分兩個階段：【1】丙酮酸氧化脫羧形成乙醯輔酶A：該過程發生線上粒體的基質中，釋放出1分子CO2，生成一分子NADH+H+。【2】乙醯輔酶A參與三羧酸迴圈，產生二氧化碳：主要事件順序為：（1）乙醯CoA與草醯乙酸結合，生成六碳的檸檬酸，放出CoA。檸檬酸合成酶。（2）檸檬酸先失去一個H2O而成順烏頭酸，再結合一個H2O轉化為異檸檬酸。順烏頭酸酶（3）異檸檬酸發生脫氫、脫羧反應，生成5碳的a-酮戊二酸，放出一個CO2，生成一個NADH+H+。 異檸檬酸脫氫酶（4） a-酮戊二酸發生脫氫、脫羧反應，並和CoA結合，生成含高能硫鍵的4碳琥珀醯CoA，放出一個CO2，生成一個NADH+H+。 酮戊二酸脫氫酶（5）碳琥珀醯CoA脫去CoA和高能硫鍵，放出的能量用於驅動GTP(哺乳動物中)或ATP(植物和一些細菌中)的合成。琥珀醯輔酶A合成酶（6）琥珀酸脫氫生成延胡索酸，生成1分子FADH2，琥珀酸脫氫酶（7）延胡索酸和水化合而成蘋果酸。延胡索酸酶（8）蘋果酸氧化脫氫，生成草酸乙酸，生成1分子NADH+H+。蘋果酸脫氫酶

丙酮酸分子式：C3H4O3又稱2-氧代丙酸、α-酮基丙酸或乙醯基甲酸，為無色至淡黃色液體，呈醋酸香氣和愉快酸味，是最重要的α-氧代羧酸之一。丙酮酸不僅在生物能量代謝中具有十分重要的作用，而且是多種有用化合物的前體，因此，它在化工、製藥和農用化學品等工業及科學研究中有著廣泛的用途。

C3H4O3+2.5O2=3CO2+2H2O