一是給蘋果樹施肥的位置和深度。蘋果樹是深根果樹，比較大的側根不吸收養分，負責吸收養分的是處在地下，樹冠外延，大約40~60公分左右的毛鬚根。因此肥要施在樹冠垂直投影的外延，深度以40~50公分左右為宜。因為果樹吸收水肥的這些毛鬚根嘴巴，就大量分佈在這裡，只有把水肥送到果樹的口邊才便於蘋果樹吸收利用。

給蘋果樹施肥不能過淺，也不要撒在土壤表面上。因為蘋果樹的根系有一種趨水趨肥性，就是說哪裡有水有肥，蘋果樹的根系就往哪兒生長。如果施肥過淺的話，就會引導蘋果樹的根系向上生長，會導致樹根上浮或者外露，不利於蘋果樹生長和增強抗逆性，也易遭受凍害。

一般來說施肥時，應該稍微為深和遠一些比較好，可以引導果樹根系不斷向深遠處生長，能擴大根系吸收養分的範圍。再就是對於肥效發揮比較慢的長效有機肥或農家肥，應該進行深施，深度以40~50公分為宜；而生長季節追施的一般是速效肥，應該適當施淺點，以15~20公分就行了。

二是施肥的方式。對於那些還未掛果的幼樹，就應該採取環形施肥的方式，在栽植坑的外圍挖圓形溝施肥，以後隨著樹齡的增大、枝梢延伸而逐年擴挖，這樣既施了肥又深翻了土壤。而對於掛果的果樹，可以採取行間施肥方式，開挖單排或雙排溝施肥，或者開挖放射溝進行施肥。