首先跟以前一樣是選擇男主角或者女主角，等你選擇完主角性別以後，你的對手的性別將跟你的性別相反。當你起好主角的名字以後，你就可以進入芳園地區了。
首先，你會出現在天元鎮的一輛小貨車裡。這時候你得下車，當你下車以後，媽媽會給你一個任務，就是讓你上樓去把時鐘調整一下。調好時鐘後再下樓，媽媽會讓你去找博士。接著走到隔壁的房間裡，上樓後調查一個精靈球，這時候你的對手將會出現在那裡。與對手對話後走出房子，往上走離開天元鎮的時候，你會發現博士正被一隻針鼠追趕。這時博士讓你在旁邊的揹包裡選擇一隻PM參加戰鬥。你可以利用這些PM來挑戰敵人了。你需要注意的一點就是，對手的PM在屬性上都會剋制你的PM。
NO.001 草蜥蜴 草系
NO.004 小火雞 火系
NO.006 小水狗 水系
不出幾個回合以後，你就可以打敗針鼠。趕跑針鼠以後，博士會把你之前選擇的精靈送給你，並且給你下達了一個任務。任務的內容就是讓你去103號道路找他的孩子，這個孩子也是你的對手。打敗對手以後，再回到天元鎮的研究所，與博士對話後他會送你圖鑑，對手也會給你5個精靈球。接著離開研究所，媽媽還會送你跑步鞋。有了跑步鞋後，你就可以在前進的時候按住B鍵以2倍的速度奔跑了。
穿過102號道路就可以來到天元市了，先去上方的訓練館。別忘記這裡的館主是你的爸爸。在與館主對話的時候會出現一個綠頭髮男孩，他的名字叫做道夫。我們現在的任務就是幫助道夫抓感知獸。抓完感知獸後，爸爸會讓你收集4枚徽章後再來這裡挑戰。離開天元市，當你走到104號道路的時候，你會發現一間無人的屋子，繼續前進。走著走著，你會遇到天力公司的職員。他正在被一名小兵攔截了。現在我們要幫助這名職員擊敗小兵。擊敗小兵以後，你會獲得一個超級球。接著我們再往前走，走出森林，還是104號道路，我們可以在這裡的一間屋子裡取得肥波鯨噴壺。再往前面走，我們就可以抵達金水市。
下面介紹的是金水市訓練館的相關資料：
岩石系訓練館
NO.074 小拳石 12級
NO.299 磁石怪 15級
從訓練館走出來，會遇到剛才的職員與小兵。與他們對話後再往右走到116號道路。在116號道路的最右邊有一條隧道，隧道洞口老頭說他的小海鷗被水之團的人搶走了。進入洞口擊敗小兵和海鷗後，你會得到一個超級球，把你獲得的小海鷗還給老頭後就可以回金水市了。接著找到你剛才遇到的那個職員，他會帶你去見天力公司的BOSS。與BOSS對話後，你會得到一個導航機。另外，BOSS還讓你給一個正在山木鎮、叫代後的人送信。送完信之後與金水市下方的對手戰鬥。
回到天元森林下面的無人小屋，跟剛才的老頭對話。對話結束後他會送你到山木鎮。
[page]
山木鎮訓練館的資料：
格鬥系訓練館
NO.066 腕力 16級
NO.307 阿薩那恩 16級
NO.296 拳擊兔 19級
挑戰結束以後，我們再往西北方向走，走著走著你會看到一個山洞。進入山洞以後，與洞裡面的礦工對話，你就可以得到秘傳機05閃光。繼續往山洞裡面走，走到深處的時候你就可以找到代後，把任務物品信給，完成任務後你會得到招式機47鋼翼。接著回到天力公司BOSS那，與BOSS對話你就可以獲得學習裝置。得到學習裝置後再去找那個老頭，他會送你去卡依市。到了卡依市以後，你會發現有許多水之團的人在水族館門前。接著來到造船廠二樓與老伯對話，對話結束後你就可以進入水族館了。
110號道路上對手的資料如下：
小海鷗
無殼蝸牛
草蜥蜴 20級
