一、飛逝的巨礁：1866年起，出現了一件大怪事。海洋中發現一個龐然大物，就像飛逝的巨礁，多艘航船莫名其妙的被撞裂了。公眾堅決要求把著頭怪物從海洋裡清除掉。
二、贊成與反對：對怪物主要有兩派看法，一派認為是一種力大無窮的怪物，另一派則認為是一艘動力強大的“海下船”。我（法國巴黎自然史博物館教授阿羅納克斯）認為，怪物是一種力量大得驚人的“獨角鯨”。美國海軍部組織了一艘名為亞伯拉罕.林肯號的快速驅逐艦，準備去清除“怪物”。我應邀隨行。
三、隨先生尊便：我的僕人孔塞伊不假思索的說：“隨先生尊便。”跟我一同上了以法拉格特為艦長的驅逐艦。驅逐艦從布魯克林碼頭揚帆起錨，向大西洋全速前進。
四、內德.蘭德：艦長和全體海員同仇敵愾，決心一定要捕獲獨角鯨。只有加拿大人捕鯨手內德.蘭德對獨角鯨的存在表示懷疑。
五、向冒險迎去：艦隻在太平洋上游弋。大家的眼睛睜得大大的，努力地觀察海面。三個月過去了，海員們開始洩氣了，開始懷疑自己這次搜尋行動的意義。半年後，海員們要求返航。艦長許諾最後搜尋三天，三天後如果還無結果就將回去。到了規定期限的最後時刻，一向無動於衷的內德.蘭德突然喊叫起來，他發現了怪物。
六、全速前進：林肯號企圖捕獲獨角鯨，而獨角鯨卻若無其事地同林肯號捉迷藏。經過一夜一天的追逐周旋，到第二天晚上，雙方形成對峙。當林肯號向獨角鯨發起進攻時，獨角鯨卻突然熄滅電光，向林肯號噴射大水。林肯號遭遇了滅頂之災。
七、不知其種屬的鯨魚：我被拋入海里，與孔塞伊在海中相依為命。正當筋疲力盡就要沉入海底時，被躲在獨角鯨背上的內德.蘭德拉出水面。內德說，這怪物不是鯨，是鋼製的。我這才斷定它是一艘潛水艇。我們在艇頂苟延殘喘。天亮時，艇蓋掀開，八個壯漢出來，把我們拖進艇裡去。
八、動中之動：我們三人被關進一間黑屋子。半小時後，突然眼前一亮，進來兩個人。我們用法語、英語、德語和拉丁文進行自我介紹，對方均無反應。他們走了，侍者送來食物，我們飽餐後就進入了夢鄉。
九、內德.蘭德的怒火：潛水艇浮出海面更換新鮮的空氣。三人仍被關在鐵屋子裡，內德怒氣沖天，他想逃跑，又想奪取這條艇。一個侍者進來時被他出其不意地打倒在地掐得半死。這時候，一個說法語的人出現了。
十、海洋人：講法語的就是這艘鸚鵡螺號潛水艇上的尼摩（意為“不存在的人”）艇長。他說第一次見面保持沉默是為了瞭解我們，其實那四種語言他都聽的懂。他要我們聽從他的命令，否則將置我們於死地。尼摩艇長說，他們的衣食用都取自海洋，他熱愛海洋，海洋中沒有爭鬥、廝殺和獨裁。
十一、鸚鵡螺號：尼摩艇長帶我們參觀“鸚鵡螺號”上有一萬兩千冊藏書的圖書室，給我抽用海帶製成的雪茄，觀賞他收集的標本，又看了他為我準備的雅緻的房間以及他自己住的簡陋的房間。
十二、一切都用電：尼摩艇長給我們介紹房間裡各種儀表的用途，如何開採海底礦藏，如何發電，如何提供空氣，又介紹一隻小艇的用途，還帶我參觀了廚房。
十三、幾組數字：尼摩艇長向我介紹潛水艇的概況、構造、動力、發光、建造過程等。
十四、黑潮：海底探險旅行正式開始。潛艇在海面以下五十米深處穿越黑水流。我和兩位同伴盡情觀賞形態美麗、活潑可愛的魚兒。
十六、漫步海底平原：我和孔塞伊穿上防水衣服隨尼摩艇長漫步海底平原，欣賞海洋奇物。
