作為甘苦與共的夫妻，馬皇后是很瞭解朱元璋性格的，他往往在憤怒的情況下做出一些衝動的決定。只要馬皇后知道，就會勸諫朱元璋，消減了他的一些殺戮行為。

參軍郭景祥和兒子有矛盾，有人向朱元璋報告：“其子持矟欲殺父。”朱元璋聽了大發雷霆，說“必誅此子”。馬皇后勸他說，這個傳言恐怕不實，何況老郭只有這一個兒子，萬 一殺之不實就是冤案，還絕了他的後代。朱元璋派人一查，果然不實。後來他對馬皇后說：“非汝見之明，吾幾殺其子矣。”

宋濂是明初的功臣，又是太子的老師，朱元璋原先對他恩禮有加，後來宋濂的孫子宋慎參與胡惟庸案，宋濂也受到牽連，朱元璋要殺他。馬皇后竭力勸諫說，民間請一個老師，還始終不忘恭敬，宋先生教育太子和其他皇子，怎麼能忍心殺呢？再說宋先生在家裡待著，怎麼會知道朝廷的事情？朱元璋聽了還是不肯採納。到了吃飯的時候，馬皇后特意不置酒肉，朱元璋問是怎麼回事，馬皇后說這是給宋先生作福事，也就是要用皇上吃的酒肉來祭神，保佑宋濂，這樣朱元璋才赦免了宋濂的死刑，改流放茂州。

在朱元璋的心裡，朕言即是法，他有一次動怒要對宮人治罪，馬皇后也對他動怒，把宮人交給宮正司處理。馬皇后對他說，帝王不要因為喜怒加刑賞；人發怒的時候，就容易偏激，還是交給司法機關處理才公正。朱元璋反問，那你也不是動怒了？馬皇后說，我的怒正是為了解你的怒的。

明初的開國功臣，在朱元璋艱難創業中，是風雨同舟，患難與共的。他們有的運籌帷幄，有的搏命疆場，對明朝的建立，都有一份功績。朱元璋開始對他們也是待之以禮，授以高位，等到皇帝的寶座安穩之後，他不僅忘記了以往那創業的艱難歲月，反而對功臣大肆屠戮。

在馬皇后死的前兩年，發生了胡惟庸案，被誅殺、株連的人有五萬左右。馬皇后看到這些，也預感到朱元璋將來會大開殺戒，所以在病危臨死前，情意深長而又言詞殷切地對朱元璋說：“夫妻相保易，君臣相保難。”她叮囑朱元璋：“陛下既不忘妾於貧賤，願毋忘群臣百姓於艱難。”

馬皇后的遺言說起來也很簡單，她就是希望朱元璋能施行仁政，不要妄殺。可是，這個遺言在失去馬皇后的朱元璋那裡，沒有起到什麼作用。馬皇后死後十一年，即洪武二十六年，又發生了大將軍藍玉之獄，“坐死黨者，可二萬人”。開國的功臣名將，幾乎殺戮殆盡。所謂“金盃同汝飲，白刃不相饒”，朱元璋是說到也做到了。

明太祖朱元璋之妻孝慈高馬皇后是歷史上最知名的賢后之一，也是真正做到心懷蒼生母儀天下的皇后。她天性善良，不管對待士大夫階層還是有罪之人，都有一顆博愛慈悲的心懷。因此她去世後，不僅朱元璋大病一場，連老百姓和普通宮女都對馬皇后懷念不已，南京至今還流傳著許多馬皇后的傳說。以下是史書記載的馬皇后虎口拔牙救人的部分事蹟。

1，參軍郭景祥鎮守和州，有人告密說他的兒子不孝，拿著槊驅趕他，朱元璋聽後大怒，決定殺了小兔崽子。馬皇后從容分析：“郭景祥只有一個孩子，獨生子女是嬌慣些，但還不至於如此。而且陛下殺一人就會迅速讓郭景祥斷絕後代，別人告密的也許不是實際情況，為什麼不考察後再做決定呢。”朱元璋認真瞭解情況後，發現郭景祥兒子果然是冤枉的，感嘆道，如果沒有聽皇后的話，就無故讓郭景祥絕了後。

2，朱元璋的義子李文忠守衛嚴州，楊憲誣告他不遵守法律，朱元璋決定臨時換將讓李文忠守揚州。馬皇后說，文忠一向賢德，他的行為足以讓人信服，我不相信他會做出這種事，臨時更換將領恐怕會失去人心。而且現在面臨敵方壓境的情況，也不是可以更換將領的時候。朱元璋於是採納馬皇后的話讓李文忠繼續鎮守嚴州，李文忠後來打了勝仗攻克杭州。

