不好對比，就事實而論，巔峰時期兩個帝國都是同時期世界上最強大的帝國。

先說大元帝國，元朝是在蒙古汗國基礎上建立起來的帝國，入主中原，統治華夏。元朝未統一之前，宋、蒙、金、遼各方勢力並存，蒙宋聯軍滅金，蒙面宋遼建立元朝。從這個角度說，元朝的軍事實在各方中應該是較強的。在武器裝備方面，宋蒙時期火器得以飛速發展，世界上第一支手槍、第一顆地雷、第一門火炮就在這一時期誕生，宋蒙在火器先程序度上，宋比蒙略勝一籌，但蒙古騎兵卻是世界上最強大的。元朝建立後，忽必列東征西討，發動多次對外戰爭，曾兩次東征日本，蒙古騎兵的神勇令日本武士喪膽，殺得日本幕府軍事集團血流成河，雙方數百次交鋒，日本武士沒打過一次勝仗。若不是兩次東征都遭遇強大臺風，日本這個國家可能已經不存在了。颱風導致元軍幾乎全軍覆沒，元朝兩次東征失敗，但這並不能證明元明武力不強，元朝是中國各朝代疆域最廣的朝代，總面積達2122.74萬平方公里，相當於兩個多美國。鐵的事實證明，元朝帝國是當時世界上的軍事強國。

再說大明帝國。明朝是同時期世界上最強的軍事強國，火器發展達到頂峰，遙遙領先世界，明朝還建立了強大的海軍，造出世界上第一艘“航母”——大明寶船，船長四十四丈四尺，寬十八丈，載重800噸，可容納上千人，此船配備精良火器，是世界上裝備最為先進的武裝航母。鄭和乘此船，率領世界上最強大的艦隊下東洋，令日本臣服，下西洋征服60多個國家，稱霸世界，使明朝出現“萬國來朝”盛景。明朝步騎兵也非常厲害，曾經征服世界的蒙古騎兵被打得落花流水，元朝被明朝徹底消滅。明朝還有一種叫“無敵神牌”的武器裝備，堪稱世界上最早的坦克，此裝備火力非常強大，可瞬間碾壓敵軍。但到明朝後期，軍事實力開始走下坡路。到了清朝更加不行，直至列強四起，從大清帝國開始，正式退出軍事強國行列。

一個重在騎兵，一個重在新科技，我個人還是比較偏向明朝的，畢竟科技是第一生產力，明朝很重視火器的製造與應用，明朝的火器優於1840年鴉片戰爭中的英國，可惜讓清朝人封存了。科技在戰爭中的巨大作用不言而喻，我們比較容易聯想到二戰德國打波蘭，近一點我們會想到海灣戰爭。明成祖朱棣北伐的時候充分利用了火器的應用，明朝三大營五軍營﹑三千營﹑神機營。

三大營內衛京師，外備征戰。

五軍營

五軍營是騎兵和步兵的混合體。永樂八年（公元1410年）始分為中軍、左哨軍、左掖軍、右掖軍、右哨軍，這支部隊是從各個地方調上來的精銳部隊，擔任攻擊的主力。

三千營

三千營主要是由投降的蒙古騎兵組成的。也就是說，三千營實際上是以僱傭兵為主的。 組建三千營時，是以三千蒙古騎兵為骨幹的，當然後來隨著部隊的發展，實際人數當不止三千人，三千營與五軍營不同，它下屬全部都是騎兵，這支騎兵部隊人數雖然不多，卻是明軍最為強悍的騎兵力量，他們在戰爭中主要擔任突擊的角色。

神機營

這是明軍中專門掌管火器的特殊部隊。士兵使用的武器是火炮和火銃後期又添置火繩槍。在明朝時候，這些火器被稱為神機炮，許多遊牧民族的騎兵就是喪命於這些神機炮下。這相當於明朝政府的炮兵部隊。 火銃兵列隊為三行，發現敵騎兵前進後，第一行首先發射火銃，然後第二行、第三行繼續發射，在二三行發射時，第一列就可以從容裝好子彈，形成完備而持續的強大火力。 此一戰術最早為明初名將沐英所創制，是所有前填槍最核心的戰術，領先西方二百餘年，領先日本二百餘年。

其他某些方面明朝相比卻有很多倒退，閉關鎖國，文學禁錮（考試八股文內容十分狹隘，但是禁錮也有好處，雖無元曲，卻又四大名著其三），國庫常年缺銀子。遠不如元朝文化的胸襟開豁，國庫殷實，同時就領域而言，也有很大差距，元朝對土地有著深入骨髓的執著，斬一個使臣就要二滅日本，（日本神風兩次相助）還籌劃三滅日本，未果。