十七、海底森林：我們來到海底森林。仔細觀察海底生物。還在海底睡了幾個鐘頭。來到克雷斯波島的海底絕壁，遇到巨形海蜘蛛，打到一隻海獺，躲過了角鯊的侵襲。
十八、太平洋下四千米：潛艇在太平洋下穿行，令人大開眼界。一天，看到一條沉船，悽慘的海難情景令人驚悚。
十九、瓦尼可羅群島：尼摩艇長從瓦尼可羅群島海底遺物中揭開在十八世紀末兩艘法國探險船隻失蹤的真相。
二十、託雷斯海峽：潛艇經由地球上最危險的海峽——託雷斯海峽前往印度洋，中途觸礁擱淺。經艇長同意，我和兩位同伴坐小艇上格波羅阿爾島去。
二十一、陸上幾日：我和兩位夥伴一起上小島採摘野果、狩獵，捉到一隻被豆蔻汁給迷醉的極樂鳥。
二十二、尼摩艇長的閃電：土著的巴布亞人發現了我們，他們追趕到沙灘，後來還划來獨木舟圍住鸚鵡螺號，企圖向我們發起進攻。尼摩艇長將電通到艇外殼，土著人觸電後嚇得魂飛魄散退走了。鸚鵡螺號被漲起來的海潮托起，離開了珊瑚石床，時間正如艇長所預料的分毫不差。
二十三、強制性睡眠：潛艇在印度洋行駛。尼摩艇長對不同深度的海水溫度進行測量，發現水下一千米以下的海水是恆溫的。我們目睹了有趣的一幕：海面上磷光閃爍，把大海照得如同白晝，原來是一些小水母球發光造成的。有一天，尼摩艇長突然下令將我們關起來，並強制我們睡眠。
二十四、珊瑚王國：第二天，艇長帶我們來到五彩繽紛的珊瑚王國，把一位因傷而死的艇員安葬在珊瑚墓園裡。
二十五、印度洋：鸚鵡螺號在印度洋穿行，我們看到了基靈島，看到了“船蛸”，在孟加拉灣漂浮著無數的屍體，還看到了一望無垠的“牛奶海”。
二十六、尼摩艇長的新建議：艇長給我們介紹原始的採珠法，採珠人悲慘的生活，建議我們參觀錫蘭島的採珠場。
二十七、一顆價值千萬的珍珠：艇長帶我們觀看一顆大如椰子的珍珠。一個採珠人正辛苦地採珠，突然一頭大鯊魚向他發起進攻，艇長捨身相救，與巨鯊展開殊死搏鬥。正當艇長危在旦夕時，內德.蘭德一叉刺中鯊魚要害。艇長把採珠人救到小船上，並贈送一袋小珍珠。
二十八、紅海：鸚鵡螺號在紅海上劈波斬浪。尼摩艇長跟我介紹紅海得名的原因和他發現從紅海通往地中海的地下通道“阿拉伯隧道”的經過。
二十九、阿拉伯隧道：內德.蘭德在紅海上用捕鯨叉勇敢地擊殺龐大的儒艮。尼摩艇長親自指揮，潛水艇順利穿過蘇伊士地峽。
三十、希臘群島：尼摩艇長把大量的黃金贈送給一個潛水員。鸚鵡螺號來到桑多林島附近，我目睹了海底火山噴發的壯觀奇景。
三十一、地中海上的四十八小時：鸚鵡螺號在地中海底穿行，我看到許多的遇難船隻的殘骸靜臥在那裡，慘不忍睹。
三十二、維哥灣：潛艇正沿著葡萄牙海岸行駛，內德.蘭德做好了潛逃的準備，敦促我逃跑，我心裡很矛盾，很不安。潛艇在維哥灣停了下來，艇長給我講述一七0二年西班牙船隻被英國海軍戰敗沉沒的歷史，他命令艇員潛水搬取當年沉船上數不盡的金銀珍寶。
三十三、失蹤的大陸：潛艇背向歐洲駛去，離大陸越來越遠，我們失去了一次逃跑的機會。尼摩艇長帶我在夜間到三百米深的大西洋底去參觀柏拉圖筆下的大西洋城——亞特蘭蒂斯。
三十四、海底煤礦：潛艇來到一個已經熄滅了的火山中心取燃料，我和同伴出去遊覽了一通。
三十五、馬尾藻海：潛艇來到馬尾藻海。下潛到海底一萬六千米的深度竟安然無恙。
