1)消耗材料少，成本低。2)損耗少效益高。由於銅線和矽鋼片用量減少，在同樣的電流密度及磁通密度時，自耦變壓器的銅損和鐵損都比雙繞組變壓器減少，因此效益較高。3)便於運輸和安裝。因為它比同容量的雙繞組變壓器重量輕，尺寸小，佔地面積小。4)提高了變壓器的極限製造容量。變壓器的極限製造容量一般受運輸條件的限制，在相同運輸條件下，自耦變壓器容量可比雙繞組變壓器製造大一些。

當然，自耦變壓器也存在下述缺點：

1)使電力系統短路電流增加。由於自耦變壓器中性點必須直接接地，所以將使系統的單相短路電流大為增加，有時甚至超過三相短路電流。

2)造成調壓上的一些困難。自耦變壓器可能的調壓方式有兩種，第一種是在自耦變壓器繞組內部裝設帶負荷改變分頭位置的調壓裝置;第二種是在高壓與中壓線路上裝設附加變壓器。而這兩種方法不僅是製造上存在困難，不經濟，且在執行中也有缺點(如影響第三繞組的電壓)，解決得都不夠理想。

3)使繞組的過電壓保護複雜。由於高、中壓繞組的自耦聯絡，當任一側落入一個波幅與該繞組絕緣水平相適應的雷電衝擊波時，另一側出現的過電壓衝擊的波幅則可能超出該絕緣水平。為了避免這種現象的發生，必須在高、中壓兩側出線端都裝一組閥型避雷器。

儘管自耦變壓器存在著一定的缺點，但各國還是非常重視自耦變壓器的應用，主要是與電力系統向大容量高電壓的發展是分不開的，隨著容量增大，電壓升高，自耦變壓器的優點就更為顯著。