先說答案：嶽靈珊更厲害一些。

分析如下：

1、首先說明一點，這兩個人的武功都不算多麼高明。嶽靈珊是笑傲江湖裡的人物，是令狐沖的前女友。孫仲君是碧血劍中的人物，是歸辛樹的弟子。從年代上看，嶽靈珊早於孫仲君，嶽靈珊時代，風輕揚還活著。而碧血劍時期，風清揚已經死去，成了書中華山派的創派祖師。

2、孫仲君的師傅歸辛樹，是書中的絕頂高手。他生性沉默木訥，內力深厚。但他的性格使他授徒時存在劣勢，許多的武功要旨講不明白，所以他的徒弟出色的並不多，頂多就是江湖一流高手而已。但考慮到後代的整體武功水平不如前代，所以，那時的一流高手，其實水平也一般。

3、孫仲君外號飛天魔女，為人不講道理濫殺無辜，她的武功不如師哥梅劍和，而梅劍和的武功離袁承志都差距十萬八千里，袁承志一招就可以斷其劍制服他，可見，孫仲君根本無法和那些絕頂高手走上一招半式。其水平普通的很。後來被穆人清懲罰，斷一指，並不再用劍，武功更打折扣。

4、嶽靈珊在笑傲江湖中也是武功一般的女子。但她後期學了石壁上的劍法，各門派的武功精要都熟悉。而這些武功，是五嶽門派都失傳的高明劍法。她以這些武功對敵，曾僥倖贏下莫大先生和令狐沖，在左冷禪手下走了幾十招，武功大是不俗。而孫仲君屬於後世之人，應該更不會這些劍法。

5、綜上分析，我覺得嶽靈珊應該比孫仲君厲害一些。但這是不同年代的對比，並沒有實際證據，僅僅娛樂而已。

說說孫仲君：

孫仲君，綽號“飛天魔女”，心高氣傲，急躁易怒，“美得像天仙一般”、“相貌頗美，秀眉微蹙，杏眼含威”。孫仲君貌雖美若天仙，但這顆心卻是十分歹毒，請看這一回：

孫仲君喝道：“好哇，你還強嘴！依你說來，閔大爺是死有餘辜了”？喝叫聲中，她突然象飛鳥般的縱了出來，右手中已握住了明晃晃的一柄長劍，左手出掌向羅立如胸口按到。羅立如大吃一驚，右臂一招“鐵門閂”，橫格她這一掌急按。袁承志低聲道：”糟了！他右臂不保……”話未說完，只聽得羅立如慘叫一聲，一條右臂果真已被一劍斬下。

……孫仲君拭去劍上血跡，還劍入鞘，神色自若的歸座，舉起酒杯一飲而淨。客廳中數百人競無一人喝彩，均覺不論對方如何不是，也不該出手如此狠辣，何況羅立如只是個來邀客的使者。

還有一件事，孫仲君也是做得十分魔性，放在現今社會，是個慣犯重犯，非得全國通緝不可。山東渤海派弟子洪勝海，一家五口人俱被飛天魔女孫仲君所殺，斬殺滅門，如此蛇蠍心腸。洪勝海死裡逃生，為躲避孫仲君的追殺，只好投靠後金，幫助睿親王多爾滾做事。

嶽靈姍，是華山派掌門嶽不群和甯中則的獨女，從小與師兄令狐沖青梅竹馬，令狐沖十分喜歡她，也真心實意地愛她。可是“心雖比天高，命卻如紙薄”的嶽靈姍，偏偏愛上了根本不愛她的師弟林平之，婚後林平之因為已經自宮而不能與嶽靈姍行夫妻之實，二人是有名無實的夫妻。而林平之為了復仇不顧靈姍的生死，她本來欲回父母的身邊，卻被木高峰抓了回來，因木高峰背上的毒水濺瞎了林平之的眼睛，因此，嶽靈姍善心大發，不忍心丟下丈夫離去……

林平之失明後性格大變，在勞德諾的力邀下共謀殺靈姍之父嶽不群，勞德諾承諾事成後讓林平之做辟邪劍門的掌門。因此，林平之答應與崇山派合作，為了向左冷禪表忠心，競然下手殺了妻子嶽靈姍，天性善良的嶽靈姍臨死前，還請求師兄令狐沖要好好保護林平之，在絕望和傷痛之中，死在師兄令狐沖的懷裡。

