遊戲模式在世界中加入了4個強大而神秘的秘密結社，每個皆以現實中存在的組織為原型。清理蠻族營地、造訪部落村莊、將使者派往城邦或尋找自然奇觀，便能找到他們的蛛絲馬跡。另外，如果其它領袖已經發現秘密結社，提高與其的外交能見度也能接觸到秘密結社。
發現秘密結社會解鎖一名不需要指定到城市的可提供強大加成的新總督。一旦加入一個結社，玩家在正常遊戲中都會成為此結社的成員。
和同一結社的玩家結盟可以更快積累同盟點數，他們也會對您有更正面的看法。然而，位於不同結社的玩家一旦意識到您所處的結社就會討厭您。
彌涅耳瓦夜鶯
首次向尚未有本方使者的城邦派遣使者時，玩家可獲得發現這個結社的機會。
總督升級：
1級（教化）：提供一個額外的經濟政策槽位。向城邦派遣的每一條商路生效期間為該城邦提供+1使者。
2級（啟蒙，中世紀解鎖）：允許建造鍍金寶庫，這個建築替代銀行，使所在商業中心獲得等同於其相鄰加成的文化值，且若城市有港口區域，則商路容量額外+1。
3級（儀式，工業時代解鎖）：提供一個額外的萬用字元槽位，且間諜容量+2。若該文明間諜在一個本方城市內，則該城市+1宜居度，每回合額外+4忠誠度。
4級（遠景，原子能時代解鎖）：進攻性間諜行動每次成功，玩家都可獲得目標城市當回合金幣、信仰值、文化值和科技值的一半。每回合獲得等同國庫3%的金幣（1000金幣封頂）。
黃金黎明學會
發現一個自然奇觀時，玩家可獲得發現這個結社的機會。
1級（教化）：在地圖上顯示地脈資源，該資源可為所有專業化區域提供標準相鄰加成。
2級（啟蒙，中世紀解鎖）：允許建造鍊金學會，這個建築替代大學，額外提供+2生產力、+1大商業家點數、+1大工程師點數，且所在學院額外獲得等同於其相鄰加成的金幣。
3級（儀式，工業時代解鎖）：文明每獲得1個偉人，每個地脈資源均提升1點等同於此偉人型別的產出。招募大將軍、海軍上將時，提升的產出為+1科技值。
4級（遠景，原子能時代解鎖）：擁有學院區域的城市解鎖“秘術研究”城市專案，提供金幣，完成時提供大商人、大科學家、大工程師點數。城市中的每個能量地脈資源獲得額外科技值。
虛空吟唱者
探訪一個部落村莊時，玩家可獲得發現這個結社的機會。
1級（教化）：可透過進入部落村莊解鎖。解鎖舊神方尖碑，替代紀念碑，額外提供+4信仰值以及一個鉅作槽位（可放置任何型別的鉅作）。
2級（啟蒙，中世紀解鎖）：該文明的所有城市每回合額外獲得等同於其每回合獲得信仰值20%的科技值、文化值、信仰值。
3級（儀式，工業時代解鎖）：解鎖“邪教徒”單位，該單位需使用信仰值購買，可消耗次數降低外國城市忠誠度，並在次數使用完之後獲得遺物。
4級（遠景，原子能時代解鎖）：解鎖“黑暗召喚”城市專案，提供大量信仰值，且專案結束時提高邪教徒造成的忠誠度損失。
血色契約
清除一個蠻族營地時，玩家可獲得發現這個結社的機會。
1級（教化）：可透過消滅蠻族營地解鎖。首都出現1個吸血鬼單位。
2級（啟蒙，中世紀解鎖）：首都出現1個吸血鬼單位，且允許吸血鬼建造吸血鬼城堡（每個玩家最多隻能建造2個）。
3級（儀式，工業時代解鎖）：首都出現1個吸血鬼單位。每個玩家建造吸血鬼城堡的上限提升至3個。與吸血鬼單位相鄰的單位-5戰鬥力，且吸血者掠奪消耗1點移動力。
4級（遠景，原子能時代解鎖）：首都出現1個吸血鬼單位。每個玩家建造吸血鬼城堡的上限提升至4個。允許玩家在吸血鬼城堡及其相鄰單元格之間傳送單位。
