在軟組織上B超有優勢，如陰性結石，鈣化上CT有優勢，如陽性結石。但總的來說，CT檢查影象直觀 還有造影劑掃描對比，CT檢查的好處大於B超，特別是在骨骼和肺部檢查。但有輻射對人體有害，看醫生看重什麼方面，每個裝置都是各有優勢和侷限性。

首先，如果單從清晰度來說，毫無疑問，CT的清晰度是要遠遠高於B超的。

但是，是不是說因為清晰度高，CT就完全可以代替B超了呢？當然不是，因為“尺有所短，寸有所長”。CT和B超作為目前臨床應用最為廣泛的檢查，一定是各有其“拿手絕活的”。

先來看B超，其最大的弱點就是怕空氣（超聲波難以在空氣裡傳播）和噪點大（就是不清晰，有點像訊號不好時的老式黑白電視機的影像）。但是B超對液體很敏感，若體腔或組織裡有積液，很容易被其檢測到。另外，B超沒有輻射，對胎兒發育沒有影響，是孕婦（尤其是早孕）檢查的首選檢查手段。最後，B超很便宜。

再來看CT。CT最大的弱點就是輻射，另外比B超貴。但是其也有B超不可比擬的優勢，那就是可以穿透體內所有的組織並且顯影清晰。這就是腦外傷還有急腹症的病人首選檢查就是CT。並且隨著科學技術的發展，現在還有增強CT、CTA（動脈成像）以及三維重建等檢查，對相關疾病的診斷起到重要甚至關鍵的作用。