真是可悲之人，必有可恨之處。金大俠把嶽靈姍安排死在愛她護她的令狐沖懷裡，也算是給嶽靈姍一個好的蓋棺定論吧！

先請看下列四個方面的比較：

（1）顏值方面。嶽靈珊和孫仲君都是相對應的小說裡，非常漂亮的姑娘；而且在各自相對應的小說裡，孫嶽二人的顏值相貌也都是名列前茅的。因此，這一項比較嶽孫二人旗鼓相當難分伯仲。

（2）性格修養方面。孫仲君生性潑辣急躁，為人驕橫跋扈，又有師傅護著有師哥寵著，孫仲君乃得外號“飛天魔女”。然後，孫仲君在被師祖穆人清斬斷一隻小手指之後，性子收斂了很多。而嶽靈珊的性格脾氣相對而言，就要溫柔可愛得多了。在原著小說裡，嶽靈珊除了偶爾會對令狐沖耍耍小孩子的脾氣之外，其餘都是很溫文爾雅善解人意了。因此，這一項比較嶽靈珊要勝出了。

（3）武功修為方面。孫仲君雖然是華山派徒孫輩的人物，但是孫仲君的師傅是號稱“神拳無敵”的歸辛樹；況且，華山派的武功在《碧血劍》小說當中是數一數二的水平。而在《笑傲江湖》小說裡，嶽不群和嶽靈珊父女以及父女二人所在的華山派的武功和地位並不咋地。因此，這方面的比較則是孫仲君更厲害了！

（4）最終的結局方面。在《笑傲江湖》原著小說裡，嶽靈珊雖然能如願以償地與林平之結為夫妻，但是最終嶽靈珊還是死於林平之之手了。而孫仲君則要比嶽靈珊幸運得多了，在《碧血劍》小說裡孫仲君最終與寵愛自己的師兄笑到了最後。

孫仲君，農婦歸二孃調教出的徒弟，在心狠手辣方面與師傅相比更是青出於藍，不僅心高氣傲，目空一切，而且急躁易怒，濫殺無辜。他不僅削去求婚者的耳朵，不僅不由分說地卸下羅立如一條手臂，還一口氣殺死洪勝海老母、妻兒五條人命，果然對得起“飛天魔女”的綽號。師傅歸二孃寡言敏行，吃苦耐勞，卻糾結眼前，缺乏理性和換位思考，一味護短而不慈悲，一味好面子而不計正邪。這種有些本事卻見識短淺、愚魯倔強的人，完全抑制了徒弟的發展空間，而教出的徒弟自身格局也不會太大，終究限制了自身武藝的提高，到頂也就是個二流人物。

嶽靈珊，華山派掌門人嶽不群和女俠甯中則的女兒，常用招式玉女劍十九式，由其母華山玉女甯中則所創。每一式都是變化繁複，十九式主旨在於變幻奇妙，跟華山派著重以氣馭劍的法門頗有不同，女弟子膂力較弱，遇上勁敵之時，可憑此劍法以巧勝拙。在嵩山大會上，嶽靈珊以思過崖石壁所刻劍法分別擊敗泰山派玉音子、玉磬子，擊敗衡山派掌門莫大先生，以衝靈劍法擊敗恆山派掌門令狐沖，技驚四座。

兩人相比較嶽靈珊在武林中的名聲沒有孫仲君大，而以武功相論，嶽靈珊可算超二流，應高於孫仲君。所謂武學退化論，到了孫仲君這一代，華山武學能保留下來已是不錯，但留下的武功與嶽靈珊時代相比已不會太高明，而且孫仲君只習得華山一派武功，嶽靈珊所習更加廣博，五嶽劍派失傳劍法都已學得，必然嶽靈珊武功劍法要高。

謝邀，第一，武俠背景，笑傲江湖世界早於碧血劍，按二個江湖世界武功來講，笑傲江湖頂級內功為易筋經和吸星大法，劍法為獨孤九劍以及辟邪劍法，碧血劍裡最厲害的應該是混元功和金蛇劍法，混元功這門內功也算頂級內功，但是是不是真的完善的內功還不可知，因為金庸的武俠越往後越體現不出內功的厲害，感覺都有一定的差距。

第二，內功，嶽靈珊內功肯定是正宗華山內功，雖然她們倆內力都不強，但比碧血劍時期孫仲君的內功只強不弱。

第三，招式，嶽靈珊習得後山各個門派劍法，已經具有江湖門派掌門實力，而孫仲君在江湖高手面前基本幾招就會落敗。

嶽靈珊強，關鍵也更喜歡這個角色。