擊敗以上這些對手後你就可以獲得探寶儀。接著來到銀葉市，與道館門口的對手戰鬥後即可進入。
道夫的資料：
感知獸 16級
以下是銀葉市訓練館的資料：
電系訓練館
NO.100 雷電球 20級
NO.309 疾電狗 20級
NO.082 三合一磁怪 22級
NO.310 電氣狗 24級
在精靈中心右邊的屋子裡有兩種腳踏車，分別是快速腳踏車和跳躍腳踏車兩種。這兩種腳踏車有不同的功能。然後我們可以到右下角的屋子裡可獲得秘傳機06碎巖。我們可以到左邊117號道路的飼養屋子裡，把精靈放到這裡生蛋。
繼續前行，我們來到了西達鎮。我們用碎巖將路上的岩石劈掉後就可以獲得秘傳機04怪力。接著回到銀葉市，往上走來到111號道路。在這裡的111號道路有競速塔，上方是沙漠地帶。我們現在還不能從這進去，接著往右走，一直往前走就可以到達哈吉鎮。
在哈吉鎮的左邊是114號道路，再往前走會到達流星瀑布。當你到達流星瀑布的時候，你會遇到水之團和熔岩團的人。與他們對話後，你會發現他們正在爭奪一顆化石。接著又回到了112號道路，在火之捷徑的旁邊有纜車。我們可以乘坐纜車到凹凸山的山頂。你可以擊敗熔岩團的首領來獲得化石回到哈吉鎮把化石交給流星瀑布的研究員。
熔岩團首領的相關資訊：
惡嘯狗 24級
火山駱駝 24級
超音蝠 24級
下山以後就可以到達飛音鎮。
飛音鎮訓練館的資料：
火系訓練館
NO.218 無殼蝸牛 24級
NO.322 沙漠駱駝 24級
NO.323 火山駱駝 26級
NO.324 火山烏龜 29級
在你走出訓練館的時候，你會遇到對手。與對手對話你就可以獲得一個躲避沙塵暴的道具。現在已經收集夠4枚徽章了，你可以回到天元市與爸爸戰鬥了。
天元市訓練館的相關資訊：
普通系訓練館
NO.327 圈圈兔 27級
NO.264 大針鼠 29級
NO.288 狂暴猴 27級
NO.289 大猩猩 31級
你可以輕而易舉的打敗爸爸，當你戰勝後，你會得到秘傳機03衝浪。與此同時，開船老頭也會回家。先到達銀葉市，然後使用衝浪來到118號道路。到達118號道路，你會遇到代後。再往前走就是119號道路了。
擊敗二樓BOSS以後，該氣象臺所在會送你一隻天氣小子。
水之團小頭目的相關資訊：
三色鯊魚 28級
惡嘯狗 28級
走出氣象臺，你會再次遇到對手。以下是對手的相關資訊：
無殼蝸牛 29級
荷葉童子 29級
草蜥蜴 31級
打倒對手後，你會得到秘傳機02飛天。接著繼續前進，你會到達日川市。
當你走到120號道路的橋上時，你會再次遇到代後，他回告訴你有一種透明的東西是隱身龍變的。另外，代後還會交給你一瓶令隱身龍現身的噴霧劑。這樣，你就可以輕而易舉的打敗前面的隱身龍了。
日川市訓練館的相關資訊：
飛行系訓練館
NO.333 彩雲雀 29級
NO.357 熱帶雷龍 29級
NO.279 海鷗 30級
NO.227 鋼鳥 31級
NO.334 大雲雀 33級
繼續往前面走，當你走到121號道路的時候，你會遇到熔岩團的人。接著你會發現水之團已經佔領了整個阿田市。你可以在阿田氏上方的百貨大樓門前與對手進行聯盟比賽前的最後一次比賽。
對手的相關資訊如下：
香蕉葉龍 31級
無殼蝸牛 32級
海鷗 32級
草蜥蜴 34級
當你勝利後，對手就灰溜溜的飛回家了。接著熔岩團大軍壓至落日山。我們的目標是打敗熔岩團的人。