三十六、抹香鯨和長鬚鯨：鸚鵡螺號駛向南大西洋海域，海面上出現了一群長鬚鯨，捕鯨手內德.蘭德向艇長請求讓他去捕殺，卻被艇長勸住了。艇長說，人類不應該濫殺這種善良無害的動物。不一會兒，來了一大群長鬚鯨的天敵——抹香鯨，鸚鵡螺號為了保護長鬚鯨狠狠地衝殺抹香鯨。
三十七、大冰蓋：鸚鵡螺號開往終年積雪結冰的南極圈，衝撞大冰蓋，浮出水面。
三十八、南極：我和尼摩艇長登上南極大陸，觀察到南極特有的美麗景觀。
三十九、大事故還是小插曲：潛艇在駛離南極時，被一大塊倒下來的冰塊砸到了，潛艇一時找不到出路，陷入困境。
四十、缺氧：潛艇四周都圍著厚厚的冰牆。艇長鎮定自若地指揮大家輪班開鑿冰牆，噴射開水阻止新的結冰。艇內極度缺氧，但秩序井然。經過共同努力，潛艇終於衝出冰牆，衝破冰原，呼吸到了新鮮的空氣。
四十一、從合恩角到亞馬遜河：潛艇從大西洋往北，沿著南美洲的曲折海岸行駛，在亞馬遜河口，我們用印頸魚作餌來釣海龜。
四十二、章魚：潛艇來到留卡斯群島附近，突然圍上一群大章魚。章魚纏住螺旋槳，潛艇動彈不得。在艇頂平臺上，人和章魚展開了激烈的搏鬥。在生死關頭，尼摩艇長挺身而出救下了處於死亡邊沿的內德.蘭德。
四十四、北緯47度24分，西經17度28分：尼摩艇長潛入海底憑弔英勇不屈的復仇者號。
四十五、大屠殺：一艘戰艦向潛艇發起攻擊，經過幾番周旋，潛艇將戰艦撞沉，艇長獲得了一份復仇的快感。
四十六、尼摩艇長最後的話：我逃離潛艇前聽到他正在靜靜地懺悔；我們三人利用附在潛艇上的小艇逃跑，可恰在此時，潛艇被捲入了大旋流中，我們的小艇也難逃厄運。
四十七、尾聲：我和兩個同伴被羅佛丹群島的漁民救起。尼摩艇長及其鸚鵡螺號一起下落不明。
一、飛逝的巨礁：1866年起，出現了一件大怪事。海洋中發現一個龐然大物，就像飛逝的巨礁，多艘航船莫名其妙的被撞裂了。公眾堅決要求把著頭怪物從海洋裡清除掉。
二、贊成與反對：對怪物主要有兩派看法，一派認為是一種力大無窮的怪物，另一派則認為是一艘動力強大的“海下船”。我（法國巴黎自然史博物館教授阿羅納克斯）認為，怪物是一種力量大得驚人的“獨角鯨”。美國海軍部組織了一艘名為亞伯拉罕.林肯號的快速驅逐艦，準備去清除“怪物”。我應邀隨行。
三、隨先生尊便：我的僕人孔塞伊不假思索的說：“隨先生尊便。”跟我一同上了以法拉格特為艦長的驅逐艦。驅逐艦從布魯克林碼頭揚帆起錨，向大西洋全速前進。
四、內德.蘭德：艦長和全體海員同仇敵愾，決心一定要捕獲獨角鯨。只有加拿大人捕鯨手內德.蘭德對獨角鯨的存在表示懷疑。
五、向冒險迎去：艦隻在太平洋上游弋。大家的眼睛睜得大大的，努力地觀察海面。三個月過去了，海員們開始洩氣了，開始懷疑自己這次搜尋行動的意義。半年後，海員們要求返航。艦長許諾最後搜尋三天，三天後如果還無結果就將回去。到了規定期限的最後時刻，一向無動於衷的內德.蘭德突然喊叫起來，他發現了怪物。
六、全速前進：林肯號企圖捕獲獨角鯨，而獨角鯨卻若無其事地同林肯號捉迷藏。經過一夜一天的追逐周旋，到第二天晚上，雙方形成對峙。當林肯號向獨角鯨發起進攻時，獨角鯨卻突然熄滅電光，向林肯號噴射大水。林肯號遭遇了滅頂之災。
七、不知其種屬的鯨魚：我被拋入海里，與孔塞伊在海中相依為命。正當筋疲力盡就要沉入海底時，被躲在獨角鯨背上的內德.蘭德拉出水面。內德說，這怪物不是鯨，是鋼製的。我這才斷定它是一艘潛水艇。我們在艇頂苟延殘喘。天亮時，艇蓋掀開，八個壯漢出來，把我們拖進艇裡去。
