聯合軍入侵Xen

1995年─聯合軍入侵Xen並發現地球

聯合軍帝國入侵併控制Xen，最終使之成為其奴隸種族。並利用科技與被Xen稱作弗地岡人的優勢人種雜交製造出一種稱為“Super soldier”（超級戰士）。這些Super soldier不但能夠適應Xen星球的環境而且還具有聯合軍強大的科技，而且這些Super soldier有效的掌控了整個星球。聯合軍還賄賂了一些種族來作為星球的所謂的領袖來慫恿其他人迎合聯合軍的需求。這些所謂的領導人在Xen被稱為“尼赫倫斯”（弗地岡人領導人）；在地球上以後的那個領導人就是華萊士·布林。

地球上，戈登·弗里曼正為他的博士學位在MIT學習；在黑山研究所中，一個小的心靈傳送實驗正在進行，在研究員伊萊·凡斯和克萊納博士的監督下，從Xen重新找回了水晶，生物體也被送來分析。

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黑山事件

200X年─黑山事件發生

G-Man引發了串聯共振 (Resonance Cascade)，開啟了Xen與地球間的傳送門，Xen上的許多物種逃至地球，黑山出現混亂。特殊單位：危險環境防治單位 (Hazardous Environment Combat Unit)採取非常手段，準備殺害所有知情的研究人員。

戈登·弗里曼嶄露頭角，遊走於地球與Xen之間，並且擊敗了尼赫倫斯。戈登也引起了G-Man興趣。

黑山被摧毀，倖存者包括華萊士·布林、伊萊·凡斯、愛麗克斯·凡斯、艾薩克·克萊納、巴尼·卡洪等人。

G-Man逼使戈登為其工作，並將戈登放入“時間停滯帶”中，也就是戈登的時間處於停滯狀態。

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過渡時期

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傳送門風暴

假定為2004年

黑山事件對世界形成了一系列的連鎖反映，來自Xen的各種形態的外星生物被傳送到了市區。獵頭蟹延著通道爬入商店，同時其他的外星生物也被傳送到了游泳池、房屋中，地球處於一片混亂。大量的倖存者逃亡到有軍隊保護和鐵絲圍繞的城市當中，在城市中人們的生活再次恢復到從前，這些城市也給人們帶來了安全感。

當弗地岡一族逃至地球后，聯合軍也正蓄勢待發的準備對地球進行突襲。

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聯合軍入侵地球

七小時戰爭爆發

聯合軍透過Xen和地球之間的傳送門大舉入侵了地球，將運用在Xen的技術同樣運用在人類身上，布林博士成為地球人類主宰。聯合軍在17號城設立城塔，是聯合軍的大本營，聯合軍的軍隊以及所使用的軍用武器、車輛等都在此製造。

解放的弗地岡人與人類結盟，至於其他的Xen生物 (如獵頭蟹、蟻獅等)則只尋找自己的棲地，對雙方都會攻擊。

戰爭維持了七小時，聯合軍以高度的優勢科技徹底擊垮人類，布林博士擅自代表人類投降，聯合軍開始實行高壓統治，布林成為領導人。人類開始被送往特定城市，以往的人口集中區被摧毀。

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聯合軍監禁崛起

布林居住在17號都市根據地的最頂層，並試圖鎮壓反抗。一方面以大眾傳播媒體進行懷柔安撫，一方面暗地鎮壓反抗軍。聯合軍為了滿足人類，特地保障人類不會受到外地生物的威脅。

聯合軍重要據點諾瓦礦場設立，目的是為了將所有人類通通轉換為人型追蹤聯合軍 (Stalker)，以供奴役使用。

聯合軍設立城市聯軍警察，開始進行一連串改造地球與人類的手段。

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《半條命2》

主條目：半條命2

約在202X年

戈登從時間停滯帶被G-Man喚出，帶頭反抗聯合軍的統治。戈登從諾瓦礦場回到17號城後，人類反抗的戰爭已經開打，革命開始。

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《半條命2：第一章》

主條目：半條命2：第一章

接續《半條命2》之後

自從成功阻止了布林博士逃走之後，城塔的傳送核心便變的極不穩定，隨時都有崩解的可能，克萊納博士預測一旦核心崩解，方圓數十哩以內都會被夷為一片平地，當然也就是說十七號城將成為廢墟，但是戈登與愛莉斯才剛從城塔的最高層逃出來，根本沒有時間出城，克萊納博士想出了一個方法來爭取多一些時間，那就是進入城塔中啟動緊急核心圍阻體，雖然沒辦法完全阻擋住破壞的核心，但是可以爭取一些時間。於是戈登和愛莉斯便出發重返城塔，一路上聯合軍的部隊也匆忙的撤出城塔之中，除了依然守在核心控制室的一些部隊，此時愛莉斯才發現聯合軍打算利用核心毀滅的巨大能量將一些重要的東西傳送出去。