遊戲模式在世界中加入了4個強大而神秘的秘密結社，每個皆以現實中存在的組織為原型。清理蠻族營地、造訪部落村莊、將使者派往城邦或尋找自然奇觀，便能找到他們的蛛絲馬跡。另外，如果其它領袖已經發現秘密結社，提高與其的外交能見度也能接觸到秘密結社。
發現秘密結社會解鎖一名不需要指定到城市的可提供強大加成的新總督。一旦加入一個結社，玩家在正常遊戲中都會成為此結社的成員。
和同一結社的玩家結盟可以更快積累同盟點數，他們也會對您有更正面的看法。然而，位於不同結社的玩家一旦意識到您所處的結社就會討厭您。
彌涅耳瓦夜鶯
首次向尚未有本方使者的城邦派遣使者時，玩家可獲得發現這個結社的機會。
總督升級：
1級（教化）：提供一個額外的經濟政策槽位。向城邦派遣的每一條商路生效期間為該城邦提供+1使者。
2級（啟蒙，中世紀解鎖）：允許建造鍍金寶庫，這個建築替代銀行，使所在商業中心獲得等同於其相鄰加成的文化值，且若城市有港口區域，則商路容量額外+1。
3級（儀式，工業時代解鎖）：提供一個額外的萬用字元槽位，且間諜容量+2。若該文明間諜在一個本方城市內，則該城市+1宜居度，每回合額外+4忠誠度。
4級（遠景，原子能時代解鎖）：進攻性間諜行動每次成功，玩家都可獲得目標城市當回合金幣、信仰值、文化值和科技值的一半。每回合獲得等同國庫3%的金幣（1000金幣封頂）。
黃金黎明學會
發現一個自然奇觀時，玩家可獲得發現這個結社的機會。
總督升級：
1級（教化）：在地圖上顯示地脈資源，該資源可為所有專業化區域提供標準相鄰加成。
2級（啟蒙，中世紀解鎖）：允許建造鍊金學會，這個建築替代大學，額外提供+2生產力、+1大商業家點數、+1大工程師點數，且所在學院額外獲得等同於其相鄰加成的金幣。
3級（儀式，工業時代解鎖）：文明每獲得1個偉人，每個地脈資源均提升1點等同於此偉人型別的產出。招募大將軍、海軍上將時，提升的產出為+1科技值。
4級（遠景，原子能時代解鎖）：擁有學院區域的城市解鎖“秘術研究”城市專案，提供金幣，完成時提供大商人、大科學家、大工程師點數。城市中的每個能量地脈資源獲得額外科技值。
虛空吟唱者
探訪一個部落村莊時，玩家可獲得發現這個結社的機會。
總督升級：
1級（教化）：可透過進入部落村莊解鎖。解鎖舊神方尖碑，替代紀念碑，額外提供+4信仰值以及一個鉅作槽位（可放置任何型別的鉅作）。
2級（啟蒙，中世紀解鎖）：該文明的所有城市每回合額外獲得等同於其每回合獲得信仰值20%的科技值、文化值、信仰值。
3級（儀式，工業時代解鎖）：解鎖“邪教徒”單位，該單位需使用信仰值購買，可消耗次數降低外國城市忠誠度，並在次數使用完之後獲得遺物。
4級（遠景，原子能時代解鎖）：解鎖“黑暗召喚”城市專案，提供大量信仰值，且專案結束時提高邪教徒造成的忠誠度損失。
血色契約
清除一個蠻族營地時，玩家可獲得發現這個結社的機會。
總督升級：
1級（教化）：可透過消滅蠻族營地解鎖。首都出現1個吸血鬼單位。
2級（啟蒙，中世紀解鎖）：首都出現1個吸血鬼單位，且允許吸血鬼建造吸血鬼城堡（每個玩家最多隻能建造2個）。
3級（儀式，工業時代解鎖）：首都出現1個吸血鬼單位。每個玩家建造吸血鬼城堡的上限提升至3個。與吸血鬼單位相鄰的單位-5戰鬥力，且吸血者掠奪消耗1點移動力。
4級（遠景，原子能時代解鎖）：首都出現1個吸血鬼單位。每個玩家建造吸血鬼城堡的上限提升至4個。允許玩家在吸血鬼城堡及其相鄰單元格之間傳送單位。