八、動中之動：我們三人被關進一間黑屋子。半小時後，突然眼前一亮，進來兩個人。我們用法語、英語、德語和拉丁文進行自我介紹，對方均無反應。他們走了，侍者送來食物，我們飽餐後就進入了夢鄉。
九、內德.蘭德的怒火：潛水艇浮出海面更換新鮮的空氣。三人仍被關在鐵屋子裡，內德怒氣沖天，他想逃跑，又想奪取這條艇。一個侍者進來時被他出其不意地打倒在地掐得半死。這時候，一個說法語的人出現了。
十、海洋人：講法語的就是這艘鸚鵡螺號潛水艇上的尼摩（意為“不存在的人”）艇長。他說第一次見面保持沉默是為了瞭解我們，其實那四種語言他都聽的懂。他要我們聽從他的命令，否則將置我們於死地。尼摩艇長說，他們的衣食用都取自海洋，他熱愛海洋，海洋中沒有爭鬥、廝殺和獨裁。
十一、鸚鵡螺號：尼摩艇長帶我們參觀“鸚鵡螺號”上有一萬兩千冊藏書的圖書室，給我抽用海帶製成的雪茄，觀賞他收集的標本，又看了他為我準備的雅緻的房間以及他自己住的簡陋的房間。
十二、一切都用電：尼摩艇長給我們介紹房間裡各種儀表的用途，如何開採海底礦藏，如何發電，如何提供空氣，又介紹一隻小艇的用途，還帶我參觀了廚房。
十三、幾組數字：尼摩艇長向我介紹潛水艇的概況、構造、動力、發光、建造過程等。
十四、黑潮：海底探險旅行正式開始。潛艇在海面以下五十米深處穿越黑水流。我和兩位同伴盡情觀賞形態美麗、活潑可愛的魚兒。
十六、漫步海底平原：我和孔塞伊穿上防水衣服隨尼摩艇長漫步海底平原，欣賞海洋奇物。
十七、海底森林：我們來到海底森林。仔細觀察海底生物。還在海底睡了幾個鐘頭。來到克雷斯波島的海底絕壁，遇到巨形海蜘蛛，打到一隻海獺，躲過了角鯊的侵襲。
十八、太平洋下四千米：潛艇在太平洋下穿行，令人大開眼界。一天，看到一條沉船，悽慘的海難情景令人驚悚。
十九、瓦尼可羅群島：尼摩艇長從瓦尼可羅群島海底遺物中揭開在十八世紀末兩艘法國探險船隻失蹤的真相。
二十、託雷斯海峽：潛艇經由地球上最危險的海峽——託雷斯海峽前往印度洋，中途觸礁擱淺。經艇長同意，我和兩位同伴坐小艇上格波羅阿爾島去。
二十一、陸上幾日：我和兩位夥伴一起上小島採摘野果、狩獵，捉到一隻被豆蔻汁給迷醉的極樂鳥。
二十二、尼摩艇長的閃電：土著的巴布亞人發現了我們，他們追趕到沙灘，後來還划來獨木舟圍住鸚鵡螺號，企圖向我們發起進攻。尼摩艇長將電通到艇外殼，土著人觸電後嚇得魂飛魄散退走了。鸚鵡螺號被漲起來的海潮托起，離開了珊瑚石床，時間正如艇長所預料的分毫不差。
二十三、強制性睡眠：潛艇在印度洋行駛。尼摩艇長對不同深度的海水溫度進行測量，發現水下一千米以下的海水是恆溫的。我們目睹了有趣的一幕：海面上磷光閃爍，把大海照得如同白晝，原來是一些小水母球發光造成的。有一天，尼摩艇長突然下令將我們關起來，並強制我們睡眠。
二十四、珊瑚王國：第二天，艇長帶我們來到五彩繽紛的珊瑚王國，把一位因傷而死的艇員安葬在珊瑚墓園裡。
二十五、印度洋：鸚鵡螺號在印度洋穿行，我們看到了基靈島，看到了“船蛸”，在孟加拉灣漂浮著無數的屍體，還看到了一望無垠的“牛奶海”。
二十六、尼摩艇長的新建議：艇長給我們介紹原始的採珠法，採珠人悲慘的生活，建議我們參觀錫蘭島的採珠場。