總的來說，時代不同，不可同日而語。如果單說打，真能打，我站明朝。

從個人觀點上看，明朝的實力可能會更強，更昌盛。

在歷史上，元末明初是緊密連線在一起的，元末的軍隊已經腐敗不堪，缺乏可比性。但是我們從其它的角度分析一下。僅屬個人觀點，不正之處還請指出。

第一，鼎盛時期的軍隊綜合實力對比。

蒙古興起的時候，可以說的吊打四方。成吉思汗先統一了蒙古高原，然後對周邊的西夏、金國進行了多次打擊。中間還率領二十萬大軍遠征花剌子模，屠城，回來後，直接滅了西夏，隨後連宋滅金，再後來進行了滅宋的戰役，中間還有拔都西征，在歐洲風光了一圈。可以說這個時候的蒙古，是鼎盛時期的軍隊，也是最具備戰鬥力的軍事集團。不說戰績，僅分析。這個時候的蒙古，記得在全球通史上分析，蒙古的總人口在150萬到200萬左右。西征花剌子模的二十萬大軍，是成吉思汗在木華黎等攻打金國的軍隊之外所能調動的最大的力量了。由人口及軍隊數量可分析，這個時候的蒙古，除去婦孺老幼，基本上屬於全民皆兵的模式，他們透過以戰養戰，來獲取財富。有研究分析，蒙古軍隊的快速機動，就是因為一個蒙古戰士，同時幾匹戰馬一起出戰，多的可以達到十幾匹馬，馬背上民族的彪悍和騎射功夫，爭取財富的血性，使得蒙古戰士在戰鬥中勇敢而又衝動。並且，蒙古軍隊在佔領一座城池之後，收集工匠，為軍隊打造火器等當時的高科技武器，這也是蒙古軍隊的作戰優勢，在四處的戰爭中，不斷髮展最新的作戰工具，這些條件使得蒙古軍隊能在初期興起的時候吊打四方的敵人。

明朝的戰力。初期的明朝，和蒙古軍隊是多次交手。也是古代歷史中少有的，印象中也是唯一的一次北伐成功的案例。有專家分析，蒙古人統治時期，中原四處都是牧場多過農田，使得在元末的起義中，戰馬不再是蒙古人的優勢，戰馬的充足，是朱元璋北伐成功的一個因素。也說明，如果在鼎盛時期，元軍對明軍，在戰馬這一項上，雙方應該是不分上下。明朝對於火器的研發，一直處於世界領先水平，除了研發之外，明朝也是世界上最早成建制的組建火器部隊的國家。那麼，在火器對決上，明初已經擁有了元初的火器裝備，並在此基礎上有了改良與發展，那麼。在火器上，明初應該是比元初更有優勢的。蒙古缺乏鐵器等資源，由於飲食習慣，也缺少茶葉等生活用品，那麼在後勤保障上，蒙古是遠遠比不了明初的。至少在朱元璋以及朱棣時代，明軍沒有靠戰爭養活部隊的做法。那麼，在冷兵器時代，人口也是重要的因素之一，蒙古高原的人除了彪悍之外，在數量上是沒法和平原地帶的漢族相提並論的。

在鼎盛時期的對比，我的看法是蒙古軍隊比不上明朝軍隊。

第二、非鼎盛時期的軍隊綜合實力對比

明朝時期，蒙古的黃金家族已經沒落，但是蒙古的其他部族也再崛起。比如瓦剌的野先。大家都熟悉，瓦剌部在於明朝的多次對決中，基本沒有佔到便宜。太監王振的失誤導致明英宗被俘不再本次討論範圍之內，朱棣多次遠征蒙古。于謙的北京保衛戰，可以看做是蒙古與漢族的對決案例。基本上，蒙古都沒佔到什麼便宜。以至於後期蒙古的首領三娘子主動求和，啟動互市來看，蒙古對明朝的威脅還不至於到吊打的程度，也就屬於騷擾性質。

清朝康雍乾時期，蒙古多次出現叛亂，清朝也是不停的進行平叛。早期還是八旗兵的時代不說，到雍正乾隆時期，清軍主力基本屬於漢八旗，也就是說那個時期是漢族與蒙古的又一次較量。不管多少次的叛亂，蒙古總是以失敗結束。