您也可以假設是另一種同樣高度依賴視力生存的鳥兒，但是在哺育幼鳥期間，雌鳥不需要自己出門找食物，當這種不良基因突變發生在雌鳥身上時，是否就沒那麼糟糕了呢？比如，全靠雄鳥餵養的犀鳥，但這也解決不了問題，因為繼承了它那糟糕視力基因的兒子們，在未來會在生存和繁衍上吃虧。

對於影響生物體同一性狀的基因之間即可能是合作關係，也可能是競爭關係，但不管是合作還是競爭關係，一個更好的基因的生存和繁衍機率上總是超過那些不太好的基因。就像打遊戲的人常調侃的一句話，不是對手太強大，全因為我們擁有一個豬隊友。

當然，這種說法是一種極端簡化的說法，現實要複雜得多，充滿偶然因素。要完整表述，就會讓表達變得極其冗長繁瑣，比如它身體中的其它基因保持不變，不能同時擁有另一個糟糕基因甚至致死基因，並且它還得順利長大等等，簡言之除了這一個增強視力的基因突變之外，它在別的方面都是一隻中規中矩的老鷹，在成長、生存和繁衍方面都擁有中規中矩的幸運或不幸。

只要滿足這樣的條件，那我們就可以認定它因該基因能獲得更強的生存和繁衍的可能性，而由此造成的結果就是，繼承了它這個突變的基因後代的後代的後代的後代的後代，將在群體中佔據越來越多的比例，最終整個群體中大多數甚至所有個體都擁有了這個基因，那麼我們就說老鷹進化了，現在它們的平均視力，超過了一千年前或一萬年前的老鷹。如果個體基因突變，並未影響到群體的未來，那麼這種突變就只是突變而已，談不上是一種進化。

那麼這種不同就將成為生物進化的基礎，隨著時間的流逝，那些擁有不利於生存的基因個體，那些擁有不利於繁衍的基因的個體，它們身體中的基因就無法代代相傳，最終會絕種。相反那些擁有更適合生存更適合繁衍基因的個體，就更有機會將這些適合生存和繁衍的基因遺傳下去，最終在基因的競爭中，這些基因勝利而另一些基因失敗，其結果就是將生物體塑造得越來越擅長生存，越來越擅長繁衍，從旁觀者的角度來說這樣的生物體將近乎於“完美”。

達爾文是怎麼推出進化論的，這是因為他意識到了下列事實：

1、並非所有個體都能生存和繁衍，事實上在進入現代文明之前，人類的孩子中都有1/2~1/4比例活不過五歲，就在百年前，哪家哪戶不死幾個孩子。在大自然中哪怕是獅子、老虎這樣的食物鏈頂端強者的幼子成活率也不高。

2、個體和個體之間總是存在大量差異

3、而這些差異中肯定有一些是可以遺傳的

4、如果這些可以遺傳的差異，能夠影響生物體在生存和繁衍上的機率，哪怕只是很細微的影響，比如升高或降低1%乃至更小的差異，但在經過多代之後，這些細微的影響終將積累起來，造成巨大的差異。總結起來就是優勝劣汰適者生存（繁衍）。

5、在經歷漫長的時間後，各種有利於生存和繁衍的細微的差異累積起來，最終就可能導致物種進化，從百萬年前的某個物種，變為百萬年後的另一物種。

達爾文因此回答了，（新）物種是如何起源的這樣重大生物學問題。

不可避免的個體基因突變，本身還不是進化，僅僅只是生物進化的原材料，要成為真正的進化，還得在一個相應的環境中，表現出更強的生存能力，並最終收穫超過或遠超過平均值的後代數量，這樣的基因突變才是進化。否則就僅僅是基因突變罷了。

地球生命史就是由個體的基因突變+自然環境的變遷（包括各種劇烈的地質活動以及天災），兩者共同作用，篩選出了各種各樣適合各種生存環境的獨特物種，由此塑造出地球生態系統和地球生命不可重複的獨特進化史。

圖示：人類馴養某種狼，人工選擇其特定的基因突變個體——並非所有突變都會被人親睞——最終塑造了狗這一亞種。那些被淘汰的基因突變，就和進化無關了。

當且僅當蜘蛛俠的後代也是蜘蛛俠，並且蜘蛛俠的後代越來越多，最終全人類都變成了蜘蛛俠時，蜘蛛俠才代表著人類的進化的方向！