辦食品加工廠流程、證件如下：

因為辦理食品加工廠，需要先成立公司（不能是個體戶），故首先需要到工商部門進行公司名稱預先核准，再到質監部門辦理組織機構程式碼證賦碼，再到質監局辦理生產許可證，即QS證，再辦理營業執照、組織機構程式碼證，再到工商部門辦理許可證，這樣，才有加工的資質。除此之外還要辦生產許可證，涉及到生產廠房、更衣室、洗消間、化驗室、倉庫、檢驗裝置、生產裝置、檢驗員，這些土建工程及生產、檢驗裝置費用。

辦食品加工廠詳細流程如下：

取得廠房所在房地產的產權或使用權；

確保該房地產可以用於工業用途；

取得《營業執照》與開戶許可（礦泉水企業應開始辦理探/採礦許可與取水許可）；

完成廠房設計與施工圖紙，及裝置選型；

按改擴建專案辦理環保、消防、安全等“三同時”；

辦理取水許可、排汙許可、戶外廣告許可、商品條碼等（投產前先委託加工的則需辦理食品經營許可）；

廠房驗收與裝置安裝除錯，同步辦理計量檢定、特種裝置、易製毒/易制爆備案、安全生產許可等（有易拉罐的還要辦理輻射許可）；

建立食品安全管理體系，辦理食品生產許可，同時生產包裝的需前置辦理食品相關產品生產許可；

準備對外出口的企業要辦理出口食品生產企業備案；

有餘力的再辦理體系認證等。