首先跟以前一樣是選擇男主角或者女主角，等你選擇完主角性別以後，你的對手的性別將跟你的性別相反。當你起好主角的名字以後，你就可以進入芳園地區了。
首先，你會出現在天元鎮的一輛小貨車裡。這時候你得下車，當你下車以後，媽媽會給你一個任務，就是讓你上樓去把時鐘調整一下。調好時鐘後再下樓，媽媽會讓你去找博士。接著走到隔壁的房間裡，上樓後調查一個精靈球，這時候你的對手將會出現在那裡。與對手對話後走出房子，往上走離開天元鎮的時候，你會發現博士正被一隻針鼠追趕。這時博士讓你在旁邊的揹包裡選擇一隻PM參加戰鬥。你可以利用這些PM來挑戰敵人了。你需要注意的一點就是，對手的PM在屬性上都會剋制你的PM。
NO.001 草蜥蜴 草系
NO.004 小火雞 火系
NO.006 小水狗 水系
不出幾個回合以後，你就可以打敗針鼠。趕跑針鼠以後，博士會把你之前選擇的精靈送給你，並且給你下達了一個任務。任務的內容就是讓你去103號道路找他的孩子，這個孩子也是你的對手。打敗對手以後，再回到天元鎮的研究所，與博士對話後他會送你圖鑑，對手也會給你5個精靈球。接著離開研究所，媽媽還會送你跑步鞋。有了跑步鞋後，你就可以在前進的時候按住B鍵以2倍的速度奔跑了。
穿過102號道路就可以來到天元市了，先去上方的訓練館。別忘記這裡的館主是你的爸爸。在與館主對話的時候會出現一個綠頭髮男孩，他的名字叫做道夫。我們現在的任務就是幫助道夫抓感知獸。抓完感知獸後，爸爸會讓你收集4枚徽章後再來這裡挑戰。離開天元市，當你走到104號道路的時候，你會發現一間無人的屋子，繼續前進。走著走著，你會遇到天力公司的職員。他正在被一名小兵攔截了。現在我們要幫助這名職員擊敗小兵。擊敗小兵以後，你會獲得一個超級球。接著我們再往前走，走出森林，還是104號道路，我們可以在這裡的一間屋子裡取得肥波鯨噴壺。再往前面走，我們就可以抵達金水市。
下面介紹的是金水市訓練館的相關資料：
岩石系訓練館
NO.074 小拳石 12級
NO.074 小拳石 12級
NO.299 磁石怪 15級
從訓練館走出來，會遇到剛才的職員與小兵。與他們對話後再往右走到116號道路。在116號道路的最右邊有一條隧道，隧道洞口老頭說他的小海鷗被水之團的人搶走了。進入洞口擊敗小兵和海鷗後，你會得到一個超級球，把你獲得的小海鷗還給老頭後就可以回金水市了。接著找到你剛才遇到的那個職員，他會帶你去見天力公司的BOSS。與BOSS對話後，你會得到一個導航機。另外，BOSS還讓你給一個正在山木鎮、叫代後的人送信。送完信之後與金水市下方的對手戰鬥。
回到天元森林下面的無人小屋，跟剛才的老頭對話。對話結束後他會送你到山木鎮。
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山木鎮訓練館的資料：
格鬥系訓練館
NO.066 腕力 16級
NO.307 阿薩那恩 16級
NO.296 拳擊兔 19級
挑戰結束以後，我們再往西北方向走，走著走著你會看到一個山洞。進入山洞以後，與洞裡面的礦工對話，你就可以得到秘傳機05閃光。繼續往山洞裡面走，走到深處的時候你就可以找到代後，把任務物品信給，完成任務後你會得到招式機47鋼翼。接著回到天力公司BOSS那，與BOSS對話你就可以獲得學習裝置。得到學習裝置後再去找那個老頭，他會送你去卡依市。到了卡依市以後，你會發現有許多水之團的人在水族館門前。接著來到造船廠二樓與老伯對話，對話結束後你就可以進入水族館了。
