海綿狀血管瘤的具體發病原因還不清楚，大多數學者認為海綿狀血管瘤的病因是在胚胎髮育過程中，特別是在早期血管性組織分化階段，由於其控制基因段出現小範圍錯構，而導致其特定部位組織分化異常，並發展成海綿狀血管瘤。

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也有學者認為是毛細血管組織感染後變形，導致毛細血管擴張，血管組織區域性壞死後血管擴張形成空泡狀，其周圍血管充血擴張致使區域性血迴圈停滯致，最終形成海綿狀血管瘤。 海綿狀血管瘤實際是一種先天性血管發育畸形，介於錯構瘤和真性腫瘤兩者之間。據研究表明以下因素可能誘發血管瘤的發生： 1、遺傳因素。嬰兒患者和家族史支援先天性來源的假說，近年來研究證明海綿狀血管瘤為不完全外顯性的常染色體顯性遺傳性疾病，但該說法還有待進一步驗證。 2、婦女在懷孕期間，受到環境汙染，藥物刺激及不良因素導致胚胎3個月內血管網異常增生擴張。比如因為某些疾病因素而使用過一些激素類的藥物，所以造成雌性激素水平增高。 3、環境汙染及食物因素。如果經常吃的一些人工養殖的海鮮、肉類食品等，會加大血管瘤出現的風險。人工養殖飼料大部分都含有雌激素即人們通常理解的避孕藥物，激素的作用可以使動物成熟的週期減短。 4、外傷因素。認為常規放療、病毒感染、外傷、手術、出血後血管性反應均可誘發海綿狀血管瘤。 如果發現海綿狀血管瘤要及時治療，以免其給身體帶來不良影響。