這是因為瑪雅文明是一個有斷層的文明，學術界一般認為瑪雅文明屬於石器文明，沒有發現瑪雅人使用青銅器和鐵器。瑪雅人 掌握高度的建造技術，但不會使用輪車。輪子的概念雖然在陶器以及其他文物及圖案中出現，但在現實生活中沒有實用化，瑪雅人擁有高度的城市文明。農業以玉米為主食，沒有出現畜牧業的痕跡，農業採用的是一種極為原始的米爾帕耕作法。瑪雅文明有非常先進的天文學知識，他們對行星軌道的計算極其精確，他們測算的地球年為365.2420天，現代人測算為365.2422天，誤差僅0.0002天，瑪雅人計算的金星饒太陽運轉一圈的時間和現代人測量的誤差每天不超過12秒，不知道在幾千年前他們是如何做到的?瑪雅人的計日單位也大的出奇，最大單位有230億天，這麼大的單位只有在天文學中才可能用到。

所以在很多人看來，瑪雅人掌握的天文學、數學等方面的知識和他們所表現的文明是不相匹配的，能用石塊建造宏偉精美的金字塔卻沒有發明或使用金屬工具？能計算行星軌道，製造陶器，在很多用具中都有輪子的概念卻不知道使用輪子？能擁有極其準確的歷法和天文學知識但還處在石器時代？擁有古老的象形文字卻不知道寫的是什麼？特別是卓爾金歷，一般來說曆法都是以相關天體執行來做參照，但是我們在太陽系中找不到一個執行260天左右的卓爾金星。因此會有人認為瑪雅文明有可能是外來文明或外星文明，他們原來生活在卓爾金星，只不過後來來了地球，在地球上繁衍，時間長了，文明出現了斷層，就是我們現在看到的樣子。

不過我覺得，瑪雅人是地球本土人的機率比較大，因為一個種族要適應新的星球，新的環境並不是件容易的事，要有很多代人的不斷進化。而且史料或傳說中應該會有相關的記載。但我們並沒有這方面的發現。