漢末黃巾起義，對於漢王朝來說，是一次對於統治根基的巨大的動搖，如同秦末的陳勝吳廣揭竿起義一樣，黃巾軍並沒有直接推翻劉姓皇室的寶座，但是引發的後果直接導致了朝廷統治力的極大削弱。

由於黃巾軍的勢如破竹，漢朝政府的腐敗無能，導致漢靈帝只得命各州府郡自募兵勇守衛，這就導致了日後雖黃巾雖然平定，但是出現了大批擁兵自重的軍閥梟雄，是的漢朝王室對於國家的統治力大大削弱，彼時“三國”中出現的袁紹 袁術 董卓 孫堅等人紛紛大肆招兵買馬，割據城池，雖口中仍尊漢室為主，但早已是稱霸一方的霸主，更有甚者，董卓廢舊帝立新君，更有意取漢室而代之，引得天下諸侯群起而攻之，隨後董卓身死，引得群雄逐鹿中原，中國陷入了“大亂鬥”的軍閥混戰時代；經過無數次的戰爭與互相吞併，最終形成了為人們津津樂道傳誦至今的“三國演義”。也由於這種常年不休的軍閥混戰，漢室統治力幾乎被削弱殆盡，最終末代皇帝漢獻帝退位“禪讓”於曹丕，結束了漢朝四百零七年的統治。

黃巾起義還是中國歷史上首次以宗教為組織形式的武裝起義，對後世朝代更迭產生了深遠的影響，使得後是許多農民起義紛紛假以宗教的名義與形式，如方臘的“摩尼教”，洪秀全的“拜上帝會”等等。

黃巾起義雖然規模浩大，但是從發起到被平定不到一年的時間，要說它有什麼深遠影響，僅僅從時間跨度上說，比陳勝、黃巢、李自成、太平天國都有不如，不過這卻一場宗教起義，不像紅巾軍崇奉彌勒、太平天國崇奉耶穌，黃巾起義崇奉的是中國自生自長的宗教。

一、黃巾起義對東漢的影響。雖然以往評價中總說，黃巾起義沉重打擊的東漢的腐朽統治，但從實際史實來看，發動時雖然有三十多萬人，波及河北、南陽等大片州縣，但其被討滅不過一年時間，要說起義本身對東漢有什麼深刻影響，還不如從其他方面來看這個問題。

首先，黃巾起義本身並沒有破壞東漢的統治結構和軍事力量，從戰爭上說，它對東漢的影響並不大，並非因為黃巾起義爆發，東漢就必然會滅亡。東漢末年，三國分裂的局勢，本身不是黃巾起義造成的，而是一系列的動亂和起義後，漢靈帝把地方軍政權力直接交給地方刺史或州牧造成的。董卓入京，廢殺少帝，更加速了這種分裂。

其二、黃巾起義對東漢的深遠影響在其起義前已經形成，這就是宗教力量的傳播。黃巾起義被鎮壓後，黃巾餘部仍遍佈各州縣，不光是因為黃巾軍本身沒被鎮壓乾淨，而是因為黃巾所提倡的太平道思維繼續影響世人，凡是有其信仰的起義軍皆被視同為黃巾。其中強大的白波軍、黑山軍，曹操收編的青州軍中都有黃巾信仰成分。正因為如此，這些力量和各割據勢力糾結一起，最終成為了蕩滅東漢的力量。

其三、黃巾起義卻是直接造成了一些三華人物的崛起。譬如曹操，在鎮壓黃巾時任騎都尉，後來又成為西園八校尉之一。董卓等人也是如此。但這是必然，在鎮壓黃巾中崛起的即便不是曹操、董卓等人，也會有其他人。一個有趣的事實是，對鎮壓黃巾立下最大功勞的兩人，皇甫嵩和朱雋，後來都沒有成為叱吒三國的人物。