110號道路上對手的資料如下：
小海鷗
無殼蝸牛
草蜥蜴 20級
擊敗以上這些對手後你就可以獲得探寶儀。接著來到銀葉市，與道館門口的對手戰鬥後即可進入。
道夫的資料：
感知獸 16級
以下是銀葉市訓練館的資料：
電系訓練館
NO.100 雷電球 20級
NO.309 疾電狗 20級
NO.082 三合一磁怪 22級
NO.310 電氣狗 24級
在精靈中心右邊的屋子裡有兩種腳踏車，分別是快速腳踏車和跳躍腳踏車兩種。這兩種腳踏車有不同的功能。然後我們可以到右下角的屋子裡可獲得秘傳機06碎巖。我們可以到左邊117號道路的飼養屋子裡，把精靈放到這裡生蛋。
繼續前行，我們來到了西達鎮。我們用碎巖將路上的岩石劈掉後就可以獲得秘傳機04怪力。接著回到銀葉市，往上走來到111號道路。在這裡的111號道路有競速塔，上方是沙漠地帶。我們現在還不能從這進去，接著往右走，一直往前走就可以到達哈吉鎮。
在哈吉鎮的左邊是114號道路，再往前走會到達流星瀑布。當你到達流星瀑布的時候，你會遇到水之團和熔岩團的人。與他們對話後，你會發現他們正在爭奪一顆化石。接著又回到了112號道路，在火之捷徑的旁邊有纜車。我們可以乘坐纜車到凹凸山的山頂。你可以擊敗熔岩團的首領來獲得化石回到哈吉鎮把化石交給流星瀑布的研究員。
熔岩團首領的相關資訊：
惡嘯狗 24級
火山駱駝 24級
超音蝠 24級
下山以後就可以到達飛音鎮。
飛音鎮訓練館的資料：
火系訓練館
NO.218 無殼蝸牛 24級
NO.322 沙漠駱駝 24級
NO.323 火山駱駝 26級
NO.324 火山烏龜 29級
在你走出訓練館的時候，你會遇到對手。與對手對話你就可以獲得一個躲避沙塵暴的道具。現在已經收集夠4枚徽章了，你可以回到天元市與爸爸戰鬥了。
天元市訓練館的相關資訊：
普通系訓練館
NO.327 圈圈兔 27級
NO.264 大針鼠 29級
NO.288 狂暴猴 27級
NO.289 大猩猩 31級
你可以輕而易舉的打敗爸爸，當你戰勝後，你會得到秘傳機03衝浪。與此同時，開船老頭也會回家。先到達銀葉市，然後使用衝浪來到118號道路。到達118號道路，你會遇到代後。再往前走就是119號道路了。
[page]
擊敗二樓BOSS以後，該氣象臺所在會送你一隻天氣小子。
水之團小頭目的相關資訊：
三色鯊魚 28級
惡嘯狗 28級
走出氣象臺，你會再次遇到對手。以下是對手的相關資訊：
無殼蝸牛 29級
荷葉童子 29級
草蜥蜴 31級
打倒對手後，你會得到秘傳機02飛天。接著繼續前進，你會到達日川市。
當你走到120號道路的橋上時，你會再次遇到代後，他回告訴你有一種透明的東西是隱身龍變的。另外，代後還會交給你一瓶令隱身龍現身的噴霧劑。這樣，你就可以輕而易舉的打敗前面的隱身龍了。
日川市訓練館的相關資訊：
飛行系訓練館
NO.333 彩雲雀 29級
NO.357 熱帶雷龍 29級
NO.279 海鷗 30級
NO.227 鋼鳥 31級
NO.334 大雲雀 33級
繼續往前面走，當你走到121號道路的時候，你會遇到熔岩團的人。接著你會發現水之團已經佔領了整個阿田市。你可以在阿田氏上方的百貨大樓門前與對手進行聯盟比賽前的最後一次比賽。
對手的相關資訊如下：
香蕉葉龍 31級
無殼蝸牛 32級
海鷗 32級
草蜥蜴 34級
當你勝利後，對手就灰溜溜的飛回家了。接著熔岩團大軍壓至落日山。我們的目標是打敗熔岩團的人。