3，吳興富戶沈萬三多年在海外經商，為全國第一富戶，曾經犒勞軍隊，捐獻家財助修都城城牆的三分之一。觸犯了朱元璋的忌諱，大怒說，小匹夫犒勞天子的軍隊，這是想亂國亂民啊，殺。馬皇后勸諫說，我聽說刑法是用來誅殺不法之徒，而非不祥之民，百姓富可敵國，他們會覺得自己不祥，百姓不祥自有老天降臨災難，陛下你憑什麼殺他們呢！經馬皇后勸說，沈萬三才得免去死罪，遣戍雲南。

4，朱元璋曾經讓重刑犯築造城牆為自己贖罪。馬皇后說：“透過罰勞役來贖罪，這是國家對待犯有重罪的囚犯的最大的恩惠，但本來就疲憊的囚犯如果再加重勞役，恐怕仍免不了死亡。”朱元璋於是免除他們的勞役。

5，宋濂致仕歸隱之後，他的孫子被牽扯進胡惟庸案中，朱元璋下令將宋濂也處死。馬皇后知道情況後出面救援：這件事宋學士根本不知情，普通人都知道對老師要終身敬衛，何況是皇上你呢。朱元璋感嘆道，這件事你是不知道的。後來朱元璋和馬皇后用餐，馬皇后悉心準備的都是素食齋飯，朱元璋不解其意，馬皇后解釋道，宋學士獲罪，所以用素食為他祈福希望他免除禍災。朱元璋動了惻隱之心，將宋濂流放至茂州。

6，有一次馬皇后關心民生，問朱元璋：“現在天下百姓安泰嗎？”朱元璋說：“這不是你應該問的。”馬皇后智慧的反駁：“陛下是天下百姓之父，我是天下百姓之母，我作為母親，為什麼不能知道孩子們的情況？”

7，南京的宮殿修建完畢，朱元璋和馬皇后過去巡視工程，見宮殿規模宏大美輪美奐，不由和馬皇后感嘆道：當初我也就胡做亂做，誰知竟然還打下了江山。說完後，看到有畫工在附近，害怕洩露自己的不當之言，決心殺了他。馬皇后摸自己的耳朵示意畫工，畫工會意，假裝自己是聾子，對朱元璋的召喚不理不睬，朱元璋派人詢問，原來是聾子，於是將他赦免。

8，學士李希顏作為老師給諸王講課，對不聽話的諸王直接敲打他們的額頭。朱元璋知道後心疼兒子怒不可遏，馬皇后勸他說：哪裡有看到美麗的錦服就要怪罪剪錦裁縫的道理？謹小慎微是妃嬪和宮人太監對孩子的愛，你是皇上不該因此遷怒老師。而且老師以聖人的道義來教育我們的兒子，你怒什麼？朱元璋聽後釋然，不僅沒有處罰李希顏，還給他升官。

9，朱元璋說，浙江寺廟田糧很多，但和尚們專注酒肉女色，不思焚香修佛。於是把這群和尚趕到京城服勞役，死傷很多。馬皇后勸諫道，度僧本是佛教的因緣，和尚犯戒，自有佛教的因果之報，現在所讓他們死於勞役，我實在是不忍心。朱元璋聽了馬皇后的話，把這群和尚都放了。

10，朱元璋早晚在西樓上決斷國事，馬皇后經常在隔壁間聽著。得知朱元璋發怒，待他退朝後便問他：今天處理什麼事，怒的又是何人？然後不等朱元璋回答，就開始勸誡：皇上現在已經有五個兒子了，正是積德的時候，不可以放任自己的脾氣隨便殺人，放人性命才是子孫的福氣，國運也會長久。朱元璋接納馬皇后的意見，做事都按照律法來。

11，朱元璋開國後製作寶鈔流通天下，但制鈔屢次失敗，朱元璋大怒準備殺工匠，工匠惶恐不得不撒謊，前代制鈔都取賢人心肝置於內，這才成功。朱元璋聽信決定殺人，馬皇后知道後勸朱元璋，以我看，秀才們所寫的文章就是賢人心肝，用這就足夠了，為何還要殺人？朱元璋聽後大悅，最後寶鈔果然也製成了。

馬皇后是唯一一個能讓朱元璋聽話的媳婦兒，這也歸功於早年馬姑娘的不離不棄，當年朱元璋投靠郭子興，一心為他賣命換來了他一生的知己——馬姑娘。這位馬姑娘也是一心一意，可是郭子興生性多疑，慢慢的開始不喜歡小朱了，最後把他關了起來。馬姑娘怕他餓，偷著揣著剛落好的餅給小朱吃，即使身體被燙傷也不放棄，這樣她感化了小朱。等到小朱成了朱皇帝她也沒有跟他疏遠，一心一意的管理他交給她的後宮。這是馬姑娘能阻止朱元璋濫殺的最主要的原因。