二、黃巾起義對後世的深遠影響

道教初起，因為黃巾起義，本來聲勢最大的太平道被鎮壓，五斗米道取代其地位興盛於後世，而後屢屢有五斗米道徒的起義，一直延續到隋唐統一前。再之後，龍虎山道統對中國歷史產生了深遠影響。簡單一提。

縱觀各個王朝的大規模的農民起義，其實有一個很有意思但有規律的現象，農民起義無論多麼風起雲湧，前期如何席捲州縣，後期總是為各大勢力或者軍閥所收割，從而摘取了勝利的果實。這和農民階級的侷限性所約束，也和儒家思想的君臣之道相違背。因此一旦農民起義爆發之時，也總是總是伴隨著民間團練和地方豪強崛起。

黃巾起義的爆發，雖然一定程度上打擊了東漢政權，但是也為地方豪強，門閥士族的崛起提供了機會，因此黃巾起義並非滅亡東漢的原因，但在其中起到了加速和促進的作用。

如果一定要說黃巾起義對後世的作用，那就微乎其微。但是萬事都有蝴蝶效應，如果說黃巾起義促進了天下分裂，使得漢室垂危，爭奪人才和穩定天下成為了各路軍閥的首要任務，但兩漢時期的察舉制，到了東漢末年，已為門閥士族所操縱和利用，他們左右了當時的鄉閭輿論，使察舉滋生了種種腐敗的現象，與要求參與政治的中小地主及其知識分子產生了尖銳的矛盾，在如何選官的問題上鬥爭激烈。

曹操死後，曹丕在採納陳群的創議後，於是九品中正製成了魏晉南北朝時期主要的選官制度。但當時察舉尚未完全廢除。九品中正制就是在這種背景形勢下產生的。九品中正制的實行一方面解決了選拔官吏無標準的問題，使當時一時間吏治澄清。另一方面緩解了中央政府與世家大族的緊張關係，促成魏晉實現全國的統一打下了堅實的基礎。

黃巾起義前夕，他們已經形成了一種大規模的組織活動，有一套相當嚴密的佈置計劃，表現出了勞動群眾的智慧和力量，知道去進行有組織有計劃的準備和佈置。但他們只達成了推翻漢朝地主階級的任務，沒能開創出新的前途，不只是他們的根本弱點，找不到前進的方向，也因歷史條件所限。

地主階級對起義的農民，軟的利用、欺騙、分化、收買、陷害等手段使他們自相殘殺，比強硬的鎮壓、屠殺還要陰險百倍。這種手段劉秀比劉邦厲害，曹操又比劉秀厲害。農民的鬥爭辦法進步了，地主階級的反動辦法也越來越精了。

最直觀的影響就是百姓遭難，何進藉機對宦官發難，又召董卓入京，拉開了三國帷幕。

並不一定是沒飯吃才去造反，在底層百姓面前有幾個選擇：依附豪族成為佃農，自己經商，成為流民，造反。寧為太平犬，不做亂離人，誰又願意投身叛亂呢？但宗教就不用想那麼多了，太平道造成的流民反而更多。

“中平元年，大方馬元義等先收荊、楊數萬人，期會發於鄴”-----《後漢書·皇甫嵩傳》

百姓不是爭相加入黃巾軍的，狂熱或者矇昧的信徒裹挾著眾多百姓，在戰亂中百姓永遠是受害群體。可以看到不少黃巾的惡跡，被稱作“蛾賊”，燒殺搶掠都做過，還有殺人祀天這種操作，百姓自然流離失所，至於女子，呂榮、“巴三貞”的遭遇也能說明問題。