二十七、一顆價值千萬的珍珠：艇長帶我們觀看一顆大如椰子的珍珠。一個採珠人正辛苦地採珠，突然一頭大鯊魚向他發起進攻，艇長捨身相救，與巨鯊展開殊死搏鬥。正當艇長危在旦夕時，內德.蘭德一叉刺中鯊魚要害。艇長把採珠人救到小船上，並贈送一袋小珍珠。
二十八、紅海：鸚鵡螺號在紅海上劈波斬浪。尼摩艇長跟我介紹紅海得名的原因和他發現從紅海通往地中海的地下通道“阿拉伯隧道”的經過。
二十九、阿拉伯隧道：內德.蘭德在紅海上用捕鯨叉勇敢地擊殺龐大的儒艮。尼摩艇長親自指揮，潛水艇順利穿過蘇伊士地峽。
三十、希臘群島：尼摩艇長把大量的黃金贈送給一個潛水員。鸚鵡螺號來到桑多林島附近，我目睹了海底火山噴發的壯觀奇景。
三十一、地中海上的四十八小時：鸚鵡螺號在地中海底穿行，我看到許多的遇難船隻的殘骸靜臥在那裡，慘不忍睹。
三十二、維哥灣：潛艇正沿著葡萄牙海岸行駛，內德.蘭德做好了潛逃的準備，敦促我逃跑，我心裡很矛盾，很不安。潛艇在維哥灣停了下來，艇長給我講述一七0二年西班牙船隻被英國海軍戰敗沉沒的歷史，他命令艇員潛水搬取當年沉船上數不盡的金銀珍寶。
三十三、失蹤的大陸：潛艇背向歐洲駛去，離大陸越來越遠，我們失去了一次逃跑的機會。尼摩艇長帶我在夜間到三百米深的大西洋底去參觀柏拉圖筆下的大西洋城——亞特蘭蒂斯。
三十四、海底煤礦：潛艇來到一個已經熄滅了的火山中心取燃料，我和同伴出去遊覽了一通。
三十五、馬尾藻海：潛艇來到馬尾藻海。下潛到海底一萬六千米的深度竟安然無恙。
三十六、抹香鯨和長鬚鯨：鸚鵡螺號駛向南大西洋海域，海面上出現了一群長鬚鯨，捕鯨手內德.蘭德向艇長請求讓他去捕殺，卻被艇長勸住了。艇長說，人類不應該濫殺這種善良無害的動物。不一會兒，來了一大群長鬚鯨的天敵——抹香鯨，鸚鵡螺號為了保護長鬚鯨狠狠地衝殺抹香鯨。
三十七、大冰蓋：鸚鵡螺號開往終年積雪結冰的南極圈，衝撞大冰蓋，浮出水面。
三十八、南極：我和尼摩艇長登上南極大陸，觀察到南極特有的美麗景觀。
三十九、大事故還是小插曲：潛艇在駛離南極時，被一大塊倒下來的冰塊砸到了，潛艇一時找不到出路，陷入困境。
四十、缺氧：潛艇四周都圍著厚厚的冰牆。艇長鎮定自若地指揮大家輪班開鑿冰牆，噴射開水阻止新的結冰。艇內極度缺氧，但秩序井然。經過共同努力，潛艇終於衝出冰牆，衝破冰原，呼吸到了新鮮的空氣。
四十一、從合恩角到亞馬遜河：潛艇從大西洋往北，沿著南美洲的曲折海岸行駛，在亞馬遜河口，我們用印頸魚作餌來釣海龜。
四十二、章魚：潛艇來到留卡斯群島附近，突然圍上一群大章魚。章魚纏住螺旋槳，潛艇動彈不得。在艇頂平臺上，人和章魚展開了激烈的搏鬥。在生死關頭，尼摩艇長挺身而出救下了處於死亡邊沿的內德.蘭德。
四十四、北緯47度24分，西經17度28分：尼摩艇長潛入海底憑弔英勇不屈的復仇者號。
四十五、大屠殺：一艘戰艦向潛艇發起攻擊，經過幾番周旋，潛艇將戰艦撞沉，艇長獲得了一份復仇的快感。
四十六、尼摩艇長最後的話：我逃離潛艇前聽到他正在靜靜地懺悔；我們三人利用附在潛艇上的小艇逃跑，可恰在此時，潛艇被捲入了大旋流中，我們的小艇也難逃厄運。
四十七、尾聲：我和兩個同伴被羅佛丹群島的漁民救起。尼摩艇長及其鸚鵡螺號一起下落不明。