自從下載了聯合軍電腦中的資料之後，聯合軍們便不停的追蹤著戈登與愛莉斯，而同時原本由聯合軍所掌控的異形生物也紛紛失去控制，開始在市區中橫行，四處擷取軀體寄生，產生了更強悍的聯合軍殭屍，到處都可以看到他們的身影。穿過老舊的地鐵站、伸手不見五指的黑暗地下街、殘破的醫院之後終於見到了巴尼。

一隊隊的護送平民進入車站，聯合軍的攻擊也沒有停止，終於逃難列車出發了，戈登與愛莉斯留下來多爭取一些時間，隨後聯合軍派了三腳機甲來攻擊車站，清除這個威脅之後，兩人便上了火車。

帶著數不清的無解謎團，戈登在飛馳的火車上離開……望著逐漸遠離的巨大城塔，終於轟的一聲，帶著強大的威力爆炸了，一片藍色強光與時空的擾亂之後，出現製作小組的畫面，首部曲的故事則到此結束。

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《半條命2第二章》

主條目：半條命2：第二章

接續《半條命2：第一章》之後

第二章的劇情緊接著首部曲的最後，戈登和愛麗克斯搭乘的火車受到城塔爆破的波及而毀壞，幸運的是毀壞處附近找到了通訊裝置，愛麗克斯跟伊萊通訊得知城塔的毀壞會開啟一個更大的傳送門，若不想辦法將傳送門關閉的話將會再上演一次“七小時戰爭”，而且這一次將會連七分鐘都撐不住，愛麗克斯在城塔中取得的資料將可以關閉那個傳送門，他們的失事處正好離伊萊他們的基地白森林不遠，因此戈登一行人立刻啟程趕往白森林。

但就在即將啟程趕往白森林的時候艾利斯遭受到獵人的襲擊，就在危急關頭弗地岡人及時出現解圍，但是愛麗克斯身受重傷，性命垂危。為了拯救愛莉絲，戈登和弗地岡人一起潛入礦坑的蟻獅巢穴以取得蟻獅幼蟲的萃取液，在經歷了眾多蟻獅以及殭屍群的重重包圍下，終於取得了萃取液並且拯救了愛麗克斯。繼續展開趕往白森林的危險旅程。

一離開礦坑之後，戈登一行人發現聯合軍正率領著大量的部隊往白森林的方向前進，眼見不妙的戈登和愛麗克斯立即尋找越野車並且火速往白森林的方向趕去，沒想到聯合軍在路途上佈置了各種的包圍網，想盡辦法要取得艾利斯身上的關鍵資料……

殺出了一條血路之後，戈登一行人在阿狗的搭救之下成功的到達了白森林基地，但是在享受父女重逢的感動之前，馬格努森博士要戈登去檢查火箭發射艙的內部以確保火箭發射時不會發生意外，結果卻發現了聯合軍軍隊從發射艙頂部展開入侵，戈登適時的將這些聯合軍擊退並且關閉艙門，回到控制室檢視克萊納博士解碼的資料卻發現莫斯曼博士所在的地方跟光圈科技有著非常密切的關係，拯救莫斯曼勢必是關閉傳送門之後得儘快執行的行動。

但是在火箭即將發射的前一刻，聯合軍的三腳機甲部隊跟獵人護衛隊往白森林的基地殺了過來，馬格努森博士便命令戈登利用馬格努森裝置來摧毀這些三腳機甲跟獵人，在防禦住聯合軍重重的圍攻之後，火箭終於成功的發射了，城塔的傳送門也順利的被關閉。現在戈登跟愛麗克斯接下來要做的就是搭乘直升機火速趕往光圈科技所在的北極以拯救莫斯曼。

但是就在即將啟程的時候，兩隻聯合軍顧問突然出現並且襲擊戈登一行人，伊萊為了拯救愛麗克斯而被聯合軍顧問抓住並且被吸食腦髓死亡，只有戈登和愛麗克斯被及時趕到的阿狗救下……

其實是翻譯錯誤，當年這個遊戲在國內火起來的時候主要是透過盜版渠道進入的，隨便亂翻成了半條命，其實真名應該是半衰期，真意應該是指那種沉重的宿命漫長而看不到盡頭的絕望感，只能說這和“踢牙老奶奶”“老頭捲軸”一樣是翻譯圈子的大笑話