“所在燔燒官府，劫略聚邑，州郡失據，長吏多逃亡”----《後漢書·皇甫嵩傳》

“小民相向跪拜趨信。荊、揚尤甚。乃棄財產，流沈道路，死者無數”----《搜神記·卷六》

“青、徐士庶避黃巾之難歸虞者百餘萬口，皆收視溫恤，為安立生業，流民皆忘其遷徙。”----《後漢書·劉虞傳》

“呂榮者，吳郡許昇之妻也。昇為賊所害，榮貞固自守，黃巾賊陳寶欲幹穢之，榮執節不聽，寶遂殺榮。”----《烈女後傳》

“巴三貞者，閬中馬眇新妻義，西充國王玄憤妻姬，皆閬中人也；閬中趙蔓君妻華，西充華人也。姬早失夫，介然守操。中平五年，黃巾餘類延益州，賊帥趙蕃據閬中城，構迫衣冠，令人婦女為質，義、姬、華等隨北入城。後賊類爭勢，攻破閬中，時人或死或奔，家室相失，義、姬、華隨類出城走。傅聞後賊，或構略婦女，於是三人自度窮迫，恐不免於據逼，乃相與自沉水而死。鄉黨聞之，莫不感傷，號曰"三貞"。”----《益部耆舊傳》

曹操在征討青州黃巾時，還收到了黃巾軍的勸降書，“閣下當初在濟南時，也做毀壞神壇的事，這說明你的‘道’和我們太平道是相似的，怎麼現在就迷惑了呢？”這已經是初平三年（192年）的事了，距張角舉事已時隔多年，而黃巾軍還能保持這樣的思想，宗教的威力可見一斑。

“賊乃移書太祖曰：’昔在濟南，毀壞神壇，其道乃與中黃太乙同，似若知道，今更迷惑。漢行已盡，黃家當立。天之大運，非君才力所能存也。’”----《三國志·武帝紀》

張角領導的黃金起義軍失敗的原因，大致有以下幾點：一、黃巾軍領袖開始利用宗教來組織農民群眾，這比以前有所進步，但道教徒內部階級成分是比較複雜的，起義的準備工作雖然做的比較細緻，但最後還是在教徒中出現了叛徒。馬元義在洛陽犧牲，舉義日期倉促提前，這對此後起義的成敗有一定影響。二、起義除了主力在河北發動以外，還開闢了南陽和穎川，汝南兩個戰場，這三個戰場本來可以相互配合，但實際上卻缺乏聯絡，以致官軍採用各個擊破的戰術，很快就次第被鎮壓下去了。三、農民軍人數雖然達數十萬，戰鬥意志也很旺盛，但平日缺乏訓練，裝備不良，尤其缺少有經驗的軍事指揮人員，在戰略戰術上都不能化被動為主動。而漢政府卻動員可以動員的武裝力量，包括地主武裝在內，抓住農民軍的弱點集中攻擊，反而暫時得手了。

黃金起義最後失敗了，全國各地人民再度受到殘酷的剝削和壓迫。他們在過去已經被榨取的幾乎一無所有了，他們被丟擲農村，失去了土地，到處流亡。流民問題構成漢代最大的社會危機，這個問題不解決，農民起義還會繼續發生。

黃巾起義首先達到了摧毀東漢王朝的最終目的。儘管在靈帝以後，漢獻帝還充當了有名無實的傀儡皇帝，但東漢王朝的大權實際上已經落到曹操的手裡。

伴隨著這個腐朽的東漢王朝而存在的外戚也好，宦官集團也好，在黃金起義之後不久，也都被清洗出政治舞臺去了。只有士大夫官僚和地方豪強，他們在農民戰爭的結局中得到利益，他們中間有很多人本來是被宦官集團排擠在政權之外的。黃巾起義後東漢政權為了要集中統治階級力量來鎮壓農民運動，不得不下令解除"黨錮"，同時還啟用一些"黨人"來鎮壓農民起義。從這些士夫階級的本身利益來講，為了要共同對付更可怕的敵人起見，也是迫切要求參加政府並組織地主武裝來鎮壓農民起義的。何況他們還想在鎮壓農民起義的過程中，出任地方州牧、郡守，積蓄力量形成一種割據的勢力，以便等待時機進而分割漢室的江山。